分子网络功能注释系统BioKnowMolNet
12页1、分子网络功能注释系统 BioKnow-MolNet一、产品概述您在生物分子功能注释中遇到过这样的情况吗? l 为了对一个基因进行全面的注释,需要到不同的数据库中去各个查询l 同一生物分子在不同的数据库中都有各自的ID标示,ID不通用l 很多公开的生物资源数据库不支持批量的注释l 在线的系统服务过忙,等待时间比较长 生物分子网络功能注释系统(Molecule Network Annotation System,MolNet)是一个对高通量生物实验数据提供全面生物学功能注释的分析平台系统。系统可处理多个物种的高通量实验数据,如测序数据、探针数据、药物数据、疾病数据,具有全面、快速、准确、直观等特点。将目前多种生物信息学公共数据库中的注释相关信息相整合,集成了Genbank、SwissProt等通用序列数据库,以及Gene Ontology、KEGG、BioCarta、mirBase、EPD、HPRD、 MIND、OMIM、HAPMAP、DrugBank等功能数据库,提供包括基因、蛋白、功能、表达、蛋白相互作用、调控等生物学信息,有助于用户了解表达基因之间的相互关系。图 用户登陆系统首页二、
2、应用范围大规模实验数据的生物学注释;各类生物分子的关联功能统计分析;知名生物学数据库的整合查询;三、产品功能一、图 产品功能图3.1支持多种数据库 可靠的注释信息数据解释系统整合多种生物学通用数据库,其中,KEGG、Biocarta数据库被公认为是当前收集pathway信息最全面,注释质量最高的数据库;Gene Ontology数据库对基因的功能分类及基因间关系进行标准化定义,注释信息质量可靠;mirBase数据库为收集miRNA信息最完整的数据库;EPD数据库为当前收集真核启动子数据的权威数据库;TRANSFAC数据库为收集高质量的转录因子信息的数据库之一。 同时整合及挖掘各个数据库的注释信息对用户提交的查询数据,可同时提供全方位的生物学功能注释,包括基因、蛋白、功能、表达、调控、信号传导、启动子、转录因子、SNP及基因变异可能导致的疾病等生物学信息,有助于用户深入挖掘和理解实验数据的生物学意义。图 整合数据库关系图表 整合数据库列表序号数据库名称数据库介绍1GeneBankNCBI下的核酸序列数据库2EMBLEBI下的核酸序列数据库3Swiss-Prot蛋白质序列数据库4KEGG
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