生物信息学课程设计实验报告—典型的生物信息学分析
15页1、 搜索感兴趣的基因找出自己想要的基因片段 找出FASTA格式的基因序列,复制下来,保存在文本文档中水稻瘤矮病发生与危害 水稻瘤矮病于1976年在广东湛江地区发现,局部县市危害严重,近年在两广陆续有此病危害的报告,且有逐年加重的趋势,我国广东茂名地区曾大面积发生危害,近年在福建福州以南的一些县零星发生。症状识别 水稻瘤矮病是由电光叶蝉、黑尾叶蝉和二点黑尾叶蝉传播的一种病毒病。病苗明显矮缩,叶色深绿,叶背和叶鞘长有淡黄绿色近球形小瘤状突起,有时沿叶脉连成长 条,叶尖卷转,个别新叶的一边叶缘灰白坏死,形成2-3个缺刻。病株根细弱,抽穗迟、细小、空粒多。 水稻瘤矮病感病植株病原及发病条件 为水稻瘤矮病毒 Rice gall dwarf Virus (RGDV)。病毒粒体球状,直径65nm,由单一粒体组分和十二个片段的双链RNA组成。此病可由电光叶蝉、二条黑尾叶蝉;二点黑尾叶蝉、黑尾叶蝉和 马来亚黑尾叶蝉以持久性方式传播,也能通过二条黑尾叶蝉的卵传给下一代。国内以电光叶蝉和二点黑尾叶蝉为有效介体。二点黑尾叶蝉亦可经卵传播。防治方法:1)治虫防病,力争将传毒媒介昆虫电光叶蝉、二条黑尾叶蝉;二点黑尾
2、叶蝉、黑尾叶蝉和马来亚黑尾叶蝉消灭在传毒前。杀虫药剂可用25%喹硫磷或40%乐果1000-1500倍稀释液,或菊酯类农药5000倍稀释液喷雾。2)及早毁除病株,或踩入泥土,或集中烧毁,以防止蔓延。3)如插后不久发病,还可立即补苗。4)稻株大胎期用“九二0”纯品50000倍稀释液喷雾,使病株提早抽穗,可减轻为害。5)每亩用10%叶蝉散可湿性粉剂200克;或每亩用25%速灭威可湿性粉剂150克;每亩用50%杀螟松乳油 + 40%稻温净乳油各50毫升均加水50千克喷雾 搜索对应的蛋白质序列 Proparam软件分析蛋白质理化性质从分析结果可知:RGDV p8 各个氨基酸所占的比重,如上图。分子质量为47422da,氨基酸数目为426,正负电荷残基总数30/30,分子式为C2126H3316O623S15 ,在M-1 cm-1单位在280海里的水里测量的消光系数为48610和48360,脂肪指数为92.68,组氨酸His (H)最少为 0.5%,丝氨酸含量最多Ser (S) 9.9%。疏水性分析:氨基酸的疏水性=各种氨基酸的疏水性甘氨酸的疏水性疏水性氨基酸在蛋白质的内部,由于其疏水性的像相互作
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