计算机在化学中的应用03chemdraw-06-高级绘制技巧.pdf

1 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 6.1 俗名的使用俗名的使用 6.2 多中心结构多中心结构 6.3 结构展开与调整结构展开与调整 6.4 检查化学结构信息检查化学结构信息 6.5 不定结构连接不定结构连接 2 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 俗名式俗名式 6.1 俗名的使用俗名的使用 Et Me NHOH CH2CH3 CH3 NHOH 普通式普通式 3 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 俗名列表对话框俗名列表对话框 4 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 注意：注意： 1) 俗名只是一种代号俗名只是一种代号 2) 用自动调整命令标记结构左面的官能团时， 俗名字母位置发生变化 用自动调整命令标记结构左面的官能团时， 俗名字母位置发生变化 水平翻转水平翻转 5 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 定义俗名定义俗名 1) 建立一个结构，其中含有将定义为俗名的官能团；建立一个结构，其中含有将定义为俗名的官能团； 2) 选择该官能团，其中必须有一个原子，它的一些键 被选择，其余的键没被选择，表示官能团的连接键； 选择该官能团，其中必须有一个原子，它的一些键 被选择，其余的键没被选择，表示官能团的连接键； 可定义俗名可定义俗名 不可定义俗名不可定义俗名 连接键连接键 无连接键无连接键 6 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 3) 从从Structure菜单中，选择菜单中，选择Define Nickname, 出现出现Define Nickname对话框对话框 4) 给俗名输入一个简短的名称给俗名输入一个简短的名称 5) OK后，俗名被定义，即可用此俗名标记原子后，俗名被定义，即可用此俗名标记原子 7 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 定义俗名定义俗名输入俗名输入俗名 8 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 注意注意 1) 如果定义的俗名符号与元素符号相同，将被警告 元素符号被俗名符号取代 如果定义的俗名符号与元素符号相同，将被警告 元素符号被俗名符号取代 2) 要恢复元素的定义，从要恢复元素的定义，从File菜单中选择菜单中选择 ListNicknames，可删除俗名定义，可删除俗名定义 9 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 查看俗名查看俗名 10 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 2) 使用快捷键使用快捷键 =，前提是编辑区必须有一个 未被选择的键。

，前提是编辑区必须有一个 未被选择的键 光标移至单键末端； 使用快捷键 光标移至单键末端； 使用快捷键 = 11 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 选择俗名选择俗名 确定确定 12 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 6.2 多中心结构多中心结构 Fe 多中心键多中心键 多中心键多中心键 中心原子中心原子 多中心节点多中心节点 多中心节点 二茂铁 多中心节点 二茂铁 —绘制络合物结构—绘制络合物结构 13 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 14 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 警示标志的去除与添加警示标志的去除与添加 警示标志警示标志 显示显示(去除去除)警示警示 15 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 分别添加多中心节点分别添加多中心节点 16 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 选择实键工具，在上下两个 中心节点画出上下两根单键 选择实键工具，在上下两个 中心节点画出上下两根单键 在其中一根单键上标记在其中一根单键上标记Fe 17 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 另一根键与另一根键与 Fe没有连接没有连接 选择键的末端， 拉动与 选择键的末端， 拉动与Fe连接连接 调整对齐调整对齐 18 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 键的前后次序错误键的前后次序错误键的前后次序正确键的前后次序正确 19 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 结构展开结构展开 6.3 结构展开与调整结构展开与调整 20 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 展开标记展开标记结构调整结构调整 21 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 结构的符号形式结构展开结构调整结构的符号形式结构展开结构调整 22 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 结构调整结构调整 23 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 结构整理的要点：结构整理的要点： 1) 目的是通过规范键长和键角生成一个更具美感 的结构绘制图 目的是通过规范键长和键角生成一个更具美感 的结构绘制图 2) 适合的键长由适合的键长由Drawing Setting对话框中的对话框中的Fixed Length确定确定 3) 一个特定环只有在所有组成键都被选择时才会被 重新绘制 一个特定环只有在所有组成键都被选择时才会被 重新绘制 4) 整理对某些环系统不合适整理对某些环系统不合适(交叉双键、三键、 多连接环、大环等 交叉双键、三键、 多连接环、大环等) 24 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 5) 多连接原子标记和不定连接点不能被整理多连接原子标记和不定连接点不能被整理 6) 多中心键不能被整理多中心键不能被整理 6) 结构的旋转尽可能在以键角为结构的旋转尽可能在以键角为15度的倍数下进行度的倍数下进行 8) 整理会保留原立体化学特点，特别是楔键和切割键整理会保留原立体化学特点，特别是楔键和切割键 25 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 6.4 检查化学结构信息检查化学结构信息 结构分析结构分析 26 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 分析结果窗口分析结果窗口 分子式分子式 精确质量精确质量 分子量分子量 质谱分析质谱分析 元素分析元素分析 结果粘贴结果粘贴 两位小数两位小数 质谱图质谱图 27 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 结果粘贴结果粘贴 28 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 化合物命名化合物命名 将结构转化成名称将结构转化成名称 29 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 将名称转化成结构将名称转化成结构 30 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 1HNMR预测 预测 1HNMR位移 位移 31 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 1HNMR预测结果 预测结果 32 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 1HNMR预测结果 预测结果(ChemDraw8.0及以上版本及以上版本) 33 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 预测结果预测结果 Protocol of the H-1 NMR Prediction: Node Shift Base + Inc. Comment (ppm rel. to TMS) CH2 3.12 1.37 methylene 0.63 1 alpha -C=C 1.12 1 alpha -C(=O)-C CH2 3.71 1.37 methylene 1.22 1 alpha -1:C*C*C*C*C*C*1 1.12 1 alpha -C(=O)-C CH 7.06 7.26 1-benzene -0.20 1 -C CH 7.14 7.26 1-benzene -0.12 1 -C CH 7.07 7.26 1-benzene -0.19 1 -C CH 7.14 7.26 1-benzene -0.12 1 -C CH 7.06 7.26 1-benzene -0.20 1 -C CH3 3.76 0.86 methyl 2.90 1 alpha -OC(=O)-C=C H 5.97 5.25 1-ethylene 0.80 1 -C(=O)O-R gem -0.08 1 -CC=O cis H 7.12 5.25 1-ethylene 1.18 1 -C(=O)O-R cis 0.691 -CC=O gem 34 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 13CNMR预测 预测 13CNMR位移 位移 35 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 13CNMR预测结果 预测结果 36 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 部分预测结果部分预测结果 37 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 6.5 不定结构连接不定结构连接 不定结构：化学组成相同而结构不同的异构体不定结构：化学组成相同而结构不同的异构体 38 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 不定连接点不定连接点 39 第六部分 高级绘制技巧第六部分 高级绘制技巧 定位定位 Alt + 按动按动 。