PubMed检索方法——怎么用 - 北京大学医学图书馆
94页1、翁蕾鸣 北京大学医学图书馆 信息咨询部 文摘型数据库 PubMed 检索方法与技巧主要内容PubMed简简介是什么?PubMed特色服务务能干什么?PubMed检检索方法怎么用?其他辅辅助功能p创建机构:美国国家医学图书馆 下设的美国 生物技术信息中心(NCBI)1996年1月开始向全球开放p特色:免费、收录广、内容全、检索途径多 、检索体系完备、 文摘库,部分文献还可在 网上直接免费获 得全文。phttp:/pubmed.govPubMed简简介是什么?NCBI (National Center for Biotechnology Information,美国国立生物技术术信息中心)目前国际上几个重要分子生物信息网站之一成立的原因:已故的参议院议员Claude Pepper发现 计算信息处理方法对生物医学研究的重要性1988年11月4日成立是National Institutes of Health(NIH 美国国立卫生 研究院)底下的National Library of Medicine(NLM 美国国立医学图书馆 )的部门之一NIH目前是全世界最大的生物医学研究单位。 PubM
2、ed简简介是什么?NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为生物数据库库生物信息工具PubMed简简介是什么?生物数据库库永久数据的大的组织体结合计算机软件执行更新、查询与存取数据 的功能。容易取得信息并且只取得回答特殊生物问题 的信息Entrez: NCBI的数据库搜寻与存取系统, 可用来获取单一数据库或许多数据库的整合 数据。目前,NCBI提供的公开(Open Access)数 据库包括如下:PubMed简简介是什么?PubMed简简介是什么?NCBI目前提供的生物信息资源主要分 为生物数据库生物信息工具PubMed简简介是什么?Entrez一个整合的访问序列,定位,分类和结构数据的搜索和检 索系统。整合的数据库包括核酸序列,蛋白序列,大分子结构,全 基因组,和通过PubMed检索的MEDLINE。可以检索相关的序列,结构和参考文献。BLAST序列相似搜索程序,还可作为鉴别 基因和遗传特点的手段 。在小于15秒的时间内对整个DNA数据库执行序列搜索。附加软软件工具开放阅读框寻觅器(ORF Finder),电子PCR,序列提 交工具Sequin和BankIt。所有的NCBI数据库和软件
3、工具可 以从HTTP或FTP来获得。PubMed简简介是什么?Entrez可以检索的数据库:Books 出版社提供之数字生医图书 与医生参考书籍数据库Cancer Chromosomes 美国国立癌症研究所的Mitelman Database of Chromosome Aberrations in Cancer数据库里已经整合好的cytogenetic、临 床与文献相关数据Conserved Domain Database(CDD),蛋白质功能区块保留序列数据库3D Domains,蛋白质功能区块立体结构数据Gene,包含许多物种的基因数据库Genome,包含超过800种物种的基因组数据库GENSAT,小鼠中枢神经系统基因表现图谱GEO Datasets,基因表现实验 与生物芯片数值结 果数据GEO Profiles,基因表现图谱HomoloGene,同源基因批注数据库Journals,期刊文献(包含PubMed)MeSH,医学主题词 数据库NCBI Web Site,所有NCBI网页NLM Catalog,美国国立医学图书馆馆 藏书目、期刊、视听数据目录Nucleotide seq
4、uence database,核酸序列数据库(包含GenBank、RefSeq 和PDB等三大序列数据库)PubMed简简介是什么?Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM),人类遗传 疾病相关文献 数据库PopSet,族群演化分析相关研究资料Protein sequence database,蛋白质序列数据库(包含Swiss-Prot、PIR 、PRF、PDB等数据库与从GenBank、RefSeq核酸序列转译 之蛋白质 序列资料)PubChem BioAssay,化学成分之生物活性筛选资 料PubChem Compound,小分子化学物质结 构PubChem Substance,具生物活性之化学物质筛选 数据PubMed,科学文献报导 数据库PubMed Central,科学文献数字全文数据库Site Search,可搜寻NCBI的网页与FTPSNP,单点核酸多样性数据库(dbSNP)Structure,分子模型数据(MMDB) Taxonomy,以核酸或蛋白质为 基础的分类学信息UniGene,人类unique基因序列数据库UniSTS,
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