HLA-B27检测参考课件
18页1、PCR SSP检测HLA B27 一 实验目的掌握HLA基因分型的原理 学习PCR SSP基因分型方法 二 实验原理编码HLA的基因具有高度的多态性 每一个基因座位上有众多的复等位基因 而每一个等位基因都有其各自的DNA序列 因此可用相应的序列特异性引物 sequencespecificprimers SSP 进行扩增 通过控制PCR反应条件 特异性引物仅扩增与其相应的等位基因 而不扩增其他的等位基因 1 实验步骤 PCR扩增 琼脂糖凝胶电泳 抽提DNA 2 PCR扩增的基本原理 模板DNA的变性 热变性 模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离 模板DNA与引物的退火 复性 模板DNA经加热变性成单链后 温度降至55 左右 引物与模板DNA单链的互补序列配对结合 引物的延伸 DNA模板 引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下 以dNTP为反应原料 靶序列为模板 按碱基配对与半保留复制原理 合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链重复循环变性 退火 延伸三过程 2 3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍 3 PCR扩增体系 模版DNA上游引物下游引物dNTP 原料 缓冲体
2、系 各种离子与水 耐热的DNA聚合酶 4 PolymorphismintheMHCVariation 1 atasinglegeneticlocusinapopulationofindividualsEachpolymorphicvariantiscalledanalleleInthehumanpopulation over1 200MHCalleleshavebeenidentified MHCgenesarethemostpolymorphicknown 5 Polymorphicresiduesarelocatedintheantigen bindinggroove Variationinaminoacidsequenceschangestheshapeofthegroove 6 SchematicdiagramofclassIandclassIIMHCgenes mRNAtranscripts andproteinmolecules 7 EveryHLAallelehasitsownuniquesequences 8 Specificsequenceprimer SSP isd
3、esignedtobindtotheallelicsequencescomplementarily 9 SequencespecificprimerisusedtotypeHLAallelewithPCR 10 SequencespecificprimerisusedtotypeHLAallelewithPCR 11 三 实验材料和方法1 血样 0 2mlEDTA抗凝血2 红细胞裂解液3 白细胞裂解液4 PCR混合液PCRbufferHLA B27SSPTaqdNTPinternalpositivereferenceprimers 12 HLA B27检测操作流程 一 DNA的提取1 取1mlRBC裂解液入血样管中混匀 裂解RBC 2 离心4000rpm 2min 3 重复步骤1 2两次 最后用棉签吸干管壁液体 4 取100ulWBC裂解液入上述WBC管中混匀 5 将WBC管于60oC水浴消化20min 6 取出WBC管再于100oC 3 5min 灭活蛋白酶K 7 离心10000rpm 2min 上清即为富含DNA的PCR模板 13 二 PCR扩增1 吸2ul模板DNA入装有PCR混合液的小管中 注意不要加到石蜡油层 2 将小管置于PCR仪内进行扩增 需80min 12 23 预变性 94oC2min变性 94oC12sec复性 62 1min延伸 72 30sec变性 94oC12sec复性 58oC50sec延伸 72oC30sec37oC10sec HLA B27扩增程序 14 三 电泳检测吸PCR产物10ul加到2 琼脂糖凝胶孔内 将琼脂糖凝胶板置电泳槽内电泳160V 20min后取出 观察结果 15 四 结果观察 16 SpecificbandscanbeseenwithHLA B27 samples 17 HLA分型概述 方法比较血清学分型细胞学分型基因分型 应用移植配型疾病相关性研究法医学 18
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