泛素化蛋白检测方法.docx

泛素化蛋白检测方法泛素化蛋白检测方法•蛋白质泛素化简介蛋白质泛素化修饰过程在人体免疫系统调节过程中起到了关键性的作用 与磷酸化修饰过程一样，泛素化修饰过程也是一种可逆的共价修饰过程，它能 够调节被修饰蛋白的稳定性、功能活性状态以及细胞内定位等情况泛素蛋白是一个由76个氨基酸残基组成的非常保守的多肽，它能在E1、 E2、E3酶等一系列酶促反应催化下与细胞内靶蛋白上的一个或多个赖氨酸残基 发生共价连接泛素蛋白本身也含有7个赖氨酸残基，因此它们之间也可以通 过这些位点互相连接，形成多泛素蛋白链（polyubiquitin chain）目前研究显示， 如果多泛素蛋白链与被修饰蛋白上的第48位赖氨酸残基相连，会介导靶蛋白进 入蛋白酶体而被降解；如果与被修饰蛋白上其它位点，比如第63位赖氨酸残基 相连，则靶蛋白可以发挥信号通路功能而不会被降解与磷酸化修饰途径一样，泛素化修饰途径也是可逆的，即可以通过去泛素 化酶（现）将泛素蛋白修饰物去除掉靶蛋白经泛素化途径修饰之后，连接 在靶蛋白上的泛素蛋白单体或多聚体可以被各种泛素蛋白结合结构域（UBD） 所识别和结合人类蛋白质组中含有两种E1酶、50种E2酶、600种E3酶、 90种DUB酶和20种UBD，这说明泛素修饰途径在细胞调控中起到了多么重要 的作用。

E3酶是泛素修饰途径中决定底物特异性的关键酶，它可以分为两大类， 即含有HECT结构域的E3酶和其它含有RING结构域或RING样结构域（比 如U-box或PHD结构域）的E3酶这两种E3酶都在免疫调控过程中起到了 关键性的作用•蛋白质泛素化的检测方法研究蛋白质的泛素化首先需要明确的三个基本点：哪些蛋白发生了泛素化; 发生了泛素化的蛋白质，具体是哪个位点的赖氨酸残基发生了泛素化；进行定 量明确了上述几点后，进一步需要弄清楚的是，我们感兴趣的泛素化蛋白， 是如何发生泛素化的，影响这一泛素化过程的关键分子是什么？或者说这一过程中的E3酶是什么？然后需要研究的是，这一蛋白质发生泛素化之后可以产生那些分子效应？ 对下游的信号通路有什么影响？研究上述内容的实验方法和实验流程：方法一： western blot and strip通过WB检测所有发生泛素化的蛋白条带，拍照后，将膜strip然后 与特定蛋白的抗体和特定泛素化位点的抗体反应，显色拍照通过阳 性条带的对比来初步判断某一特定蛋白的特定位点发生了泛素化具 体实验流程附后】方法二： western blot and immunoprecipitations通过免疫共沉淀方法将某一特定蛋白以及与其结合的蛋白分离出来。

分离出来的蛋白再进行SDS电泳和western blot分析具体实验流程 附后】这一方法可以明确具体哪个蛋白的哪个赖氨酸残基发生了泛素 化修饰方法三：in vitro ubiquitination assay将要研究的目的基因转染293细胞，使其大量表达24h后提取并分 离目的蛋白在体外反应buffer中将我们要研究的蛋白A （被泛素化 的那个蛋白）与 UBE1，UbeH13-Uev 1 a heterodimer complex， HA-ubiquitin以及我们要研究的蛋白B （引起蛋白A泛素化的蛋白）， 共同进行孵育将孵育后的产物进行IP和WB分析具体实验流程 附后】这一方法可以明确引起哪个蛋白是引起某蛋白发生泛素化修饰 的E3连接酶方法四：in vitro ubiquitin-binding assay将我们要研究的蛋白（被泛素化的蛋白）基因转染293细胞，大量表 达后提纯或者直接提取内源性蛋白在体外与K63- or K48-linked ubiquitin chain petides孵育，然后通过SDS电泳并用泛素化抗体进行检测这一方法可以明确要研究的蛋白哪个赖氨酸残基容易发生泛素 化。

方法一：WB strip实验流程提取组织/细|使用总泛素化抗体检测所有发生了泛素化的蛋白Strippi用特定蛋 用UbMerge如果总的泛素化蛋白的条，以。