融合蛋白柔性linker的选择（参考资料）.doc

蛋白融合Linker的设计与选择 接头序列(Linker)设计是基因融合技术能否成功的关键技术之一即通过一段适当的核苷酸序列将不同的目的基因连接起来, 使其在适当的生物体内表达成为一条单一的肽链, 其中起连接作用的氨基酸称为Linker[1]融合蛋白中的两种成分能否分别形成正确的空间结构、 更好的发挥生物学活性, 与连接融合蛋白中两种成分的接头序列密切相关重组生成的融合蛋白要求插入融合蛋白中的linker不能影响目的蛋白各自的功能因此, Linker序列的设计和选择对融合基因的构建至关重要 针对Linker序列的设计和选择己有诸多相关的研究[2]目前的研究主要有两种, 即螺旋形式的Linker肽如[A(EAAAK)nA]和低疏水性、 低电荷效应的氨基酸组成的接头, 以后者应用较广泛这种低疏水性、 低电荷效应的氨基酸组成的多肽接头能够充分伸展以分开两种融合的组分, 使之能在互不干扰的情况下充分折叠成各自的天然构象Ryoichi等[3]在两种不同功能的融合蛋白之间插入了不同类型的linker序列, 包括可形成螺旋状的不同长度的肽链、 柔性linker以及葡萄糖球菌蛋白A(PA)结果发现螺旋状的linker同柔性linker及PA一样, 可以有效的将融合蛋白的两个结构域分开, 甚至可增强融合蛋白的功能。

Linker的长度是融合基因构建的又一个重要的因素如果Linker 的长度过长, 则使融合蛋白对蛋白酶比较敏感, 导致活性融合蛋白在生产过程中的产量下降; 应用较短的Linker, 可以克服重组蛋白酶分解的问题, 但可使两个融合分子相距太近导致蛋白功能的丧失Linker的长度不应小于3.5 nm , 这是由于相邻肽键的距离为0.38 nm, 因此连接肽至少应包含10个氨基酸目前最为常用的是Huston设计合成的(GGGGS)3序列研究发现, 连接肽为(Gly4Ser)3的融合蛋白表现出较高的复性效率这可能是(Gly4Ser)3连接肽较长且柔软, 在复性时能够降低融合蛋白的两组份间的空间位阻, 从而更有利于融合蛋白各个结构域的正确折叠所以, Linker 的长度不能过长也不能过短 Linker的选择, 还应考虑Linker内部的氨基酸序列, 研究发现, Linker组成相同但序列不同时, 构建的融合蛋白的稳定性存在显著差异; 编码Linker的核苷酸组成, 调整编码Linker的核苷酸组成, 虽不改变原接头Linker 的氨基酸序列, 但融合蛋白的表达存在显著差异Linker序列中有太多的α螺旋和β角结构会限制融合蛋白的伸缩性, 进而影响融合蛋白的生物学活性。

总之, Linker的选择不是一成不变的, 而要根据融合蛋白分子的大小和特性来决定细胞因子是由免疫细胞和某些非免疫细胞经刺激而合成、 分泌的一大类多功能、 高活性的生物物质它在介导机体多种免疫反应及对各类免疫活性细胞的分化、 发育和活化中起着十分重要的作用细胞因子融合蛋白(cytokine fusion protein)技术是当今免疫学研究的一个热点方向该方法是基于这些细胞因子具有相同或相关的功能活性而各自作用靶点不同, 利用基因工程技术将两种或多种细胞因子融合在一起, 其融合基因表达产物既具有其组成因子独特的生物学活性或使其某些活性显著提高, 还可能会通过生物学活性的互补及协同效应发挥出较单一细胞因子简单配伍所不具备的复合生物学功能, 甚至还可能会产生一些新的结构及生物学功能, 这种新型的人工蛋白具有极高的应用价值和良好的发展前景早在1986年Seno等用含EcoR I的12个核苷酸(4肽)CCGGAATTCATG为接头, 将IFNγ和IL2片段加以连接, 结果发现产生的融合蛋白具有IFNγ与IL2的双重活性迄今为止, 国内外已相继报道了多种有价值的细胞因子融合蛋白现就细胞因子融合蛋白技术的原则、 构建类型、 应用现状以及发展前景做一简要概述。

　　1 细胞因子蛋白融合技术　　1.1 蛋白融合的构建原则 基因工程构建细胞因子融合蛋白须满足以下几个条件: (1)各融合分子的目的DNA片段置于同一套调控序列(包括启动子、 增强子、 核糖体结合序列、 终止子等)的控制之下2)融合分子间须以富含疏水性氨基酸的接头Linker连接, 同时也要考虑接头序列的长度和核苷酸、 氨基酸的组成、 排列顺序等因素如融合蛋白内部接头的不同, 可导致融合蛋白各部分化学结构的改变, 而影响到各融合分子的空间构象, 导致其生物学活性差异所以, 设计肽链之间的接头时, 要尽可能不影响两端蛋白的自然折叠, 使各融合成分互不干扰3)为了保证融合蛋白的生物学活性, 还需考虑构成融合蛋白各成份本身的特性及其相互作用机制如肿瘤坏死因子(TNF)和α干扰素(IFNα)在抑制肿瘤细胞、 增强抗病毒活性等方面有协同作用有学者构建了TNF和IFNα的融合蛋白, 但发现该融合蛋白的抗病毒和抗肿瘤活性与单独应用TNF和IFNα相比, 抗病毒活性降低24倍, 抗肿瘤活性降低15倍, 与构建融合蛋白的初衷相背分析原因, 可能是这两种细胞因子的理化性质差异较大, IFNα活性稳定, 而TNF活性极易丧失, 其融合蛋白在一定程度上影响了彼此的活性。

　　1.2 蛋白融合Linker的设计与选择 接头序列(Linker)设计是基因融合技术能否成功的关键技术之一即通过一段适当的核苷酸序列将不同的目的基因连接起来, 使其在适当的生物体内表达成为一条单一的肽链, 其中起连接作用的氨基酸称为Linker[1]融合蛋白中的两种成分能否分别形成正确的空间结构、 更好的发挥生物学活性, 与连接融合蛋白中两种成分的接头序列密切相关重组生成的融合蛋白要求插入融合蛋白中的linker不能影响目的蛋白各自的功能因此, Linker序列的设计和选择对融合基因的构建至关重要　　针对Linker序列的设计和选择己有诸多相关的研究[2]目前的研究主要有两种, 即螺旋形式的Linker肽如[A(EAAAK)nA]和低疏水性、 低电荷效应的氨基酸组成的接头, 以后者应用较广泛这种低疏水性、 低电荷效应的氨基酸组成的多肽接头能够充分伸展以分开两种融合的组分, 使之能在互不干扰的情况下充分折叠成各自的天然构象Ryoichi等[3]在两种不同功能的融合蛋白之间插入了不同类型的linker序列, 包括可形成螺旋状的不同长度的肽链、 柔性linker以及葡萄糖球菌蛋白A(PA)。

结果发现螺旋状的linker同柔性linker及PA一样, 可以有效的将融合蛋白的两个结构域分开, 甚至可增强融合蛋白的功能Linker的长度是融合基因构建的又一个重要的因素如果Linker 的长度过长, 则使融合蛋白对蛋白酶比较敏感, 导致活性融合蛋白在生产过程中的产量下降; 应用较短的Linker, 可以克服重组蛋白酶分解的问题, 但可使两个融合分子相距太近导致蛋白功能的丧失Linker的长度不应小于3.5 nm , 这是由于相邻肽键的距离为0.38 nm, 因此连接肽至少应包含10个氨基酸目前最为常用的是Huston设计合成的(GGGGS)3序列研究发现, 连接肽为(Gly4Ser)3的融合蛋白表现出较高的复性效率这可能是(Gly4Ser)3连接肽较长且柔软, 在复性时能够降低融合蛋白的两组份间的空间位阻, 从而更有利于融合蛋白各个结构域的正确折叠所以, Linker 的长度不能过长也不能过短　　Linker的选择, 还应考虑Linker内部的氨基酸序列, 研究发现, Linker组成相同但序列不同时, 构建的融合蛋白的稳定性存在显著差异; 编码Linker的核苷酸组成, 调整编码Linker的核苷酸组成, 虽不改变原接头Linker 的氨基酸序列, 但融合蛋白的表达存在显著差异。

Linker序列中有太多的α螺旋和β角结构会限制融合蛋白的伸缩性, 进而影响融合蛋白的生物学活性总之, Linker的选择不是一成不变的, 而要根据融合蛋白分子的大小和特性来决定　　2 细胞因子融合方式及其应用　　根据细胞因子融合分子的不同, 可把细胞因子融合蛋白大致分成以下几类:　　2.1 不同或相同细胞因子的融合蛋白 细胞因子具有多功能性和通用性, 其作用的靶点各有不同利用细胞因子的这一特点, 可以通过基因融合技术创制出更佳的细胞因子融合蛋白, 其融合基因表达产物很可能表现出双因子简单配伍所没有的复合功能, 而且有可能会增强各个组份间的协同作用　　IL3和GMCSF均为造血刺激因子, 它们对不同发育阶段的造血干细胞及祖细胞均具有促增殖和分化的作用, 且共用受体β链鉴于两者功能互补, Curtis等于1991年构建并报道了第一个由不同细胞因子组成的融合蛋白人GMCSF/IL3和IL3/GMCSF融合蛋白, 分别称为PlXY321和PIXY344为确保其各自的天然构象, 在GMCSF与 IL3两者之间均引入了一段疏水氨基酸序列, 从而保证其与受体的结合体外受体结合实验证明, PIXY321与只表达IL3受体的JM1细胞株或只表达GMCSF的HL60细胞株结合时其亲和力比单体略高, 说明该融合蛋白可经IL3、 GMCSF结构域与其各自的受体结合。

同时, PIXY321对AML193细胞株的增殖作用及刺激骨髓集落的形成都明显高于单独使用IL3、 GMCSF或IL3加GMCSF的作用, 其作用可提高5～10倍　　IL2、 IL6是两个具有多种免疫调节活性的细胞因子1992年Fernad等构建了两个人IL2/IL6融合基因, 目的在于构建表达一种具有双重功能的免疫调节因子, 实验表明融合蛋白与野生型IL2的活性一致, 较IL6活性中度下降出现此结果的原因可能是由于局部构象的改变或者是IL2与IL6之间的相互作用干扰所致体外进一步研究表明, 该融合蛋白既可诱导T、 B细胞表达IL2R和IL6R, 并且还可作为分子桥梁促进和稳定T、 B细胞间的相互作用国内的赵春华等也构建和高效表达了具有促进细胞集落形成、 促进LAK的增殖作用的IL2/IL6融合蛋白将两种相同的细胞因子融合在一起也可以起到明显的生物学功能马大龙等构建了人双体IL6、 双体IL3融合蛋白, 研究表明双体IL6与单体IL6在生物学活性上差别不大, 但双体IL3对人骨髓细胞的集落刺激作用明显高于单体IL3的作用　　IL7是T、 B淋巴细胞成熟分化过程中重要的细胞因子, 可以增强成熟T细胞的增殖及其功能, 并有促进CTL增殖、 分化并加强其杀伤活性, 刺激LAK细胞活性的能力。

Lai等[4]用一段柔性接头将IL7和人肝细胞生长因子β片段( hepatocyte growth factor beta2 chain, HGF beta)连接, 结果发现融合蛋白能选择性的高效刺激B祖细胞系的增殖　　胰岛素样生长因子(IGF)常与其他生长因子一起发挥协同作用, 是最好的二联细胞因子融合蛋白的备选因子IGF II可刺激多种组织中细胞的增殖或分化将IGF II与一段信号肽以及胰岛素样的昆虫激素bomyxin的N端序列融合表达, 便可得到分泌形式的具有生物活性的BOMIGFDifalco等制备了一种BOMIGF和IL3的融合蛋白, 体外试验中它可刺激正常外周血细胞中的骨髓干细胞集落形成, 体内试验结果亦显示该融合蛋白能动员具有高度增殖活性的骨髓干细胞进人外周血, 进而定居至脾脏而发挥造血功能　　2.2 细胞因子与其受体的融合蛋白 细胞因子与其受体结合时, 可促进其与其他相关分子的结合, 进而提高其生物学活性的发挥　　IL6在肝细胞的增殖中起着增强作用IL6和IL6Ra (gp80)的结合使其易于和另一个受体IL6Rβ(gp130)结。