病理学实习课课件：图像分析系统应用方法.ppt

图像分析系统应用方法, 进入图像分析系统, 图像分析的步骤, 数据统计分析, 常用细胞图像分析方法举例, 常用测量参数的定义和选择,从WINDOWS系统直接进入分析系统,从报告系统进入分析系统,图像分析的设备,图像采集时应注意： 要求测量光学参数时，为保证背底光强度一致，显微镜光源亮度和物镜倍率一经确定就不可随意改变，保证每帧图像均处于相同照明条件之下（必要时可通过测量背景灰度的方式保证照明条件一致）；为保持每帧图像的原始状态，应关闭摄像头或数码相机上的自动白平衡和自动增益控制图像采集时应注意： 仅要求测量几何参数时，物镜倍率一经确定, 建议不要随意改变，否则在测量时需注意及时改变几何定标 图像上被测对象应与背景有一定的反差，否则将影响测量的质量和效率单击此按钮建立一个新病历在此框内填写病理号或送检人员的姓名其它框可以不填写建立数据库,此处显示病理号框内的内容单击此按钮可开始采集图像采集图像,采集图像,选择适当的显微镜物镜、照明亮度和适当的视野，调整好焦点后，鼠标在图像显示区域内单击左键则存储当前图像；单击右键则退出摄像状态图像由系统自动命名存储，前几位数字在建立新病理号的时候已经给出，后3位以升序序号自动排列。

此时须手工记录图像序号与样品的对应关系可在此处调整采集图像的效果，并将调整的结果保存以备以后直接调用点击此处根据采集图像时所用物镜放大倍数选择如果不是表中所列放大倍数，则应根据实际标尺，选择重新设置进行设置几何定标,物镜10倍时拍摄的标准刻度,在此准备设置测量窗口设置测量窗口,在此选择测量窗口类型，然后按确认设置测量窗口,在测量窗口的8个节点处可改变测量窗口的大小设置完成后只需将鼠标在窗口外任意处点击一下即可结束设置设置测量窗口,按此键可查看状态信息查看状态信息,常用测量参数的定义和选择,光学参数,场参数,几何参数,几何参数： 面积、周长、等效直径等反映被测对象的大小 圆形度、椭圆度、形状因子等反映被测对象的形状 光学参数： 灰度、平均光度反映被测对象的颜色深浅 场参数： 面密度、数密度反映被测对象在视野范围内的多少,几何参数： 面积 封闭曲线内所有象素点所代表的单位面积的和 周长 封闭曲线上所有象素点所代表的单位长度的和,光学参数： 灰度,黑,白,光学参数： 吸光度,场参数： 面密度（AA） 体密度（VV） 数密度（NA） ,各个视野内所有被测目标面积之和,各个视野内所有被测目标个数之和,测量窗口的面积视野的个数,测量窗口的面积视野的个数,常用细胞图像分析方法举例, DNA测量, 免疫组化测量, 核仁测量, 细胞测量, 其它图像测量,细胞测量的流程图,取图像,滤波,分割（二值化）,手动测量、自动测量,自动测量？,画测量,是,否,结束？,结束,是,否,删除,打开旧病历,连/断,鼠标点击此按钮，打开一个旧病历。

打开旧病历,一般情况下，框内仅显示最近建立的病历可选择检索方式查找现在，我们选中29号病历，然后鼠标点击“确认”,打开旧病历,点击此按钮可进行画测量打开旧病历,点击此按钮可进行全屏分割分割,全屏分割方法之一：鼠标点击此按钮可自动找门限分割,全屏分割方法之二：鼠标点击此按钮可手动找门限光标变形为右下带方框的十字，用此框套住尚未染绿的部分，按鼠标左键即可进一步染色或者分别改变RGB三原色门限，鼠标右键改变下限（黑线）位置，左键改变上限（白线）位置也可直接分别改变RGB三原色的门限值分割,如果全屏分割完成，单击“确认”,光标在蓝条区域内，按住鼠标左键可移动此界面，以便观察被遮挡的图像分别显示同一帧图像分割前后的状态，以便比较分割,单击此按钮可对分割后的图像作中值滤波作用是滤除分割时产生的噪声点滤波,选择删除，单击此按钮可将分割后的图像中不满足条件的被测对象同时删除单击此按钮可对分割后的图像作手工删除删除,在此选择条件,单击此按钮可通过下方二图作出比较在此改变待保留的被测对象的范围面积的上限值尽可能大一些；圆度的上限值为1（最圆）它们的下限值可以通过点击左下图中某一被测对象而直接得到单击此按钮确认。

删除,手工删除方法之一：直接用鼠标左键点击需删除的被测对象,手工删除方法之二：用鼠标在需删除的被测对象外画一圈，光标置于圈内（外），按鼠标右键，则删除圈内（外）所有被测对象此按钮为凹下状态删除,按住鼠标左（右）键，将笔形的光标在相连的被测对象两端画一条线段，则将它们断开（连接）相邻而（不）相连的被测对象颜色（不）相同此按钮为凹下状态最后，单击此按钮终止操作，被测对象将恢复为单一颜色连/断,自动测量 ：单击此按钮，自下而上自动将所有分割后的图像目标一一测量手动测量：此按钮为凹下状态时，将光标指向待测目标，并单击左键测量,光标围绕待测目标画一圈即可测得一个目标画测量：此按钮为凹下状态测量,鼠标左键单击此按钮，以图像文件名升序读取下一帧图像取图像,DNA测量的流程图,取图像,滤波,分割（二值化）,手动测量、自动测量,自动测量？,是,否,结束？,结束,是,否,连/断；删除,淋巴细胞？,是,否,“淋”键凸起,“淋”键凹下,画测量,打开旧病历,测量淋巴细胞,此按钮凹下时，可测量淋巴细胞测量肿瘤细胞,此按钮凸起时，可测量肿瘤细胞取图像,滤波,免疫组化测量的流程图,分割（二值化）,手动测量、自动测量,自动测量？,选择类型,是,否,结束？,结束,是,否,连/断,画测量,打开旧病历,删除,改变当前类只需单击某一色块。

以后所有操作均仅仅针对当前类免疫组化测量,免疫组化测量,如需改变某些参数设置，单击参数设置选择当前类免疫组化测量,在此改变当前组（第几类）,在此改变共有几组（最多5类）,选择显示方式,取图像,滤波,胞核核仁测量的流程图,分割（二值化）,手动测量、自动测量,自动测量？,是,否,结束？,结束,是,否,连/断,画测量,打开旧病历,选择核或仁,删除,选择核仁，对核仁进行分割选择仁，其它相关操作仅对核仁有效胞核核仁测量,选择核，对核进行分割选择核，其它相关操作仅对核有效胞核核仁测量,其它图像的测量,测量前应注意： 根据实际尺寸定标 不适宜测量光学参数 提高图像的反差,用摄像机直接拍摄的样品,用扫描仪直接扫描的样品,荧光显微镜下拍摄的样品,胶片相机拍摄的电泳条带,电镜照片,数据统计分析, 利用MS Excel 进行数据统计分析, 利用图像分析系统自带数据分析工具进行统计分析,单击此处，观察统计结果单击此处，观察1个或多个视野的原始数据，原始数据的末尾也有统计结果单击此处，观察1个或多个视野的场参数数据在此处选择需显示的测量参数选中需要的数据文件从Access数据库中提取测量数据,此表存储每一测量目标的各个参数。

此表存储场参数数据在表格顶端灰色区域点击或横向拖拉鼠标，选中整列光标移到选中区域，在此区域中按右键，在此弹出右键菜单中点击隐藏列鼠标点击左上角的灰色方块，选中全部 数据鼠标点击右键菜单中的复制进入Excel电子表格所有复制的数据现已粘贴到Excel表格中特别提醒： 在Excel 2000中，在数据透视表向导3步骤之3时，应选择版式项后方可得到这一界面Champion Image,华中科技大学同济医学院病理学系超微病理研究室张春明,图像分析过程演示,Champion Image 谢谢使用！,。