【2017年整理】多组学实验及数据分析系列之转录组学与蛋白质组学
4页1、1多组学实验及数据分析系列研习会(第三期)之转录组学、蛋白质组学和代谢组学在后基因组时代,生命科学研究开始进入系统、全面、动态的功能探索阶段。多种高通量的研究策略如基因组测序、转录组测序、小 RNA测序、蛋白质组定量实验和代谢组学被组合应用到同一个课题研究中,在原先单个平台产出数据分析挖掘的的基础上增加了多个实验平台产出数据的整合分析。本系列研习会将深入探讨不同平台的实验方法、研究策略、实验设计和数据分析,并介绍多组学实验整合研究的案例,研讨内容由多年实践经验的科研和技术人员进行讲解和带领数据分析的实际上机操作。主办单位:上海生咨生物科技有限公司协办单位:上海市药物转化工程技术研究中心支持单位:上海维基生物科技有限公司时间:2015 年 8月 11日8 月 15日地点:上海良友饭店,静安区南苏州路 1455号8月 11日(周二)下午 14:3017:30 或 8月 12日上午 8:30-9:30注册。上午(9:30-12:00)1. 蛋白质组学常用实验方法1.1 基于凝胶技术的定量蛋白质组学1.2 基于质谱技术的蛋白质组学研究8月 12日(周三)下午(13:30-17:30)2.蛋白质
2、搜库和差异蛋白筛选2.1 蛋白质组学数据分析搜索引擎2.2 如何提高蛋白鉴定覆盖度2.3 质谱搜库软件演示和 maxquant上机实习2.4 差异蛋白筛选方法8月 13日(周四)上午(9:00-12:00)3.转录组实验设计和数据分析3.1 转录组测序数据分析及其在临床医学方面的应用研究8月 13日(周四)下午(13:30-17:30)4.蛋白质组数据分析4.1 NCBI、UNIRPOT 数据库资源介绍4.2 Gene Ontology介绍4.3 KEGG网站介绍4.4 蛋白质组学数据分析8月 14日(周五)上午(9:00-12:00)5.蛋白相互作用网络分析功能介绍和上机操作5.1 cytoscape5.2 pajek5.3 STRING8月 14日(周五)下午(13:30-17:30)6.常用分析上机练习包括:6.1 维恩分析6.2 层次聚类和热图6.3 k-means聚类6.4 主成分分析26.5 GO功能分析和富集分析6.6 KEGG通路分析6.7 DESeq8月 15日(周六)上午(9:0012:00)7. 代谢组学研究方法7.1 代谢组学实验设计及样本处理7.2 代谢组学数
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