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生物化学二核酸化学

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    • 1、核酸是存在于细胞中的一类大分子酸性物质,包括核糖核酸(ribonucleic acid, RNA)和脱氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid, DNA)两大类。,第二章 核酸的结构与功能,RNA和DNA都是以单核苷酸(nucleotide)为基本单位所组成的多核苷酸长链。 RNA主要参与遗传信息的表达,而DNA则是遗传信息的载体。,第一节 核酸的化学组成及一级结构,组成元素 核酸的基本单位:核苷酸,C H O N P(9%-10%),核酸的水解产物:,1. 嘧啶碱(pyrimidine):,一、核苷酸中的碱基组成,2. 嘌呤碱(purine):,二、戊糖与核苷,1戊糖(pentose):,H,2核苷(nucleoside):,核苷是由戊糖与含氮碱基经脱水缩合而生成的化合物。 在大多数情况下,核苷是由核糖或脱氧核糖的C1-羟基与嘧啶碱N1或嘌呤碱N9进行缩合,故生成的化学键称为,N糖苷键。如 图,“稀有核苷”是由“稀有碱基”所生成的核苷。,三、核苷酸的结构与命名,核苷酸(nucleotide)是由核苷与磷酸经脱水缩合后生成的磷酸酯类化合物,包括核糖核苷酸和脱氧核糖核苷酸两

      2、大类。 由于与磷酸基缩合的位置不同而分别生成2-核苷酸、3-核苷酸和5-核苷酸。最常见者为5-核苷酸(5常被省略)。,核苷酸的分子结构,核苷酸的命名及缩写符号,两类核酸的基本成分,四、核酸的一级结构,一分子核苷酸的3-位羟基与另一分子核苷酸的5-位磷酸基通过脱水可形成3,5-磷酸二酯键,从而将两分子核苷酸连接起来。,3,5-磷酸二酯键的形成,多核苷酸链:,核酸就是由许多核苷酸单位通过3,5-磷酸二酯键连接起来形成的不含侧链的长链状化合物。 核酸是具有方向性的长链状化合物,多核苷酸链的两端,一端称为5-端,另一端称为3-端。,DNA分子主要由dAMP、dGMP、dCMP和dTMP四种脱氧核糖核苷酸所组成。 DNA的一级结构就是指DNA分子中脱氧核糖核苷酸(碱基)的排列顺序及连接方式(3,5-磷酸二酯键)。 RNA分子主要由AMP,GMP,CMP,UMP四种核糖核苷酸组成。 RNA的一级结构就是指RNA分子中核糖核苷酸碱基)的排列顺序及连接方式。,DNA的一级结构: 5-AGTCCATG-3 AGTCCATG 3-TCAGGTAC-5 RNA的一级结构: 5-AGUCCAUG-3 AGUC

      3、CAUG,核酸一级结构的表示方法,第二节 DNA的空间结构与功能 一、DNA的二级结构双螺旋结构模型,DNA双螺旋结构(double helix structure)是DNA二级结构的一种重要形式,它是Watson和Crick两位科学家于1953年提出来的一种结构模型。,James Watson (L) and Francis Crick (R), and the model they built of the structure of DNA,Chargaff 研究小组的贡献,19501953,Chargaff研究小组对DNA的化学组成进行了分析研究,发现: DNA碱基组成有物种差异,且物种亲缘关系越远,差异越大; 相同物种,不同组织器官中DNA碱基组成相同,而且不因年龄、环境及营养而改变; DNA分子中四种碱基的摩尔百分比具有一定的规律性,即A=T、G=C、A+G=T+C。这一规律被称为Chargaff规则。,1953年由Franklin和Wilkins等人完成的研究工作,发现了DNA晶体的X线衍射图谱中存在两种周期性反射,并证明DNA是一种螺旋构象。,Fig. 51,DNA双螺旋

      4、结构模型的要点:,1、右手螺旋 , 大沟、小沟 2、螺旋由两条反向的互补双链组成A T, G C ,戊糖和磷酸构成骨架居外,互补碱基处于碱基平面居内 3、双螺旋直径2nm,螺旋一圈含10bp,螺 距3.4nm 4、维系力:横向氢键 纵向碱基堆积力,二、DNA的超螺旋结构(三级结构)及其 在染色质中的组装,超螺旋结构(superhelix 或supercoil) DNA双螺旋链再盘绕即形成超螺旋结构。 正超螺旋(positive supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方同相同。 负超螺旋(negative supercoil) 盘绕方向与DNA双螺旋方向相反。,绝大多数原核生物的DNA都是共价封闭的环状双螺旋。如果再进一步盘绕则形成麻花状的超螺旋结构。,(一)原核生物DNA的高级结构:,(二)DNA在真核生物细胞核内的组装:,在真核生物中,双螺旋的DNA分子围绕一蛋白质八聚体进行盘绕,从而形成特殊的串珠状结构,称为核小体(nucleosome)。核小体结构属于DNA的高级结构。,核小体的结构,核小体、染色质与染色体,三、DNA的功能,DNA的基本功能是作为遗传信息的载体,为生物遗传信息复制以及基因信息的转录提供模板。 DNA分子中具有特定生物学功能的片段称为基因(gene)。一个生物体的全部DNA序列称为基因组(genome)。基因组的大小与生物的复杂性有关,如病毒SV40的基因组大小为5.1103bp,大肠杆菌为5.7106bp,人为3.2109bp。,

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