Pacbio 第三代测序仪
5页1、第三代测序-单分子实时测序一,PacBio RS平台介绍二,PacBio RS测序仪系统服务领域1,动植物复杂基因组测序2,真菌基因组完成图3,细菌基因组完成图4,BAC克隆完成图5,从头组装(DE Novo Assembly)三,天津生物芯片提供的PACBIO RS系统测序方案四,PacBio RS测序仪系统优势五,PacBio RS测序仪系统原理一,PacBio RS平台介绍PacBio RS测序仪系统是太平洋生物技术公司(Pacific Biosciences)基 于单分子实时(SMRT)测序技术的第三代测序平台,可以在一天内完成从样品制 备到测序和读取序列的全过程。天津生物芯片利用PacBio RS测序仪系统全面解 决了二代测序几大困扰:海量数据拼接难,变异检测假阳性高,稀有突变被淹没, 高GC含量区域无法跨越,高度片段无法准确测定等,得到高质量,完整的数据 信息,为合作伙伴提供优质的基因组组装,目标区域测序,碱基修饰检测等技术 服务。二,PacBio RS测序仪系统服务领域1, 动植物复杂基因组测序(1) 杂合基因组:杂合基因组主要指杂合率高于0.5%的二倍体基因组,如大部分
2、 水产类和昆虫等; 高重复基因组:主要指重复序列比例高于50%的二倍体基因组,大部分林木;(3)超大基因组:基因组大小大于3G,甚至是10G以上的物种,如两栖类,部分 林木;(4)多倍体基因组:如四倍体、六倍体植物等。hi I I 11 I I I 11 Mi CH O BZDEHI 111 I I III I I 1 111 Icn on m LEi i rm i i rn n o LEDR mrmmn O CD O EHR ODumrnnIIIIIBcIII I 1 11 I I I 11 Mlo o o o co o JOiio co o o o O RR-图1主要技术策略示意图2,真菌基因组完成图(1) 适用于所有真菌菌株;(2) 尤其适合超咼GC/超低GC真菌;(3) 其它用传统方法测序比较困难真菌; 真菌基因组草图或精细图补洞。3,细菌基因组完成图(1) 普通细菌快速完成图构建;(2) 尤其适合超高GC/超低GC细菌;(3) 其它用传统方法测序比较困难细菌菌株通过采用第三代测序技术,直接进行细菌基因组的完成图绘制。4,BAC克隆完成图通过PacBioRS平台进行单分子实时测
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