
计算机在化学中的应用_03_chemdraw-07-绘制查询结构.pdf
29页1第七部分绘制查询结构7.1 查询结构为检索结构信息提供的绘制结构原子标有特殊属性2第七部分绘制查询结构7.2 原子属性7.2.1 原子属性原子标有特殊属性3第七部分绘制查询结构4第七部分绘制查询结构SRHX2U2∗25第七部分绘制查询结构指示器查询属性* 取代基:自由位(按自由位置数)U 取代基:最大到(按最大取代数)X 取代基:精确到(按取代数)H 含氢R 环键数S 不饱和C 反应变化T 立体反应L 转化I 同位素丰度6第七部分绘制查询结构7.2.2 取代基取代基属性指被选原子上连接的取代基的数目ChemDraw中,取代基被定义为任何键连接的非氢原子7第七部分绘制查询结构HO8第七部分绘制查询结构选项查询结果Unspecified不确定(默认) 由目标数据库确定Free Sites自由位置找到化合物,其中被选原子可以含有取代基的最大范围是选项[数量]框中的数量加上所绘制键的数量Up to最大到找到化合物,其中被选原子可以含有取代基的最大范围是选项[数量]框中的数量Exactly精确到找到被选原子确切含有微调按钮中指定数目的取代基的化合物,最多可有15个取代基9第七部分绘制查询结构7.2.2 隐含氢隐含氢属性是否可在被选原子上连接额外的氢选项查询结果Not allowed禁用找到被选原子上没有连接额外氢的化合物Allowed允许(默认) 找到匹配的化合物而不管被选原子上有没有氢连接10第七部分绘制查询结构7.2.4 环键数环键数指任何大小的环上的原子连接的键的数目11第七部分绘制查询结构选项查询结果Any 任何(默认) 匹配化合物中被选原子可以是任何环(非环)的成员No ring bonds无环键脂肪族化合物As draw同绘制匹配化合物中被选原子位于所画的相同类型和数目的环中Simple ring单一环匹配化合物中被选原子位于一个环中(该原子有两个环键)Fusion稠合匹配化合物中被选原子位于稠合环中(该原子有三个环键)Spiro or Higher螺环或更高键匹配化合物中被选原子是螺环或更高键连接的一员12第七部分绘制查询结构7.2.5 不饱和度不饱和度属性指被选原子上是否连接多键选项查询结果Unspecified不确定(默认) 匹配化合物的被选原子不管是否连接多键Must be absent必须没有匹配化合物被选原子没有连接多键Must be prebsent必须有匹配化合物被选原子至少连接一个多键(双键、三键或芳香键)13第七部分绘制查询结构7.2.6 反应变化(检索反应)反应变化属性是指反应后被选原子是否发生变化选项查询结果May be anything可以任意(默认)找到被选原子反应后没有发生变化的化合物Must be specified必须指定找到匹配化合物的被选原子反应后发生如所绘制的变化14第七部分绘制查询结构7.2.7 立体反应立体反应属性是指反应后被选原子是否保持立体中心选项查询结果Any任何(默认)找出忽略被选原子的立体化学的所有化合物Inversion反向找出反应后被选原子变成反向立体构型的所有化合物Rentention保留找出反应后被选原子的立体构型不发生变化的所有化合物15第七部分绘制查询结构7.2.8 转化转化属性是指结构查询中需要匹配的属性和在Markush DARC查询中可能的数据库命中率选项查询结果Equal(默认)对一般项,匹配指定到特殊或者一般性Broad广泛的指定查询原子到相应数据库的超原子Narrow精确的查询相应数据库中相应的原子或基团Any任意对任何项,转化一般或者指定项16第七部分绘制查询结构7.2.9 同位素丰度该属性允许区别不同同位素化合物17第七部分绘制查询结构选项查询结果Unspecified默认选项Any 任何对ChemFinder,默认值相同,包括与其他系统的兼容性Natural 正常指示为更改核素的同位素Enriched 富足指示同位素取代基混合物和未指定核素的同位素Deficient 不足指示删除的标记,其核素含量低于正常比例Nonnatural非天然指示同位素取代核素,化合物中的分子只能由指示的核素组成18第七部分绘制查询结构7.3 键7.3.1 键属性19第七部分绘制查询结构RngRxn S/AS/DAnyD/A20第七部分绘制查询结构指示符查询属性Any 键类型: 任意S/D 键类型: 单键/双键D/A 键类型: 双键/芳香键S/A 键类型: 单键/芳香键Rng拓扑: 环Chn拓扑: 链Rxn反应中心21第七部分绘制查询结构7.3.2 键类型选项查询结果Single (all) and Dative单键到配键找到被选键是单键到配键所有类型的化合物Double or Double Bold双键找到被选键是双键的化合物Double Either双醚找到被选键是双键和含醚的顺/反立体化学类型的化合物Aromatic 芳香键找到被选键是芳香键的化合物Tautomeric互变异构找到被选键是互变异构立体化学类型的化合物22第七部分绘制查询结构选项查询结果Triple 叁键找到被选键是三键的化合物Any 任意找到匹配化合物而不管被选键的类型S/D找到被选键是单键或双键的化合物D/A找到被选键是双键或芳香键的化合物S/A找到被选键是单键或芳香键的化合物23第七部分绘制查询结构7.3.3 拓扑拓扑属性是指被选键的周围环境选项查询结果Unspecified(默认)找到匹配化合物而不管周围环境Ring 环找到被选键是环的一部分的化合物Chain 链找到被选键是链的一部分(确定不是环的一部分)的化合物24第七部分绘制查询结构7.3.4 反应中心--是指被选键在反应中受到的影响选项查询结果Unspecified 默认找到匹配化合物,不管被选键是否为反应中心Center 中心找到被选键是被反应影响的化合物,但改变类型未指定Make/Break建立/打开找到被选键在反应中被建立/打开的化合物Change改变找到被选键的键数在反应中改变的化合物Make/Change建立/改变找到被选键在反应中被建立/改变并且键的类型发生改变的化合物Not Center 非中心找到被选键在反应中可改变,但不是反应中心的化合物Not Modified 不改变找到被选键在反应中不改变的化合物25第七部分绘制查询结构7.4 查询工具面板ChemDraw 10.026第七部分绘制查询结构7.5 通用俗名代表一类元素或结构 z“M”可以是所有金属的通用俗名 z“X”可以代表卤代物 z“Ary”可以代表一个芳香子结构27第七部分绘制查询结构7.6 元素列标记通过标记为元素列标记,可制定“列”中的一个原子必须要与要搜索的结构匹配[S,Se,Te]中括号逗号28第七部分绘制查询结构 z非氧硫族元素连接在另一原子上 zA不一定是碳 z硫族元素和其他原子之间的键类型是单键或双键29第七部分绘制查询结构7.7 元素非列标记通过标记为元素列标记,可制定“列”中的一个原子必须要与要搜索的结构匹配;而非列标记要求元素不匹配NOT F,Cl,Br,I[-Cl,O,N][NOT F,Cl,Br,I][NOT Cl,O,N]。












