pubmed检索方法.ppt

PubMed数据库 （是NCBI的Entrez系统中的数据库之一）http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi （National Center for Biotechnology Information，NCBI)一、概述收录范围1 MEDLINE 2 PreMEDLINE3 Publisher supplied citationsMEDLINE收录了全世界70个国家和地区的4600余种生物医 学期刊，起始时间1953年，目前文摘条目1200 万篇，年报道量近40万条，英文刊物占90%、 3/4有英文摘要，周更新 内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、卫生 保健、兽医学等专业 记录标注[PubMed - indexed for MEDLINE]PreMEDLINE是临时性医学文献数据库，每天接收新数据， 经MeSH词表标引后，每周向medline移加一 次 记录标注[PubMed - in process]Publisher Supplied Citation出版商直接向PubMed递送的电子记录 记录标注[PubMed - as supplied by publisher] 备注：提供的数据如果超出MEDLINE数据库的收 录范围，如在综合性科学杂志（Science， Nature）上发表的地理学文章等，将不被采用 。

字段标识符AB-Abstract LA-Language AD-Affiliation MH-MeSH Terms AU-Authors PMID-PubMed Unique Identifier CY-Country PT-Publication Type DP-Publication Date SO-Source EDAT-Entrez Date TA-Journal Title Abbreviation GS-GeneSymbo TI-Title IS-ISSN UID-Unique Identifiers 备注：检索词[字段标识符]PubMed的特点n自动词语匹配n链接点多，部分在网上免费获得全文n也可以直接定购原文二、检索规则（一）Automatic Term Mapping词汇自动转换1、 MeSH Translation tablenVitamin c 转换为“ascorbic acid”[Mesh Terms] OR vitamin c[Text Word] 备注：想要查验检索词的转换情况，并进行调整和保存 检索策略，可点击“details”按钮（一）Automatic Term Mapping2、Journals Translation tablenNew England journal of medicine 转换为 “N Engl J Med”[Journal] 备注：n三种不同的表达方式刊名全称、MEDLINE刊名缩写格式、ISSN（一）Automatic Term Mapping3、Phrase List 在前两个表中均未找到，而在短语列表中找到这 个词nBlood sugar（一）Automatic Term Mapping4、Author Indexn姓（全称）名在后（首字母缩写）smith jc 当一个短语在前三个表中都找不到匹配词，并且 有1或2个字母在词后时，PubMed就在该索引 中查找。

备注： 如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词 时，PubMed就将短语劈开，再重复以上顺序单 独分别查找，直到找到相匹配的词如果仍找 不到匹配词，则用AND 将短语中的单个词连 接起来在全部字段中查找 例：pressure point转换为((“pressure”[MeSH Terms] OR pressure[Text Word]) AND point[All Fields])（二）短语检索n如果在短语上加双引号，将不执行转换功能 例如： “single cell”“oxygen free radicals”（三）布尔逻辑运算：nAND、OR、NOT必须大写 E-coli AND hamburger；vitamin c OR zinc； trace element NOT zincn逻辑符的运算次序是从左至右，括号内的检索 式可作为一个单元，优先运行n布尔逻辑检索允许在检索词后面附加字段标识 例如：dna[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]n查带文摘的文献 检索词 AND hasabstract 例如，Neoplasms AND hasabstract（四）截词检索：*n例：输入bacter*，检出bacteria、bacterium等 备注：将不执行转换功能；截词检索只限于单词，对词组无效，三、检索途径与方法n基本检索 - Basic Searchn高级检索 - Advanced Searchn限定检索 - Limits Searchn期刊检索 – Journal Searchn主题词检索 - MeSH Browsern引文匹配 - Citation Matchern临床查询 – Clinical Queries基 本 检 索n检索步骤：输入检索词，点[Go]按钮或按回车n检索词的输入形式：输入单词或短语或表达式，也可用*及“ ”如，aspirin；stomach ulcerIddm AND apoptosisasthma Kamada A 或asthma,Kamada A著者姓名：weng xz、 “ weng xz ”[au]刊名标题：刊名全称、缩写、ISSNJournal of leukocyte biology、J leukoc biol、0741-5400备注：n刊名后附加字段标识符刊名与主题词相同的期刊gene therapy[ta]、science[ta]、cell[ta]单个词刊名的期刊,Scanning[ta]n带括号刊名的期刊，录入时应将括号省略J Hand Surg[Am]输入格式为J Hand Surg Am高 级 检 索检索“阿尔茨海默病的基因治疗”检索步骤：n在Search for框中输入alzheimer disease，点击 特征栏的[Preview/Index]按钮n在“All Fields”选择一个检索字段，其右侧输入 框中输入检索词gene therapy，点击[AND]， 点击屏幕上部[Preview]开始检索并显示记录条 数，这样可以反复操作；若点击[Go]则显示结 果。

n如果选择一个检索字段，在提问框中输入检索 词，点击[Index]，则系统显示相应字段的索引 词列表选中一个索引词，点击逻辑符（AND 、OR、NOT），被选中的索引词会自动粘贴在 提问框中，然后点击“Preview”或“Go”按钮 备注：在高级检索界面，可以用逻辑组配符将检 索历史中的序号加以组配 例，#1 AND english限 定 检 索检索“近2年有关细胞凋亡的综述文献”检索步骤：n在特征栏点击“Limits”键n输入检索词apoptosisn在Limited to栏下,进行如下各种限定：选择字段、只检带文摘的记录、文献类型（ 选择review）、语种、子集、年龄组、人类或 动物实验、性别、录入系统日期（2years）、 文献出版日期n点击“Go”期 刊 检 索JAMA期刊编目信息浏览页机读格式NLM馆藏情况检索步骤：n有两种方法检索基本检索状态下，输入刊名高级检索状态下，在All Fields中选择Journal 字段，然后输入刊名n期刊数据库Journals Database输入格式：刊名全称、ISSN、刊名缩写（ MEDLINE、ISO）、NLM ID主 题 词 检 索检索“阿司匹林引起胃溃疡的文献”检索步骤：n点击“Mesh Browser”，进入MeSH浏览器的首 页n在提问框中输入aspirin，点击[Go]按钮，显 示该主题词的定义。

n点击该词n可做如下3种选择： 选择副主题词adverse effects；  Restrict Search to Major Topic headings only ；  Do Not Explode this term 浏览树形结构n输入第二个检索词stomach ulcer,点击 [Go]n点击此词，选/SH为chemical inducedn选择逻辑符AND，点击[Add]键 n点击[PubMed Search]按钮 备注：如果键入的词不规范，MeSH浏览器 将提示该词不是主题词，并显示与之相 对应的MeSH词引 文 匹 配检索步骤：n点击页面左边的“Single Citation Matcher”n按界面提示分别填入所知信息n点击[Search]按钮，可得到相应的特定文 献信息临 床 查 询是专为临床医生设置的 可以检索某一临床主题领域的治疗、诊断 、病因和预后4个方面内容的文献，同时 还可选择强调查全率或是查准率 也可以检索该主题词领域的系统性综述、 元分析等类型文献PubMed Central四、检索结果1、结果的显示n显示每屏记录条数 Show：默认20（5-500）page: 1 of 13 Nextn显示特定记录Display：显示所有记录记录前方框：显示标记记录著者名：该条记录n显示格式选择Display旁的下拉菜单，选择记录格式：summary默认、brief、Abstract、Citation 、ASN.1、MEDLINE、XML等格式n纯文本格式 Sent to-Text2、排序无序（Sort）著者（Author）刊名（Journal）出版日期（Pub Date）3、打印或存盘n打印：使用浏览器的打印功能，n存盘：点Send to下拉按钮选file 首先选择所要存盘的数据（show），其次 点击display显示所要存盘的格式，然后 点Send to-file即可4、订购全文nSend to-Order 备注：想要集中打印、存盘或订购全文时 ，首先点击Send to下拉按钮，选择 Clipboard，将每次检索结果保存，然后 再点击特征栏上的Clipboard即可。

五、链接功能nRelated Articles - 链接相关文献n链接NCBI数据库 Necleotide、Protein、Genome、Structure、 Popset、Taxonomy、OMIM、Books、 Probeset、3D DomainsnLinks Books - 链接相关图书 Linkout – 链接外部资源，与生物医学文献出版 商Web站点期刊全文的链接六、特征栏（Feature Bar）nLimitsnpreview/indexnhistorynClipboardnDetails。