16s和宏基因组的区别.docx

16S测序和宏基因组测序有什么区别？16S rDNA测序及宏基因组测序都是研究微生物的重要方法，那么问题来了：这两者到底有什么区另0 呢?什么情况下需要做16S测序?什么情况下需要做宏基因组测序?什么情况下需要二者结合使用呢？那么在开始宏基因组测序专题前，小编需要给大家解决一个非常重要的问题——16S测序和宏基因 组测序的主要区别是什么？在解决这个问题前，小编先要来说说什么是宏基因组测序：宏基因组测序（MetagenomicsSequencing）是对环境样品中全部微生物的总DNA（也称宏基因组： Metagenomic ）进行高通量测序，主要研究微生物种群结构、基因功能活性、微生物之间的相互协作关系 以及微生物与环境之间的关系宏基因组测序研究摆脱了微生物分离纯培养的限制，扩展了微生物资源的 利用空间，为环境微生物群落的研究提供了有效工具微生物测序研究常用手段包括16S等扩增子测序和宏基因组测序，这两者技术手段的主要区别如下：一、测序原理不同16S rDNA基因存在于所有细菌的基因组中，具有高度的保守性该序列包含9个高变区和10个保 守区（如下图），通过对某一段高变区序列（V4区或V3-V4区）进行PCR扩增后进行测序，得到1500bp左 右的序列。

宏基因组测序则是将微生物基因组DNA随机打断成500bp的小片段，然后在片段两端加入通 用弓I物进行PCR扩增测序，再通过组装的方式，将小片段拼接成较长的序列图细菌16S区域二研究目的不同16S测序主要研究群落的物种组成、物种间的进化关系以及群落的多样性宏基因组测序在16S测序 分析的基础上还可以进行基因和功能层面的深入研究（GO、Pathway等）三、物种鉴定深度不同16S测序得到的序列很多注释不至I」种水平，而宏基因组测序则能鉴定微生物到种水平甚至菌株水平 对于16S测序而言，任何一个高变区或几个高变区，尽管具有很高的特异性，但是某些物种（尤其是分类水 平较低的种水平）在这些高变区可能非常相近，能够区分它们的特异性片段可能不在扩增区域内宏基因组 测序通过对微生物基因组随机打断，并通过组装将小片段拼接成较长的序列因此，在物种鉴定过程中， 宏基因组测序具有较高的优势Tips :通常情况下，在微生态研究中，建议同时结合宏基因组测序和16S测序两种技术手段，可以更 高效、更准确地研究微生物群落组成结构、多样性以及功能情况。