数据审核流程和CHECK核软件的使用教材.ppt

11全国肿瘤防治研究办公室全国肿瘤登记中心 数据审核流程和数据审核流程和 审核软件的使用审核软件的使用2 主要内容主要内容 u肿瘤登记资料审核的流程和内容肿瘤登记资料审核的流程和内容 u审核软件的使用审核软件的使用(IARCcrgTools).fr/iarccrgtools.htm 3肿瘤登记资料审核的流程肿瘤登记资料审核的流程 不合格不合格合 格数据收集录入肿瘤登记处肿瘤登记处 《中国肿瘤登记年报》审核流程生成报表 结果的分析、评价4肿瘤登记资料审核的流程肿瘤登记资料审核的流程 NO数据收集录入肿瘤登记处肿瘤登记处 《中国肿瘤登记年报》审核流程l 发病 l 死亡l 人口l 其他5肿瘤登记资料审核的流程肿瘤登记资料审核的流程 NO数据收集录入肿瘤登记处肿瘤登记处 《中国肿瘤登记年报》审核流程l发病发病l 死亡l 人口l 其他I.肿瘤登记号：肿瘤登记号：用于区别同一病例登记的不同肿瘤；多部位原发癌病例的登记号须不同 II.性别：性别：男性=1，女性=2，不明=9 III.年龄：年龄：实足年龄，小于1岁的年龄编为0IV.出生日期：出生日期：至少有年份的信息发病数据审核发病数据审核6肿瘤登记资料审核的流程肿瘤登记资料审核的流程 NO数据收集录入肿瘤登记处肿瘤登记处 《中国肿瘤登记年报》审核流程l发病发病l 死亡l 人口l 其他VI.发病发病(诊断诊断)日期：日期：至少有年份的信息VII.部位编码：部位编码：ICD-10编码，要求编到小数点后一位，即有亚部位编码； ICD-O编码，必须同时有形态学和行为编码VIII.组织学组织学(形态学形态学)编码：编码：请使用ICD-O-3编码IX.肿瘤行为肿瘤行为(动态动态)编码：编码：请使用ICD-O-3编码X.诊断依据：诊断依据：在数据说明文件中指出各编码的意义发病数据审核发病数据审核7肿瘤登记资料审核的流程肿瘤登记资料审核的流程 NO数据收集录入肿瘤登记处肿瘤登记处 《中国肿瘤登记年报》审核流程l发病l 死亡死亡l 人口l 其他I.登记号：登记号：用于识别登记的个案病例 II.性别：性别：男性=1，女性=2 ，不详=9III.年龄：年龄：实足年龄, 小于1岁的年龄编为0 IV.出生日期：出生日期：至少有年和月的信息V.死亡日期：死亡日期：至少有年和月的信息VI.解剖学部位根本死因编码：解剖学部位根本死因编码：ICD-10至少三位数编码死亡数据审核死亡数据审核8肿瘤登记资料审核的流程肿瘤登记资料审核的流程 NO数据收集录入肿瘤登记处肿瘤登记处 《中国肿瘤登记年报》审核流程l发病l 死亡l 人口人口l 其他I.年份：年份：人口数据年份II.性别：性别：男性=1，女性=2III.年龄组人口数年龄组人口数（按合计（按合计, 0岁岁, 1-4岁岁, 5-9岁岁, …… ,75-79岁岁, 80-84岁岁, 85+岁以上岁以上, 及年龄不明进行及年龄不明进行分组）分组）人口数据审核人口数据审核9肿瘤登记资料审核的流程肿瘤登记资料审核的流程 NO数据收集录入肿瘤登记处肿瘤登记处 《中国肿瘤登记年报》审核流程l发病l 死亡l 人口人口l 其他I.年份：年份：人口数据年份II.性别：性别：男性=1，女性=2III.年龄组人口数年龄组人口数（按合计（按合计, 0岁岁, 1-4岁岁, 5-9岁岁, …… ,75-79岁岁, 80-84岁岁, 85+岁以上岁以上, 及年龄不明进行及年龄不明进行分组）分组）人口数据审核人口数据审核10肿瘤登记资料审核的流程肿瘤登记资料审核的流程 NO数据收集录入肿瘤登记处肿瘤登记处 《中国肿瘤登记年报》审核流程l发病l 死亡l 人口l 其他其他Ø《肿瘤登记资料上报问卷》Ø使用的肿瘤病例报告卡和肿瘤死亡病例报告卡的空白卡Ø恶性肿瘤登记册复印件（一页）Ø年度统计报表（最近一年发病和死亡报表）Ø肿瘤随访表/卡Ø肿瘤监测系统流程图Ø登记处进行登记工作的流程图 (发病和死亡登记)其他上报内容其他上报内容11肿瘤登记资料审核的流程肿瘤登记资料审核的流程 NONO数据收集录入肿瘤登记处肿瘤登记处 《中国肿瘤登记年报》审核流程有效性和一致性审核有效性和一致性审核可比性可比性 完整性完整性 有效性有效性 及时性及时性 主要评价指标：主要评价指标：Ø死亡发病比 Ø仅有医学死亡证明书 Ø部位不明的比例 Ø诊断不明的比例 Ø肿瘤发病死亡变化趋势12肿瘤登记资料审核的流程肿瘤登记资料审核的流程 NONO数据收集录入肿瘤登记处肿瘤登记处标准分级：《中国肿瘤发病与死亡2003-2007》审核流程有效性和一致性审核有效性和一致性审核可比性可比性 完整性完整性 有效性有效性 及时性及时性 A A级级B B级级拒绝接受拒绝接受覆盖全部人口有可靠的人口数据来源覆盖全部人口或特定人口覆盖人口不明确已建立完善规范的全死因监测系统死因监测系统不够完善，数据质量较差无死因监测系统诊断依据不明比例<10%诊断依据不明比例<20%诊断依据不明比例≧20%0% ICD-O-2 => ICD-O-320主要审主要审核内容核内容21Check 程序程序—变量的一致性审核变量的一致性审核nAge/Incidence and birth dates 年龄/出生与发病日期nAge/Site/Histology (ICD-O-3) 年龄/部位/组织学nSite/Histology (ICD-O-3) 部位/组织学nSex/Site 性别/部位nSex/Histology (ICD-O-3) 性别/组织学nBehaviour/Site (ICD-O-3) 行为/部位nBehaviour/Histology (ICD-O-3) 行为/组织学nGrade/Histology (ICD-O-3) 分级/组织学nBasis of diagnosis/Histology (ICD-O-3) 诊断依据/组织学22一致性审核一致性审核:性别性别/部位部位•男性，不应出现如下部位的肿瘤：男性，不应出现如下部位的肿瘤：–C51._(外阴), C52._(阴道), C53._(宫颈), C54._(宫体), C55._(子宫), C56._(卵巢), C57._(其它和未特指的女性生殖器官), C58._(胎盘) •女性，不应出现如下部位的肿瘤：女性，不应出现如下部位的肿瘤：–C60._(阴茎), C61._(前列腺), C62._(睾丸), C63._( 其它和未特指的男性生殖器官)23•发病发病/出生日期：出生日期： 发病日期 > 出生日期•年龄年龄/发病发病/出生日期：出生日期：年龄=发病日期-出生日期 在在Excel中用公式计算实足年龄：中用公式计算实足年龄：=DATEDIF(出生日期出生日期,发病日期发病日期,"Y")此公式中的日期只需要是日期格此公式中的日期只需要是日期格式即可满足计算式即可满足计算一致性审核一致性审核:年龄年龄24一致性审核一致性审核:部位部位/组织学组织学•部位/组织学通过两种方式进行审核：–一是通过审核某些形态学编码仅用于特定部位的肿瘤编码，如：•8170/3 肝细胞癌（C22.0)，8586/3 胸腺癌（C37.9)–二是通过审核“不常见的”或“不可能的”部位与形态学编码组合25IARC/IACR Tools 软件软件•IARC CHECK 程序： –Check程序对病例记录的变量分二步进行审核：•检查变量是否完整并在编码范围内检查有效性检查变量是否完整并在编码范围内检查有效性•检查不同变量之间是否合乎逻辑的一致性检查不同变量之间是否合乎逻辑的一致性•Multiple primaries：–按照 IARC/IACR 多原发肿瘤定义规则，检查多原发肿瘤； 26IARC/IACR Tools 软件软件•IARC CHECK 程序最早是为审核《五大洲发病率》第六卷数据，由Dr.Parkin等人编写的•先前的版本对解剖学部位和形态学编码的审核是基于ICD-O-1和ICD-O-2，当前版本是基于ICD-O-3–审核之前如果没有审核之前如果没有ICDO3编码需要现行转换编码需要现行转换27IARC/IACR Tools 对数据格式的要求对数据格式的要求•日期变量：格式 2000-01-12 •性别：必须是有效编码，如1、2或9(不详)•解剖学部位编码：解剖学部位编码：必须是有效的ICD-O-3编码, 如气管编码为C33.9, 不能编码为C33.0、C33.8 •形态学编码：形态学编码：必须是有效的ICD-O-3编码，如没有8006/3这个编码 •行为编码：行为编码：必须是0, 1, 2, 3 (或编码 6 或 9不认) •分级编码：分级编码：必须是有效的ICD-O-3编码 28IARC/IACR Tools 对数据格式的要求对数据格式的要求•数据库文件必须以文本格式存放, 变量以间固定格式分隔（.TXT .CSV .PRN）•每一病例用一行,要求必须包括以下变量:–(1)登记号； (2)性别；–(3)年龄； (4)出生日期；–(5)发病日期； (6)解剖学部位编码(ICD-O-3)–(7)组织学编码(ICD-O-3)； (8)肿瘤行为编码(ICD-O-3)；–(9)肿瘤分级编码(ICD-O-3)； (10)诊断依据编码；29数据格式示例数据格式示例 20110956172 1939-04-262011-01-051548070392011-02-05C15.47201100751101 1909-12-292011-01-121598000392011-02-08C15.9720110299165 1946-03-112011-01-251628000392011-02-12C16.2220110624161 1949-07-212011-01-061538000392011-02-13C15.3220110965170 1941-01-162011-01-132208000392011-02-13C22.9220110953176 1934-09-052011-01-182208170392011-02-16C22.9720110061172 1939-05-172011-01-252208000392011-02-17C22.9220110225175 1935-08-142011-01-022208170392011-02-17C22.9720110279164 1947-05-192011-01-191628140392011-02-18C16.2720110002165 1946-02-212011-02-183498000392011-02-18C34.9020110625158 1953-02-102011-01-102208000392011-02-23C22.9220110889269 1941-08-102011-01-031608140392011-02-26C16.0720110067238 1973-01-292011-02-253498000392011-03-01C34.92REGISTR SEXAGEBIRTHDAINCIDENTOPO MORP BEHA GRADDEATHDAICD10 BASI登记号登记号 性别性别 年龄年龄出生日期出生日期发病日期发病日期ICDO3ICDO3 组织组织 行为行为 分级分级死亡日期死亡日期ICD10ICD10 诊断诊断数据格式整理为数据格式整理为.prn.prn（可在（可在excelexcel中调整好日期为中调整好日期为YYYY-MM-DDYYYY-MM-DD后后””另存为另存为””即可）即可）30使用使用IARCcrg Tools——格式转换格式转换–打开IARCcrgTools—Tools—File Transfer–点击Input File栏下的Browse…按钮，选取Input文件 –在Output File栏中键入输出文件名–下一步如果以如果以.txt.txt文本格式审文本格式审核，则可能需要做格式核，则可能需要做格式转换：转换：31使用使用IARCcrg Tools——格式转换格式转换–依次选中全部变量进行转换–点击“完成”–完成格式转换如果以如果以.txt.txt文本文本格式进行审核，格式进行审核，则可能需要做格则可能需要做格式转换：式转换：32Ø本软件只针对ICD-O-3进行审核Ø如肿瘤登记的编码非非ICD-O-3，则需转换Ø以ICD10转换到ICD-O-3为例进行说明编码转换编码转换 33•ICD-10 ICD-10 转换到转换到 ICD-O-2ICD-O-2编码转换编码转换如果编码如果编码非非ICDO3ICDO3，，则审核之则审核之前需要将前需要将编码进行编码进行转换：转换：34编码转换编码转换: ICD-10 —> ICD-O-3•需要核查的记录4条•错误记录 2条 35•ICD-O-2 转换到转换到 ICD-O-3编码转换编码转换: ICD-10 —> ICD-O-336编码转换编码转换: ICD-10 —> ICD-O-337使用使用IARCcrg Tools——编码转换编码转换–打开IARCcrgTools—ConversionsICD03->ICD10–点击Input File栏下的Browse…按钮，选取Input文件(以文本格式存放,固定列宽)–在Output File栏中键入输出文件名–下一步38使用使用IARCcrg Tools——编码转换编码转换–打开IARCcrgTools—Conversions—ICD-0-3->ICD10–点击Input File栏下的Browse…按钮，选取Input文件(以文本格式存放,固定列宽)–在Output File栏中键入输出文件名–下一步如果编码不是如果编码不是ICD10ICD10 则统计之前需要将编则统计之前需要将编码转换为码转换为ICD10ICD10：：39•定义字段–Registration Number–Sex (男 1,女2）–Topography–Histology–Behaviour–Grade编码转换示例编码转换示例—ICD-O-3到到ICD1040编码转换示例编码转换示例—ICD-O-3到到ICD10•程序生成3个文件:–结果输出文件：fbie03_o3to10.txt–错误的记录文件： fbie03.eo3to10–需要核查的记录文件：fbie03.wo3to1041输出文件与输出文件与原文件相比原文件相比,多出一列多出一列ICD-10编码编码编码转换示例编码转换示例—ICD-O-3到到ICD1042使用使用IARCcrg Tools——Check审核审核•打开IARCcrgTools—Tools—IARC/IACR Check•点击Input File栏下的Browse…按钮，选取Input文件(以文本格式存放,固定列宽)•在Output File栏中键入输出文件名•下一步43使用使用IARCcrg Tools——Check审核审核•打开IARCcrgTools—Tools—IARC/IACR Check•点击Input File栏下的Browse…按钮，选取Input文件(以文本格式存放,固定列宽)•在Output File栏中键入输出文件名•下一步44•定义字段–Registration Number–Sex–Topography (ICD-O-3)–Histology (ICD-O-3)–Behaviour (ICD-O-3)–Grade (ICD-O-3)–Basis of Diagnosis–Incidence date–Birth date–Age使用使用IARCcrg Tools——Check审核审核45•定义性别编码•定义年龄不明编码•定义诊断依据形态学编码•定义日期格式使用使用IARCcrg Tools——Check审核审核46使用使用IARCcrg Tools——Check审核审核47•程序生成3个文件:–结果输出文件：fb03_chk.txt–错误的记录文件： fbie03.err–需要注意的记录文件：fbie03.chk使用使用IARCcrg Tools——Check审核审核48使用使用IARCcrg Tools——Check审核审核49IARCcrg Tools 软件使用小结软件使用小结•编码转换编码转换•数据审核数据审核主要包括主要包括”编码转换编码转换”和和 “数据审核数据审核”两部分内容两部分内容50IARCcrg Tools 软件使用小结软件使用小结•数据格式问题数据格式问题–文件格式：prn、txt、csv…–变量格式：ICD 编码的格式、日期格式•编码转换问题编码转换问题–本软件针对ICD-O-3编码进行逻辑核查–ICD-10->ICD-O-3需要经过中间转换ICD-O-2–编码之间转换不是能完全一一对应转换的，部分需要手工转换 51IARCcrg Tools 软件使用小结软件使用小结•其他问题其他问题–关键变量不能缺失：ICD–最后一列数据不能有缺失，建议把“诊断依据诊断依据”放最后一列，如果诊断不明的用9填充–审核结果中.CHK 文件为核查记录，不一定需要修改–审核结果中 .err 文件为错误的记录，必须修改、–审核结果文件中剔除了.err文件中的记录，但保留着.chk文件中的记录52 谢谢 谢！谢！。