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基于HumanProteinAtlas分析LILRB2.docx

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  • 卖家[上传人]:I***
  • 文档编号:329257831
  • 上传时间:2022-08-01
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    •           基于HumanProteinAtlas分析LILRB2                    摘要:目的:通过在Human Protein Atlas数据库中对LILRB2检索来指导后续研究;方法:在数据库中对LILRB2检索获取结果后进行综合分析;结果:LILRB2在表达广泛,并与多种疾病的发病结论:LILRB2在基于免疫功能的基础上发挥着重要的调控作用,比如参与肿瘤的调控、神经退行性变等关键词:Human Protein Atlas;LILRB2;检索;疾病Human Protein Atlas,简称HPA,是基于蛋白质组学,转录组学及系统生物学数据为基础,在其中绘制组织、细胞和器官等图谱,同时包含有正常组织的蛋白表达情况,而且还可以查阅肿瘤患者的生存曲线,通过互联网获取方式可以方便快捷获得所需数据,网址为https://www.proteinatlas.org/它最大的优点是以上所有数据均是开放获取(Open Access)通过对自己感兴趣基因或蛋白的查询可以初步了解该蛋白质组织特异性,肿瘤相关性等情况,为后续实验研究提供指导[1]LILRB2(Leukocyte Immunoglobulin Like Receptor B2)属于leukocyte immunoglobulin-like receptor (LIR)家族成员,胞浆内含有ITIM(immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motifs)基序,在肿瘤相关研究中已发现其发挥重要的作用。

      所以对其相关功能的分析和研究对一些相关疾病启动重要作用所以本文基于HPA分析LILRB2相关信息以便为后续研究提供基础方法输入基因名后,搜索得到对该基因的基本描述和证据等级,同时会在页面中看到各种图标信息选择关注基因,则显示该基因及其编码蛋白质基本情况,其中包括基因名称,组织特异性,细胞特异性,免疫细胞特异性和脑组织特异性等信息,还包括在肿瘤中诊断价值,预测位置,蛋白功能,分子功能,生物学相关性等信息同时包括了多种图谱:Tissue atlas,Single cell type atlas, Pathology atlas, Brain atlas, Blood protein atlas, Cell line atlas等结果通过在HPA中进行检索,在组织特异性分析中发现LILRB2广泛的表达于多种组织,但是主要位于骨髓、肺脏和淋巴组织中,虽然在神经系统中也有一定程度的表达,但神经系统结构特异性表达尚不明确,仍有待进一步研究在单个细胞分析中发现其主要表达于中性粒细胞中,初步预测其功能为参与炎症反应,这也与前期的一些实验结果相吻合,在组织相关细胞分析中发现其主要表达于单核巨噬细胞和树突状细胞。

      在肿瘤相关分析中发现其在多种肿瘤细胞中均有表达增高的情况,所以缺乏肿瘤特异性,对LILRB2与肾脏癌症进行分析发现,和预后是正相关的关系,但仍旧需要更多病理来确证同时该数据库还认定LILRB2定位位置主要是细胞膜上,而发挥作用主要以受体的形式完成在血清中的有分泌型LILRB2存在,浓度为65μg/L,但未见任何相关报道结论通过结果分析可知,LILRB2主要表达于中性粒细胞、单核巨噬细胞和树突状细胞,这些细胞是重要的固有免疫细胞和抗原提呈细胞,所以基于其细胞功能的相关性可知其在固有免疫中发挥重要作用,但可以预测其在适应性免疫中同样起到重要作用有研究已经报道免疫应答时其可与MHC-I类分子结合后抑制免疫应答,可以参与对炎症反应的调控[2]由于其胞浆区具有ITIM基序,所以可以预测其可限制免疫细胞的自身反应性,而这在疾病的调控中发挥着至关重要的作用[3]在组织相关的分析中可知LILRB2的表达较广泛,而且在神经系统的表达无特异性,但是有研究发现而其小鼠同源物,即成对免疫球蛋白样受体B蛋白(paired immunoglobulin-like receptor B , PirB),作为可溶性β淀粉样蛋白(β-amyloid, Aβ)Aβ的受体,这也符合其发挥作用主要通过受体结合方式来发挥作用,而且研究发现亲和力较高[4]。

      而人类的LILRB2的Aβ相关已得到初步证实,届时将进一步促进LILRB2与神经系统疾病的相关性[5]通过HPA分析,LILRB2在多种肿瘤中均有表达增高,而且与预后相关,所以说说明在肿瘤中的重要性在实体瘤研究中发现LILRB2 可与肿瘤微环境中的相关配体相互作用,致使髓系细胞发挥了促肿瘤生长作用,同时增加肿瘤免疫逃逸纪律通过高亲和力分子特异性结合LILRB2后阻断LILRB2在肿瘤微环境中的作用,相关抑制作用可被逆转但更多的机制仍旧需要进一步研究[6, 7]综上所述,LILRB2在基于免疫功能的基础上发挥着重要的调控作用,比如参与对肿瘤发生和发展的调控、也参与神经退行性变的发病过程基于HPA的数据分析和相关研究的进展可以知道LILRB2在疾病中发挥重要作用,但仍需进一步深入研究;而HPA数据库在促进科研的基础上仍需要进一步充实和更新,比如LILRB2仅有RNA水平相关研究,同时未将一些最新研究进展囊括其中Reference:[1] UHLEN M, FAGERBERG L, HALLSTROM B M, et al. Proteomics. Tissue-based map of the human proteome [J]. Science, 2015, 347(6220): 1260419.[2] TAKEDA K, NAKAMURA A. Regulation of immune and neural function via leukocyte Ig-like receptors [J]. J Biochem, 2017, 162(2): 73-80.[3] LENTZ R W, COLTON M D, MITRA S S, et al. Innate Immune Checkpoint Inhibitors: The Next Breakthrough in Medical Oncology? [J]. Mol Cancer Ther, 2021, 20(6): 961-74.[4] KIM T, VIDAL G S, DJURISIC M, et al. Human LilrB2 is a beta-amyloid receptor and its murine homolog PirB regulates synaptic plasticity in an Alzheimer's model [J]. Science, 2013, 341(6152): 1399-404.[5] LAO K, ZHANG R, LUAN J, et al. Therapeutic Strategies Targeting Amyloid-beta Receptors and Transporters in Alzheimer's Disease [J]. J Alzheimers Dis, 2021, 79(4): 1429-42.[6] SHAO H, MA L, JIN F, et al. Immune inhibitory receptor LILRB2 is critical for the endometrial cancer progression [J]. Biochem Biophys Res Commun, 2018, 506(1): 243-50.[7] HE J, XU J, YU X, et al. Overexpression of ANGPTL2 and LILRB2 as predictive and therapeutic biomarkers for metastasis and prognosis in colorectal cancer [J]. Int J Clin Exp Pathol, 2018, 11(5): 2281-94.通讯   -全文完-。

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