DNA的制备、操作步骤
3页1、、实验原理入噬菌体是最早使用的克隆载体,入噬菌体的基因组是一长度约为50kb的双链 DNA分子,它在宿主细胞有两种生活途径:其一是裂解生长,环状DNA分子在细 胞内多次复制,合成大量噬菌体基因产物,装配成噬菌体颗粒,裂解宿主菌再进 行下一次感染;其二是溶源性生长,即感染细胞内入噬菌体DNA整合到宿主菌 染色体 DNA 中与之一起复制,并遗传给子代细胞,宿主细胞不裂解。平板培养时, 裂解生长形成噬斑。液体培养时,裂解生长使菌液中宿主菌最后全部被裂解 而 释放出大量的噬菌体颗粒。经过改造的入噬菌体克隆位点可插入几到几十kb的外源DNA。许多cDNA和基 因组文库是以入噬菌体作为克隆载体构建的。因此,在经文库筛选得到目的克 隆后,我们常常需要利用入噬菌体裂解生长的特点,培养获得大量的噬菌体颗 粒,并提取入噬菌体DNA来开展进一步的工作。二、实验设备与试剂(一)实验试剂1. LB液体培养基:胰化蛋白胨(细菌培养用)10g,酵母提取物(细菌培养用) 5g,NaCl 10g,加ddHO至1000ml,完全溶解,分装小瓶,15lbf/in2高压灭菌220min。2. 1.5%琼脂LB固体培养基:称取
2、1.5g琼脂粉放入300ml锥形瓶,加lOOmlLB,15 lbf/in2高压灭菌20min,稍冷却,制备平皿。3. 20%麦芽糖:麦芽糖20g,加ddHO至100ml,0.22m滤膜过滤。24. SM 液:NaCl5.8g,MgSO 7HO2g,lMTrisCL(PH7.5) 50ml,2%明胶 5ml,42加 ddHO 至 1000ml。 15lbf/in2 高压灭菌 20min。25. RNase A 10mg/ml,TE配制,沸水浴15min,分装后贮存于-20C。6. DNase I 10mg/ml,TE 配制,分装后贮存于-20C。7. PEG 80008,10%SDS9, EDTA: 0.5MpH8.03,苯酚/氯仿/异戊醇(25: 24: 1), 异丙醇,无水乙醇, 70%乙醇。(二)实验设备医疗器械采购网 1. 高压灭菌锅2. 培养皿3. 微量离心管4. 37C摇床5. 高速离心机6. 低温冰箱(三)实验材料入噬菌体原种三、实验步骤(一)入噬菌体平板培养1. 用SM液10倍梯度稀释入噬菌体原种。2. 取0.1ml各梯度稀释离心到一消毒微量离心管中,加0.2ml新鲜培养
3、的宿主 菌,加麦芽糖(0.2%), MgSO (10mM), 37C温育20min,使噬菌体颗粒吸附于细菌。43. 取熔化(4700.7%琼脂LB固体培养基3ml与上述管混匀,立即倒入预备(2-4 天)的含凝固1.5%琼脂LB固体培养基的平板内,轻轻晃动平板使均匀分布。4. 37C培养6-8hr后,观察噬斑形成。5. 用剪去部分头部的吸头挖取单个噬斑到0.5ml的SM液中,加0.05ml氯仿, 震荡37C温育10min。6. 重复-,获得单个噬斑滴度。(二)入噬菌体液体培养1. 取2ml新鲜培养的宿主菌,离心,0.4ml LB培养基重悬,加入噬菌体0.1ml (新鲜获得的单个噬斑,依滴度使之与宿主菌比约1/500-1000)。2. 加麦芽糖(0.2%), MgSO (10mM),37C温育20min,使噬菌体颗粒吸附于4细菌。3. 加到100mlLB液体培养基中,加麦芽糖(0.2%),MgSO (10mM),37C摇震4培养9-12hr后可见裂解发生。4. 加0.1ml氯仿,37C继续摇震培养10-20min。(三)入噬菌体DNA提取1. 将上述裂解液转移至离心管,离心8000gX10min,去细菌碎片,取上清液。2. 加 RNase A、DNasel 至 1p g/ml, 37C温育 30min。3. 加9.3g PEG 8000, 5.8g NaCl,摇匀至溶解,冰浴1hr或4C过夜。4. 4C离心 10000gX20min,去上清液。5. 加2mlSM液,充分洗溶管壁及沉淀,移到新微量离心管,加20卩l 10%SDS, 20l 0.5M EDTA,68C15min。6. 加等体积苯酚/氯仿/异戊醇(25: 24: 1),混匀,离心12000gX5min,取 上层液到一新微量离心管,加等体积氯仿/异戊醇(24: 1) ,混匀,离心 12000gX5min。7. 取上层液到一新微量离心管,加等体积异丙醇,混匀,-20Clhr,4C离心 12000gX10min,去上清液。8. 1ml预冷的70%乙醇洗涤沉淀1-2次,4C离心8000gX7min,弃上清,将沉 淀室温下晾干。9. 沉淀溶于20l TE,-20C保存备用。
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