
如何上传序列 刘崇灵资料.ppt
17页如何上传序列 How to submit sequence,刘崇灵 2014.3,,为什么要上传序列?,上传序列的方法有哪些?,具体提交步骤是怎样?,,为什么要上传序列?,可简化数据篇幅,用GenBank登录号代替 可资源共享,便于掌握研究进展 可轻松查找到相关序列信息 上传序列的方法有哪些?,进入 NCBI主页,,从左侧列表进入 “Data and software”,,右侧“Quick Link” 选择提交方法,,,,提交,需注册 适合单个或少量 序列的提交 序列注释不复杂,需下载软件 适合批量序列提交 更多选项和功能, 可以批量修改,该两种方法大同小异,接下来以sequin方法为例介绍用Sequin提交序列步骤:,1. 下载Sequin软件,安装,2. 准备提交前的材料,3. 运行Sequin,并按照要求填 写相应内容,保存提交内容 (.sqn格式),4. 正式提交:将生成的“.sqn” 文件以附件形式发邮件至 gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov, 并简要说明提交内容1. 下载Sequin软件,安装,,,,,用Sequin提交序列步骤:,1. 下载Sequin软件,安装,2. 准备提交前的材料,3. 运行Sequin,并按照要求填 写相应内容,保存提交内容 (.sqn格式),4. 正式提交:将生成的“.sqn” 文件以附件形式发邮件至 gb-sub@ncbi.nlm.nih.gov, 并简要说明提交内容。
2. 准备提交前的材料,序列文件,格式必需是Fasta,扩展名不限,序列内容仅为常见的5种碱基(A/T/C/G/U),,联系信息,注意: 联系信息可保存,并导出为模板序列信息,用excel表列出该序列相关信息 例如:Organism、Isolate/Strain、Country、Collection-date、 Host、Serotype,一般仅在批量提交时需要准备序列信息Sequin操作步骤,,Sequin操作步骤,,Sequin操作步骤,,,Sequin操作步骤,接下来具体操作演示Thank you!,。












