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生物科学专业信息资源推介 数据库名称 BGI家蚕基因组数据库 BGISilkworm Database 数据库网址 28 条染色体，约 4.8 亿碱基 对，估计有基因 4 万个2003 年 11 月，中科院华大基因和西南农大等单位已率先完成家 蚕基因组“框架图“绘制工作，在此基础上构架家蚕基因组数据库系统包括国际最全的家 蚕基因组研究数据，包括突变体、EST、基因、重复序列等基因组信息服务方式：查询、 免费下载关键字家蚕基因组数据库名称韩国大米基因组数据库 Korea Rice Genome Database 数据库网址 http://bioserver.myongji.ac.kr/ricemac.html 数据库简介 KRGD 是韩国大米的基因数据库，它搜集有关韩国大米的所有基因数据库提供的 EST 序列查找 能够快速找到所要研究的基因的 EST数据库还提供韩国大米的基因图谱，帮助相对准确 地在基因组染色体上找到基因的定位KRGD 目前由韩国 Myongji 大学的生物科学系负责维 护管理服务方式：查询、免费下载关键字 Korea 韩国 rice 大米 genome 基因组数据库 名称线虫基因组数据库 AceDB 数据库网址 http://www.acedb.org/数据库简介 AceDB 是于 1989 年最初由 Jean ThierryMieg 和 Richard Durbin 开发的一个基因组数据库系统。

它 提供一个自定义数据库核心和一个特别设计的非标准数据模型以便灵活地处理科学数据， 以及一个绘图用户界面和许多特别的显示和基因组数据处理工具AceDB 用于管理基因组 计划内的数据和使基因组数据供科学界使用服务方式：查询、分析、免费下载关键字 AceDBgenome 基因组数据库名称线虫基因组预测蛋白数据库 WormPep  C.elegans Proteins db 数据库网址 http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep/数据库 简介 Wormpep 包括了线虫基因组中所有预测蛋白虫基因组数据库 AceDB 的基础上, 它共有 9,745,258 个碱基长度的基因预测的 22,246 个蛋白序列(其中 1705 个蛋白具有不同 的剪接本)搜寻方式可以使用蛋白序列、对应 cDNA 序列、序列的 CDS 编码和位置数据、 蛋白的 TREMBL 或 Swiss－Prot 编码等另外，提供基于 BLAST 的同源比对本数据库由线 虫基因组计划衍生出来，主要数据由英国 Sanger 中心、美国圣路易斯测序中心提供和更新 服务方式：查询、分析、免费下载。

关键字 elegan worm 线虫 predicted protein 预测蛋 白数据库名称盘基网柄菌基因组数据库 DictyDb －Dictyostelium discoideum Genome Database 数据库网址 http://dictybase.org/数据库简介盘基网柄菌基因组，包括染色体 以及线粒体的全部基因组数据库, 在细胞粘菌中，由于盘基网柄菌的生活史最简单，且发 育阶段分明，是极好的研究材料该数据库不仅提供了盘基网柄菌的基因组信息，还为盘 基网柄菌的序列提供了，已知及同源的基因列表，BLAST 服务器，染色体定位图，已完成 和进行中的基因敲除变异种的粘菌资料并提供了相关的盘基网柄菌 cDNA 文库的链接及使 用说明该数据库由加州 UCSD 大学的发育基因项目（DGP）支持服务方式：查询、免费 下载关键字盘基网柄菌 genome 基因组数据库名称枯草杆菌基因组数据库 BSORFBacillus subtilis Genome Database 数据库网址 http://bacillus.genome.ad.jp/数据库简介枯草杆菌基因组数据库是由日本枯草杆菌协会 建立的专业数据库。

该数据库收集的数据主要分为两类：以彩色图谱显示的基因组图谱以 及以列表形式出现的其他来源数据，如突变信息、DNA 芯片数据用户可以通过输入基因 名称、描述性字眼、分类号等方式进行查询，也可以直接输入序列检索是否是枯草杆菌的 基因组序列或基因组中的编码序列该数据库最近一次更新于 2003 年 9 月服务方式：查 询关键字 B. subtilis 枯草杆菌 genome 基因组数据库名称枯草杆菌基因组信息数据库 Bacillus subtilis Genetic Database 数据库网址 http://genolist.pasteur.fr/SubtiList/数据库简介该数据库介绍了枯草杆菌基因组的各 方面信息，它包含了 B. subtilis 168（枯草杆菌的模式菌种）4,214,630bp DNA，蛋白质 序列以及相关基因的注释和功能推测该数据库的信息主要来源于 EMBL/GenBank/DDBJ 数据库以及发表在国际杂志上或者相关方面科研工作者的报告，主要由 Institut Pasteur 维 护（法国的一个私人的非盈利性的疾病预防基金会） ，它提供了方便的查询系统，可以通过 输入基因名，基因的染色体定位以及功能分类进行查询，并可以对查出的序列进行 BLAST 等分析。

它的特色是提供了枯草杆菌彩色的染色体定位图，在图上的每一点均提供了链接， 介绍具体的基因定位及相关信息具有感官认识，可以方便查询服务方式：查询、免费 下载关键字 B. subtilis 枯草杆菌 genome 基因组数据库名称枯草杆菌全基因组、基因 图谱和密码子方面的数据库 NRSUBNonredundant B.subtilis Database 数据库网址 http://pbil.univlyon1.fr/nrsub/nrsub.html 数据库简介该数据库收录了枯草杆菌的 全基因组，并加入基因图谱和密码子方面的数据，可通过 web 方式查询，也可直接根据关 键字、序列名称或基因编号查询，并提供序列文件全文搜索库内总碱基数达 4214814 条； 可由 SWISSPROT, ENZYME 和 HOBACGEN 数据库参考相关基因家族；所有基因图谱位置由电 脑计算得出，精确度为 0.1维护单位包括日本国家遗传所、法国里昂大学遗传学和群体 生物学实验室、法国巴斯德学院基因表达调控系及瑞士生物信息学学院服务方式：查询、 免费下载关键字 B. subtilis 枯草杆菌 genome 基因组数据库名称酵母基因组数据库 Saccharomyces Genome Deletion Project 数据库网址http://sequencewww.stanford.edu/group/yeast_deletion_project/deletions3.html 数据库简介酵母基因组数据库提供了 Saccharomyces cerevisiae （酿酒酵母）基因组及 其开放阅读框（open reading frame, ORF）功能的很多相关信息。

其中开放阅读框的功能 是通过基于基因剔除的 PCR 技术和突变的遗传分析获得的数据库内容包括：不同的 ORFs 剔除品系、ORFs 剔除所用的引物序列、重要的 ORFs 等此外，该数据库给出了很多技术 和方法相关的文献并可以与 YDPM 数据库（Yeast Deletion Project and Mitochondria Database）等相链接，它由 Saccharomyces Genome Deletion Project Consortium（酵母 基因组剔除研究计划协会）维护服务方式：查询2005, 25(11)中国生物工程杂志 China Biotechnology 中国生物工程杂志 China Biotechnology Vol.25 No.11 2005 关键字 Saccharomyces cerevisiae 酿酒酵母 genome 基因组数据库名称蓝细菌基因组数据 库 CyanoBaseThe Genome Database of Cyanobacteria 数据库网址 http://www.kazusa.or.jp/cyano/cyano.html 数据库简介蓝细菌基因组数据库可以获得关 于蓝细菌基因组结构的序列和全部解释资料。

它最初由 Makoto Hirosawa, Takakazu Kaneko 和 Satoshi Tabata 创办，现在的版本由 Kazusa DNA 研究所 Yasukazu Nakamura, Takakazu Kaneko 和 Satoshi Tabata 发展并维护生氧光合作用是地球上的最基本的生命 过程，蓝细菌带有生氧光合作用的全部基因该有机物出现于非常古老的年代，可以在多 种环境下生存该数据库还提供了很多其它菌类或藻类相关的链接，便于用户查找相关信 息服务方式：查询关键字蓝细菌 genome 基因组数据库名称细胞器基因组数据库 GOBASE  The Organelle Genome Database 数据库网址 http://megasun.bch.umontreal.ca/gobase/数据库简介 GOBASE细胞器基因组数据库由 加拿大健康研究院(CIHR)和加拿大医学研究委员会（MRC）资助，2003 年 12 月建立，由 Canada Dalhousie University 维护整合了与线粒体和叶绿体相关的各种数据，今后将 包含细菌的信息核酸和蛋白数据来源于 NCBI 的 Entrez 数据库，分类信息来源于 NCBI 的 Taxon 数据库。

提供到 PID, Entrez, Blast 等的链接，界面友好，便于查询服务方式： 查询关键字细胞器 genome 基因组数据库名称基因组数据库 GOLD  Genomes Online db 数据库网址 http://www.genomesonline.org/数据库简介基因组数据库 （GOLD）在国际网内提供全世界已完成的和正在进行的基因组项目，其中有 315 个已发表 的完成的基因组项目和正在进行的 804 个原核生物的基因组项目和 547 个真核生物的基因组项目服务方式：查询关键字 genome 基因组数据库名称人类基因组图谱标准数据库 GeneLocThe Unified Database for Human Genome Mapping (UDB)数据库网址 http://genecards.weizmann.ac.il/geneloc/数据库简介人类基因组图谱标准数据库， GeneLoc 整合了包括 Genethon, NCBI，基因组数据库等在内的多个数据库的资料，统一了 基因的收集，剔除了冗余的部分，并且赋予每一个基因有意义的定位标识符，也叫作基因 卡片 ID。

GeneLoc 包含了人类所有染色体的基因整合信息，此外，与基因平行的 DNA 片段 信息也包含在其中它为用户提供了友好的检索界面，用户可以根据染色体的位置，基因 名称，基因登记号等方式查询基因的具体定位并为初学者提供了检索实例该数据库由 以色列生物信息 & Crown 人类基因组研究中心支持维护服务方式：查询关键字 human 人类 genome 基因组数据库名称人类组织的全基因组数据库 HOWDYHuman Organised Whole Genome Database 数据库网址 http://gdb.jst.go.jp/HOWDY/top_en.pl 数据库简介 人类组织的全基因组数据库是一个数据库系统为检索人的染色体信息并供给公众的不同的 数据源您能发现这里的信息从基因数据库自动地被提取和被显示以所有数据有标识符， 共同兴趣和链接的数据。