蛋白质计算专题.ppt

蛋白质计算专题恩施清江外国语学校 彭邦凤蛋白质计算的几种类型1.1.已知氨基酸、肽链数目，求肽键数、失水数已知氨基酸、肽链数目，求肽键数、失水数和氨基、羧基数目和氨基、羧基数目2.2.已知氨基酸种类，求形成多肽的种类已知氨基酸种类，求形成多肽的种类 3.3.已知蛋白质（多肽）的分子式，求形成该蛋白已知蛋白质（多肽）的分子式，求形成该蛋白质的某种质的某种AAAA的数目的数目 4.4.与基因控制蛋白质合成有关的蛋白质计算与基因控制蛋白质合成有关的蛋白质计算 5.5.与化学有关的计算（利用反应前后平均相对分与化学有关的计算（利用反应前后平均相对分子质量守恒进行计算）子质量守恒进行计算）1 1条肽链条肽链n n条肽链条肽链氨基酸平均相氨基酸平均相对分子质量对分子质量a aA A氨基酸数目氨基酸数目mmmm肽键数目肽键数目m-1m-1m-nm-n脱去水分子数脱去水分子数m-1m-1m-nm-n多肽相对分多肽相对分子质量子质量ma-ma-（（m-1m-1））* *1818ma-ma-（（m-nm-n））* *1818氨基数目氨基数目至少至少1 1个个至少至少n n个个羧基数目羧基数目至少至少1 1个个至少至少n n个个RNARNA含含N N碱基碱基3m3m（至少）（至少）3m3m（至少）（至少）DNADNA含含N N碱基碱基6m6m（至少）（至少）6m6m（至少）（至少）已知氨基酸求多肽（直链）分子质量、已知氨基酸求多肽（直链）分子质量、RNARNA、、DNADNA碱基数碱基数1 1条肽链条肽链n n条肽链条肽链DNADNA含含N N碱基碱基X XX XRNARNA含含N N碱基碱基X/2X/2（最多）（最多）X/2X/2（最多）（最多）氨基酸平均相氨基酸平均相对分子质量对分子质量a aA A氨基酸数目氨基酸数目X/6 X/6 （最多）（最多）X/6 X/6 （最多）（最多）肽键数目肽键数目X/6 -1X/6 -1X/6 -nX/6 -n脱去水分子数脱去水分子数X/6 -1X/6 -1X/6 -nX/6 -n多肽相对分多肽相对分子质量子质量Xa/6-Xa/6-（（X/6-1X/6-1））* *1818Xa/6-Xa/6-（（X/6-X/6-n n））* *1818氨基数目氨基数目至少至少1 1个个至少至少n n个个羧基数目羧基数目至少至少1 1个个至少至少n n个个已知已知DNADNA（（RNARNA）碱基数，求多肽（直链）分子质量）碱基数，求多肽（直链）分子质量。

1.已知氨基酸、肽链数目，求肽键数、失水数和氨基、羧基数目 例如：人的血红蛋白是由例如：人的血红蛋白是由574574个氨基酸构成，共计形成个氨基酸构成，共计形成4 4条多肽链，则形成的血红蛋白共失去水分子条多肽链，则形成的血红蛋白共失去水分子________个直链多肽：直链多肽：肽键数肽键数= =失水数失水数= =消耗的氨基、羧基数消耗的氨基、羧基数= =AAAA数数- -肽链数肽链数环状多肽：环状多肽：肽键数肽键数= =失水数失水数= =消耗的氨基、羧基数消耗的氨基、羧基数= =AAAA数数环状多肽：环状多肽：游离的氨基（羧基）数游离的氨基（羧基）数=AA=AA反应前氨基（羧基）数反应前氨基（羧基）数- -AAAA数数直链多肽：直链多肽：游离的氨基（羧基）数游离的氨基（羧基）数=AA=AA反应前氨基（羧基）数反应前氨基（羧基）数- -消耗的氨基（羧基）数消耗的氨基（羧基）数2.已知氨基酸种类，求形成多肽的种类 例：现有A、B、C、D、E5种AA，让它们足量混合能够形成五肽多少种？包含这5种AA的五肽有多少种？可以重复时可以重复时5 55 55 55 55 5不能重复时不能重复时5 54 43 32 21 13.已知蛋白质（多肽）的分子式，求形成该蛋白质的某种AA的数目。

例例2 2现有一种现有一种“ “十二肽十二肽” ”，分子式为，分子式为CxHyNzOdCxHyNzOd（（z z＞＞1212，，d d＞＞1313）已知将它彻底的水解后只得到下列）已知将它彻底的水解后只得到下列AAAA：：例例1 1资料例3 3 问：将一个问：将一个“ “十二肽十二肽” ”彻底水解后，可生成彻底水解后，可生成__________个个赖氨酸和赖氨酸和____________个天门冬氨酸个天门冬氨酸思考：现有一种“十二肽”，分子式为CxHyNzOdS（z＞12，d＞13）已知将它彻底的水解后只得到下列AA： 问：将一个问：将一个“ “十二肽十二肽” ”彻底水解后，可生成彻底水解后，可生成__________个个赖氨酸、赖氨酸、____________个天门冬氨酸和个天门冬氨酸和____________个半胱氨酸个半胱氨酸例1：若某多肽由X个AA脱水缩合而成，则控制合成该蛋白质的基因中至少含有多少个含N碱基？ 4.与基因控制蛋白质合成有关的蛋白质计算例2：若某基因中有1200个碱基，则该基因控制合成的蛋白质中最多有多少个氨基酸？5.与化学有关的计算（利用反应前后平均相对分子质量守恒进行计算）例例1 1：称取某多肽：称取某多肽415g415g，在小肠液的作用下完全水解得到，在小肠液的作用下完全水解得到氨基酸氨基酸505g505g。

经分析知道组成此多肽的氨基酸平均相对经分析知道组成此多肽的氨基酸平均相对分子质量为分子质量为100100，此多肽由甘氨酸、丙氨酸、半胱氨酸，此多肽由甘氨酸、丙氨酸、半胱氨酸3 3种氨基酸组成，每种氨基酸组成，每molmol此多肽含有此多肽含有S S元素元素51mol51mol3 3 种氨种氨基酸的分子结构式如下：基酸的分子结构式如下：问：小肠液为多肽的水解提供的物质是？组成问：小肠液为多肽的水解提供的物质是？组成1 1分子这种分子这种多肽需多肽需AAAA多少个？这种多肽多少个？这种多肽3 3种种AAAA的数量比是多少？控的数量比是多少？控制这种多肽合成的基因片段至少有多少个脱氧核苷酸？制这种多肽合成的基因片段至少有多少个脱氧核苷酸？例例2 2：称取某多肽：称取某多肽409g409g，在消化液的作用下完全水解得到，在消化液的作用下完全水解得到氨基酸氨基酸463g463g经分析该多肽分子式为经分析该多肽分子式为C C1414H H2727O O5 5N N5 5S S2 2，且，且仅由仅由3 3种种AAAA组成据此回答：组成据此回答：⑴⑴作为该多肽合成的直接模块作为该多肽合成的直接模块mRNAmRNA上至少需要上至少需要__________个个密码子（不考虑起始密码和终止密码），多肽在合成时密码子（不考虑起始密码和终止密码），多肽在合成时共脱去共脱去_____molH_____molH2 2O O。

⑵⑵组成该多肽的组成该多肽的3 3种氨基酸可能是种氨基酸可能是( (填字母填字母)___)___、、______、、____计算涉及的相关知识和原理•物质守恒：即反应前后物质总量不变，包括各种原子的个数、特征原子的个数、平均相对分子质量等•中心法则：关于转录和翻译的相关内容•基因的结构：基因的非编码区、真核基因的内含子、mRNA的终止子等。