
基于网络药理学探讨龙芩定眩颗粒治疗眩晕的作用机制.docx
17页基于网络药理学探讨龙芩定眩颗粒治疗眩晕的作用机制 董晗硕 高翔宇 刘寅 潘韦韦 孙莉[Summary]目的運用网络药理学分析龙苓定眩颗粒治疗眩晕的具体作用机制方法应用TCMSP数据库、PubChem及Swiss Target Prediction数据库筛选龙苓定眩颗粒有效活性成分及对应靶点应用TTD、DrugBank数据库筛选眩晕疾病靶点,取成分与疾病靶点交集进行可视化处理及拓扑参数分析,应用STRING 数据库进行蛋白相互作用分析,DAVID数据库进行GO及KEGG pathway富集分析结果获得龙芩定眩颗粒活性成分65个,625个靶点,眩晕181个疾病靶点,两者共同靶点30个,通过GO富集分析,获得生物学过程(BP)69个,细胞组分(CC)9个,分子功能(MF)21个,其中BP主要涉及药物反应、药物代谢过程、单萜代谢过程,CC主要涉及质膜的组成部分、质膜、细胞器膜,MF咖啡因氧化酶活性、酶结合、组胺受体活性等通过KEGG富集分析富集到14条通路,主要涉及神经活性配体-受体相互作用、化学致癌作用、钙信号通路等结论龙芩定眩颗粒可通过多途径、多靶点治疗眩晕[Key]网络药理学;龙苓定眩颗粒;眩晕;作用机制[]R285 []A []2095-0616(2022)05-0014-05Discussion on the mechanism of Longqin Dingxuan Granules in treating vertigo based on network pharmacologyDONG Hanshuo1 GAO Xiangyu2 LIU Yin1 PAN Weiwei3 SUN Li1l.Department of Geriatrics,Jilin Academy of Chinese Medicine Sciences,Jilin,Changchun 130021,China;2.Directly Cadres Health Care Office of Jilin Province,Jilin,Changchun 130051,China;3.Changchun Medical Collage,Jilin,Changchun 130031,China[Abstract] Objective Network pharmacology was used to analyze the specific mechanism of Longqin Dingxuan Granules in treating vertigo. Methods Application TCMSP database,PubChem and Swiss Target Prediction database screening effective active ingredient and the corresponding targets of Longqin Dingxuan Granules. Apply TTD and DrugBank database screening targets of vertigo disease,take the intersection of components and disease targets for visualization and analysis of topological parameters,use STRING database for protein interaction analysis,and DAVID database for GO and KEGG pathway enrichment analysis. Results Get Longqin Dingxuan Granules 65 active ingredient,625 target,181 Vertigo diseases targets,30 common targets,through the analysis of the enrichment of the GO for 69 biological processes (BP),9 cell components (CC),21molecular function (MF). BP is mainly involved in drug reaction,drug metabolism process and monoterpene metabolism process,CC is mainly involved in plasma membrane components,plasma membrane,organelle membrane,MF caffeine oxidase activity,enzyme binding,histamine receptor activity,etc. Enrichment 14 pathway through KEGG,mainly related to neural activity ligand receptor interaction,chemical carcinogen,calcium signaling pathways,etc. Conclusion Longqin Dingxuan Granules can treat vertigo through multiple ways and multiple targets.[Key words] Network pharmacology;Longqin Dingxuan Granules;Vertigo;Mechanism头晕和眩晕是临床最常见的症候临床症状,是门、急诊就诊患者描述最多的临床症状之一[1]。
有调查显示,眩晕的患病率达20%~30%,年患病率5%,年复发率1.4%[2]国外流行病学调查显示,35%的患者头晕每天发作,51%的患者每月均有发作,患病年龄以45~64岁为主[1-2]有80%的前庭性眩晕患者会就医,复发率可达88%,同时还可引起心理疾患[3],严重者累及身心健康可见该疾病的发病率及复发率较高,甚至影响人们日常工作和生活质量,已引起临床的重视中医对眩晕的研究历史悠久,有“諸风掉眩,皆属于肝”“无风不作眩”“无虚不作眩”“髓海不足,则脑转耳鸣,胫酸眩冒”等诸家学说孙莉教授带领的团队根据多年临床经验提出了眩晕病“病位在心脑”的新理论,即神明其源在心脑,藏于脑而用于心,脑为神明之体,心主神明急性期治疗以泻火平肝、安神定眩为主,拟龙芩定眩颗粒方,其加减方作为院内制剂广泛应用于临床中,治疗眩晕(前庭性偏头痛),临床疗效显著,可以预防和延缓眩晕的发作频率,进而减轻眩晕发作程度龙芩定眩颗粒由龙胆草、黄苓、车前子、山栀子、瞿麦、柴胡、当归、生地黄、茯神、水牛角组成,泻火的同时兼有安神功效,降中寓升,祛邪而不伤正,泻火而不伐胃,使火降热清,神明得安,眩晕诸症皆可相应而愈,但其具体作用机制尚不明确。
本研究采用网络药理学方法探讨龙苓定眩颗粒治疗眩晕的具体分子机制,为其临床应用提供客观依据1 材料与方法1.1 中药活性成分及对应靶点筛选中药系统药理学数据库与分析平台TCMSP数据库(https:// 苓、黄苓、栀子、瞿麦、车前子、熟地黄、当归、柴胡,筛选龙苓定眩颗粒活性成分,ADME参数筛选条件:口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥30%,类药性(drug-likeness,DL)≥0.18,筛选龙芩定眩颗粒有效化合物活性成分,将筛选出来的有效活性成分在Pubchem数据库中查询相应的SMILE结构(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/),再通过 Swiss Target Prediction 数据库(http://www.swisstargetprediction.ch/)预测候选成分对应的靶点1.2 眩晕疾病靶点筛选应用DisGeNET数据库(http://www.disgenet.org/web/DisGeNET/menu/home)、TTD数据库(http:// 数据库(https:// Vertigo”“Vertigo”,筛选疾病靶点。
1.3 中药成分—疾病靶点网络构建将筛选出的龙苓定眩颗粒成分靶点与眩晕靶点输入Venny 2.1.0(https://b.csic.es/tools/venny/index.html)绘制韦恩图,将疾病与药物共同作用靶点导入String数据库(https://string-db.org/),构建成分疾病共同靶点的PPI网络,同时运用Cytoscape 3.2.1软件进行成分-网络结构可视化处理及拓扑结构分析1.4 靶点生物功能注释及通路分析应用DAVID 数据库(https://david.ncifcrf.gov/)对筛选出的两者共同靶点进行GO富集分析,包括生物学过程(biological process,BP)、细胞组成(cellular component,CC)、分子功能(molecular function,MF),及KEGG 通路富集分析,P<0.05 作为靶点的筛选标准通过分析富集分析的功能条目,考察龙苓定眩颗粒治疗眩晕可能干预的生物学功能及通路,并运用Omicshare数据库(https://www. 2 结果2.1 龙苓定眩颗粒主要活性成分及靶点筛选TCMSP数据库中,龙苓定眩颗粒中筛选后去掉未查询到靶点化合物,共得到活性成分65个,去掉重复靶点,共筛选得到625个作用靶点。
见表12.2 眩晕的靶点筛选通过DisGeNET数据库、TTD数据库及DrugBank 数据库,共筛选出靶点181个2.3 龙苓定眩颗粒及眩晕共同靶点及PPI网络构建将中药成分靶点与疾病靶点输入Venny 2.1.0绘制韦恩图,取得两者共同靶点30个,见图1将共同靶点导入String数据库构建共同靶点的蛋白相互作用网络,获得节点数30、边数86,平均节点度为5.73,平均局部聚类系数为0.505,PPI富集P<1.0e2.4 龙苓定眩颗粒成分-靶点相互作用网络构建运用Cytoscape 3.2.1软件对龙苓定眩颗粒与眩晕的共同成分靶点进行网络结构可视化处理,见图2进行拓扑结构分析,主要核心靶点(Degree 值前10):ACHE、ABCB1、MAOA、SHBG、OPRM1、CYP1A1、PGR、CYP1A2、CALM1、GRM5主要核心活性成分:欧前胡素(Ammidin)、粗毛豚草素(Dinatin)、川白芷内酯[(+)-Anomalin]、刺槐素(acacetin)、甘露糖醇(Cerevisterol)、鼠尾草素(Salvigenin)等2.5 龙苓定眩颗粒-眩晕共同靶点GO及KEGG通路富集分析应用DAVID数据库及Omicshare数据库将筛选出的两者共同靶点进行GO(BP、CC、MF)富集及KEGG Pathway功能富集分析,P<0.05作为靶点的筛选标准。
富集结果用气泡图显示前20个分析结果见图3~63 讨论中药复方的作用特点是“多成分、多途径、多靶点”的协同作用[4]网络药理学是一门新兴学科[5],通过结合各种组。












