
《DNA顺式作用元》PPT课件.ppt
12页DNADNA顺式作用元件顺式作用元件 制作人:李静制作人:李静 2012110205 作物栽培学与耕作学作物栽培学与耕作学内容简介内容简介顺式作用元件概述顺式作用元件概述顺式作用元件结构顺式作用元件结构顺式作用元件与反式作用因子关系顺式作用元件与反式作用因子关系同一同一DNA分子中具有转录调节功能的特异分子中具有转录调节功能的特异DNA序列定义定义化学本质化学本质存在于存在于DNA分子中的较短的分子中的较短的DNA序列序列顺式作用元件概述顺式作用元件概述顺式作用元件在分子遗传学领域,相对同一染色体或顺式作用元件在分子遗传学领域,相对同一染色体或DNA分子而言为分子而言为“顺式顺式” ;对不同染色体或;对不同染色体或DNA分子而言为分子而言为“反式反式”顺式作用元件结构顺式作用元件结构顺式作用元件结构顺式作用元件结构(一)启动子(一)启动子 启动子一般位于真核基因转录起始点上游200bp以内包括至少一个转录起始点以及一个以上的机能组件盒盒 TATA盒共有序列是TATAAAA,通常位于转录起始点上游-25~-30bp,决定转录的方向和精确的转录起始点。
TATA盒是基本转录因子TFIID结合位点2.起始子起始子 在一些真核基因的上游没有典型的TATA盒,但在某些无TATA盒的基因转录起始点附近发现了起始子元件INR,一般将位于转录起始点下游的调控序列称为下游起始子3.上游启动子元件上游启动子元件 除TATA盒外,GC盒(GGGCGG)和CAAT盒(GCCAAT)也是很多基因常见的,它们通常位于转录起始点上游-30~-110bp区域顺式作用元件结构顺式作用元件结构(二)调节元件(二)调节元件 一般位于基因转录起始点上游-200bp以上区域的顺式作用元件,包括增强子和沉寂子1.增强子增强子 起正调控作用的顺式元件,位于真核基因中远离转录起始点,能明显增强启动子转录效率的顺式作用元件,它对方向和定位无依赖性一般具有组织特异性和细胞特异性序列长度一般在70~200bp之间,基本核心组件常为8~12bp,部分序列有回文结构特征,可以单拷贝或多拷贝串联形式存在2.沉寂子沉寂子 和起正调控作用的增强子相对应的是起负调控作用的沉寂子它的功能不受定位和方向的限制与相应的反式作用因子结合后,可降低或封闭某些基因的表达。
增强子和沉寂子协调可决定基因表达的时空顺序3.转座元件转座元件 一些DNA序列在染色体上的座位可以在一系列的靶位点之间插入或移出,此系列称为转座元件顺式作用元件与反式作用因子关系顺式作用元件与反式作用因子关系反式作用因子:与顺式作用元件结合的可扩散性蛋白,包括基础因子,上游因子,诱导因子真核生物的转录调控是调控的最重要的途经,大多是通过顺式作用元件和反式作用因子复杂的相互作用而实现的顺式作用元件与反式作用因子关系顺式作用元件与反式作用因子关系1.顺式作用元件本身不编码任何蛋白质,仅仅顺式作用元件本身不编码任何蛋白质,仅仅提供一个作用位点,只有与反式作用因子相互提供一个作用位点,只有与反式作用因子相互作用才起作用作用才起作用2.反式作用因子通过不同的途经发挥调控作用,反式作用因子通过不同的途经发挥调控作用,它们与特异的靶基因的顺式元件相结合起作用它们与特异的靶基因的顺式元件相结合起作用 反式作用因子一般具有两大类结构域:一反式作用因子一般具有两大类结构域:一类是识别和结合特异类是识别和结合特异DNA顺式作用元件所必需顺式作用元件所必需的,一类是调节转录基因效率所必需的。
两类的,一类是调节转录基因效率所必需的两类结构域具有不同的特征,但同一类结构域具有结构域具有不同的特征,但同一类结构域具有一些共同的结构特点一些共同的结构特点反式作用因子结构域类型反式作用因子结构域类型1.螺旋螺旋-转折转折-螺旋螺旋有有2个螺旋,螺旋个螺旋,螺旋2是识别和是识别和DNA结合,一般结合于大沟;螺旋结合,一般结合于大沟;螺旋1和其它蛋白质结合两个螺旋由一个转角链接和其它蛋白质结合两个螺旋由一个转角链接2.锌指锌指锌指这个名称来源于它的结构,它由一小组保守锌指这个名称来源于它的结构,它由一小组保守 的氨基酸和锌离的氨基酸和锌离子结合,在蛋白质中形成了相对独立的功能域,像一根根手指伸子结合,在蛋白质中形成了相对独立的功能域,像一根根手指伸向向DNA的大沟3、亮氨酸拉链、亮氨酸拉链两个蛋白质分子对应的螺旋区之间的两行亮氨酸通过疏水性相互两个蛋白质分子对应的螺旋区之间的两行亮氨酸通过疏水性相互作用形成作用形成1个类似拉链的结构,称为亮氨酸拉链对形成稳定的蛋个类似拉链的结构,称为亮氨酸拉链对形成稳定的蛋白二聚体十分重要白二聚体十分重要4、螺旋一环一螺旋、螺旋一环一螺旋有有2个螺旋,螺旋中有些疏水氨基酸,分布在螺旋一侧。
螺旋间个螺旋,螺旋中有些疏水氨基酸,分布在螺旋一侧螺旋间被长短不同的肽断分隔而形成的结构被长短不同的肽断分隔而形成的结构反式作用因子结构域类型反式作用因子结构域类型反式作用因子结构域类型反式作用因子结构域类型 反式作用因子通过不同的结构域与不同反式作用因子通过不同的结构域与不同DNA顺式作用元件互作用来实现真核基因的转录调顺式作用元件互作用来实现真核基因的转录调控机制反式作用因子结构域类型反式作用因子结构域类型 反式作用因子通过不同的结构域类型与不反式作用因子通过不同的结构域类型与不同同DNA顺式作用元件相互作用,来实现真核顺式作用元件相互作用,来实现真核基因的转录调控机制基因的转录调控机制谢谢!谢谢!。