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MEGA5.05使用教程.ppt

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卖家[上传人]：人***

文档编号：590494825

上传时间：2024-09-14

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MEGA常用工具及使用方法常用工具及使用方法超通俗版本超通俗版本将拼好后的序列和下载的序列填在一个txt文档中保存后，将文件后缀由 .txt 改成 .fas打开软件，点击菜单栏File，选择open a file，打开刚才的.fas文件弹出窗口后选择Align弹出副窗口在主窗口中，点击上方工具栏W标志，将序列比对对齐序列对齐，修饰后，点击工具栏保存图标，将文件进行保存格式为mas格式保存后关闭上一个副窗口，回到主窗口，重新在File中打开刚保存的.mas格式的文件弹出新的副窗口（序列已对齐）在工具栏Data中打开刚才保存的.mas文件，Analysis分析，可在主窗口中出现TA图标（如图）点击TA图标，可弹出小窗口，由次窗口可知简约信息位点，不变位点等信息点击工具栏statistics，选择第一项进行核酸比较，可在excel表中导出碱基组成信息点击主窗口中Distance中的第一项，可对物种之间遗传距离进行计算注意Bootstrap参数设置（一般为1000）模型选用Kimura双参数模型进行计算点击Computr进行计算关于遗传关于遗传距离距离关于系统关于系统发育树发育树点击主窗口中Phylogeny下选择想用的算法（最大似然法ML或者是邻接法NJ），一般选用ML。

各参数设置如图，点击Computr进行计算，构建出一个系统发育树左侧工具栏可对树的拓扑结构进行调整点击保存，将文件保存成mts格式（仅可以用MEGA打开）也可以点击上方工具栏中的Image，save as 为其他格式若想更改字体，可将文件保存成PDF格式后，用Adobe Illustrator CS5对其进行修改。

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