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DNA的结构与功能.ppt

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    • DNA的结构廖露 2DNA的结构•￿￿￿1.￿DNA的一级结构•￿￿￿2.￿DNA的二级结构•￿￿￿3.￿DNA的三级结构•￿￿￿4.￿真核生物DNA的三级结构•￿￿￿5.￿DNA的性质 DNA的一级结构3•￿￿DNA分子中各脱氧核苷酸之间的连接方式(3￿´￿-5´￿磷酸二酯键)和排列顺序叫做DNA的一级结构,简称为碱基序列•￿￿一级结构的走向规定为5´￿→3´￿5´3´ DNA一级结构的表示法45´3´结构式结构式5´3´ p p p pOH3´ACTG1´线条式线条式5´ ACTGCATAGCTCGA 3´字母式字母式 DNA一级结构的基本特点51、双链反向平行配对而成2、脱氧核糖和磷酸交替连接,构成DNA骨架,￿￿￿￿￿￿￿￿碱基排在内侧3、内侧碱基通过氢键互补形成碱基对(A:T,C:G)4、DNA在碱性条件下稳定性强,不断裂pH=11.5时仍稳定,而RNA易被碱水解 2.￿DNA的二级结构6•1953沃森和克里克根据DNA纤维X射线晶体衍射图,提出了DNA分子结构的双螺旋模型Francis Crick and James Watson (获1962年诺贝尔生理学医学奖) DNA双螺旋的基本特征7•￿￿两条链反向平行,围绕同一中心轴构成右手双螺旋。

      •￿￿相临碱基对间距离为0.34nm,每周螺距为3.4nm￿(10bp),￿￿d为￿2nm•￿￿双螺旋有两种不同的沟(大沟和小沟)大沟携带分子可识别信息,是蛋白质识别DNA碱基序列产生相互作用的基础 DNA双螺旋结构稳定因素81.￿碱基对间的氢键￿2.￿碱基堆积力￿(1)相邻碱基对间的范德华力(2)碱基对间的疏水作用力3.￿磷酸基上负电荷被胞内组蛋白或正离子中和,降低静电张力 DNA双螺旋类型9A-DNA￿￿￿￿￿￿￿￿20￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿0.26￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿2.6￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿11￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿右B-DNA￿￿￿￿￿￿￿￿6￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿0.34￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿2.0￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿10￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿右Z-DNA￿￿￿￿￿￿￿￿7￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿0.37￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿1.8￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿12￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿左双螺旋￿￿￿￿￿￿碱基倾角/(￿￿碱基间距/nm￿￿￿￿螺旋直径/nm￿￿￿每轮碱基数￿￿￿螺旋方向 3.￿DNA三级结构10DNA在细胞内以双螺旋为基础进一步旋转折叠成超螺旋结构。

      超螺旋正超螺旋负超螺旋盘绕方向与DNA双螺旋方向相同盘绕方向与DNA双螺旋方向相反Ø￿￿DNA超螺旋结构 11DNA超螺旋是由DNA拓扑异构酶(拓扑异构酶Ⅱ)产生的环状DNA分子常以超螺旋结构存在,并以负超螺旋为主,有利于转录的起始 4.￿真核生物DNA的三级结构12•￿￿真核生物DNA与蛋白质形成非常致密的复合物存在于细胞核内,基本结构式核小体核小体DNA组蛋白H2A、H2B、H3、H4:八聚体核心组蛋白H1:连接区 核小体的结构 核小体链(核小体链( 11nm,,每个核小体每个核小体200bp))纤丝(纤丝( 30nm,,每圈每圈6个核小体)个核小体)突环(突环( 150nm,,每个突环大约每个突环大约75000bp))玫瑰花结(玫瑰花结( 300nm ,,6个突环)个突环)螺旋圈(螺旋圈( 700nm,,每圈每圈30个玫瑰花)个玫瑰花)染色体(染色体( 1400nm,,每个染色体含每个染色体含10个玫个玫瑰花瑰花200bp))--人的染色体压缩人的染色体压缩8000-10000DNA ((2nm)) 核小体盘绕及染色体示意图15 DNA的性质16Ø￿￿DNA的变性•￿￿定义:某些理化因素会导致DNA双链互补碱基之间的氢键发生断裂,使双链DNA解离为单链。

      只改变DNA的二级结构,不改变它的核苷酸序列•￿￿变性因素:过量酸、碱,加热,离子强度改变等•￿￿变性后理化性质的主要改变:￿￿￿￿￿￿￿￿￿粘度下降￿￿￿￿￿￿￿￿￿比旋光度下降￿￿￿￿￿￿￿￿￿OD260增色(增色效应) 17DNA变性的本质是双链间氢键的断裂 18•￿￿￿DNA的增色效应￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿￿—DNA变性时其溶液OD260值增高 19•￿￿￿解链曲线(melting￿curve)•￿￿解链温度(溶解温度,Tm)在解链过程中,UV吸收值的变化达到最大变化值一半时对应的温度,此温度时,50%DNA双链打开•￿￿Tm值与DNA均一性和长短、碱基GC含量、溶液离子强度、相关,GC含量越高,Tm值越高 20•￿￿Tm值的计算及应用￿￿￿￿Tm=69.3+0.41￿×(G+C)/(G+C+A+T)￿×100%￿￿￿小于20bp的寡核苷酸片段￿￿￿￿Tm=4(G+C)+2(A+T)PCR退火温度比Tm值低4~6℃ 21Ø￿￿DNA的复性•￿￿定义:DNA回复成双链结构,称为复性•￿￿影响复性的因素:￿￿￿￿￿￿样品的性质、DNA片段的大小、DNA浓度、温度、离子强度等。

      •￿￿复性后理化性质的改变:￿￿￿￿￿￿￿粘度增大;比旋光度变大;￿OD260下降(低色效应) 22热变性经冷却后即可复性,称为退火高于Tm值5℃ 复性 也称退火 23谢谢谢谢 。

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