怎样使用MEGA建立进化树.doc

如何使用 MEGA4.0建立进化树1首先是双击软件打开如下图所示:Trnes NWi1 R-dtoi f:曲脚护 V 白苗翼解u^・、、匚I O上J」■< *_•型丿L SQB ii [■家■a H 曲茁哥：陌| Lfll ¥■F-ju MEGA 4.0jU画 M4: Alignment Explorer 1 o 丨回 西Data Edit Search Alignment Web Sequencer Display Helpj 口瞎乂色X韓|骼酋|\ <►DMA Sequencer T ranslaAed Protein Sequences |i2、现在是处于 DNA序列，而我们要做蛋白质的进化树的话，就如下操作[M] M4: Alignment ExpforerData EditSearch Alignment Web Sequencer Di$|Dlay Help]□ Q *躊宅通iffi |附臺耳Protein Sequences ]sI骼色I3、接下来我们要进行序列的输入，点击 左边那个红箭头，则出现下 面的窗口;M4： Alignment ExplorerData Edit Search Alignment Web Seque□ f h^T w ■ tG社人亀 丼，幅i® 引!►4、然后右击sequenee 1,修改名字，如改成 DPV』 'U Protein Sequences |5、然后从Word里复制蛋白质序列，然后在下面的位置粘贴则M4：从严伽1 EjpkrfM。

4也（EdiT SWfch ABgrflX'i'：Web S^qwwirtXspUjr 阳 pD 严Ort+ZICld*COH+Xd pjidc L X &eiM*切神I2LessB Insert Bhanlc S^qitienceClrUM售 Frbfrt Fit* ICrh t]54rt«（ $Me（$）—Sel«t S»QuHK*；f）■ Ski A* E** 副GW &4W tdrtlng6则可出现如下图的序列了J D G»窟躊|毒©騙|闪■ t j门电為IS X共I牺酸I」》Protein Sequences .7、 然后点击窗口上的保存图标保存8、 重复从3开始，直到你的序列输入完9、 序列输入完后进行最后的保存，方法如下:要输入ul7两次保存名字一然后关闭这个窗口 接下来打开回MEGA 4.02=TAU(70*订”Ci!：吨 XZEG.Go to the Al出现下面这个窗口!MtGA 4盟Data File22:2205E:\M aster\leam(ng\ huangjie^ 发的乂章 \EI \pr ol einW EGA4-0\d7. megFite Data Distances Phylogeny Pattern Selection Alignment Windows Help曲 VEGA402當 frnntfr SMup -Corwt To MEG4 Foittm< “ Ten Ed^O* — FJrSt~ Phjto^wri^ jjjgwrrl wlndom HdpR^oppn Data:Rl« gtA 曲rwtf 卅Mogefiy PMtGMA^Bootstrip T*U 制 Nfytog*ny *芒［nr-wtoc Branch Terit of 叶筒^的$ *G Rdaeiv* RM* Tm$ *接下来就可以建立各种样式的进化树!嗯，只是把过程写出来，方便大家建立进化树，不足的地方，大家补充好!。