好文档就是一把金锄头!
欢迎来到金锄头文库![会员中心]
电子文档交易市场
安卓APP | ios版本
电子文档交易市场
安卓APP | ios版本

imagelab软件中文指导.pdf

44页
  • 卖家[上传人]:ali****an
  • 文档编号:118713126
  • 上传时间:2019-12-23
  • 文档格式:PDF
  • 文档大小:1.57MB
  • / 44 举报 版权申诉 马上下载
  • 文本预览
  • 下载提示
  • 常见问题
    • 查看图像 47 5查看图像查看图像 一旦凝胶成像,图像便会显示在工作区中很多控件都可以优化查看效果并对图 像进行分析 结果概述结果概述 这是具有条带和泳道检测及注释功能的凝胶图像标记会识别可显示或隐藏的 图像覆盖请参阅显示凝胶选项 (第 48 页)获取完整信息 Gel DocTM EZ 系统 | 查看图像 48 有多种方式可以查看与结果关联的数据可以将数据作为分析表、泳道轮廓、标 准曲线和报告进行查看请参阅显示数据 (第 54 页) 显示凝胶图像显示凝胶图像 显示在第 47 页上的凝胶图像上方的工具栏图标以下部分将对每个工具进行 描述 显示凝胶选项显示凝胶选项 注释注释 可以选择是否显示图像上已绘制的文本和箭头注释 泳道和条带泳道和条带 可以打开或关闭任意图像覆盖,比如泳道框架、泳道、条带、泳道标记和分子量 图例 显示凝胶图像 49 条带属性条带属性 可以显示所选泳道或所有泳道的以下属性 •条带数 •条带标记 •分子量 •相对前沿 •体积 •绝对定量 •相对定量 •条带 % •泳道 % 体积体积 如果已在凝胶上绘制好体积边界,则可以显示体积边界及其体积标记 缩放工具缩放工具 缩放工具可以调整凝胶图像的大小。

      单击放大镜的“+”符号可以放大图像;单 击 “-” 符号可以缩小图像 也可以通过鼠标右键对图像进行缩放右键单击并拖动以选择要放大的区域再 次右键单击以返回到原始视图 也可以通过鼠标上的滚轮 (如果有的话)调整图像大小 适合窗口适合窗口 如果当前已对图像某个区域进行放大,单击此按钮便可显示整个图像 Gel DocTM EZ 系统 | 查看图像 50 图像转换图像转换 使用 “ 图像转换 ” 对话框可以调整图像亮度和对比度以优化图像显示效果, 以 便看清模糊图像最大和最小范围会随图像现有的明暗度值而改变 注意:注意: 这些调整并不会更改数据,只会更改数据的显示方式肉眼 无法看到图像包含的完整范围 频率分布柱状图会显示图像中的总数据范围和范围内每个点上的数据量 “ 自动缩放 ” 按钮会自动确定特定图像的最佳设置图像最亮的部分会设置为 最小强度,最暗的部分会设置为最大强度 •高进度指示器会确定凝胶图像中最大灰度(或其他颜色)下显示的强 度值 •低进度指示器会确定凝胶图像中最小灰度(或其他颜色)下显示的强 度值 •伽马进度指示器会更改灰度曲线值 1 为线性值 1 会将灰度的大部分重新分 配到强度值的后半部分。

      您也可以在进度指示器旁的文本框中键入数值单击进度指示条的任意位置可 缓慢移动进度指示器 显示凝胶图像 51 选项:选项: •图像反向显示图像反向显示 — 将亮背景上的暗色条带反向为暗背景上的亮条带,反 之亦然 •高亮显示饱和像素高亮显示饱和像素 — 选中此复选框时,信号强度为饱和 (在可测量 范围之上)的图像区域会高亮显示为红色 •线性或对数柱状图线性或对数柱状图 — 此调整会更改柱状图上的 Y 轴,以显示每个强 度值所包含的像素数 图像颜色图像颜色 此对话框让您能够选择图像结果文件的色图通过不同颜色方案查看图像可以 更容易地看到图像中的所有元素,且不会更改数据 您可以选择多种颜色 前八种会模仿染料凝胶的颜色其余颜色方案会呈现大 量的颜色变化,足以高亮显示图像数据中的细微差别 可用颜色包括: Gel DocTM EZ 系统 | 查看图像 52 3-D 投影投影 单击 3-D 图标可将凝胶图像转换到固体三维模型中,该模型可在具有 x、y 和 z 轴的空间中旋转通过向右或向左拉动窗口底部的进度指示器,能够增加或减少 数据点的相对高度 要打开查看器,您可以:要打开查看器,您可以: •从图像上方的工具栏中选择 3-D 图标。

      查看各种条带的强度:查看各种条带的强度: 1. 拖动模型,将其旋转到您所需的视图 2. 单击图像,为窗口对好焦 3. 按 C 可显示一个绿色圆锥,可以来回拖动圆锥来计算各种条带的强度 •灰色•Flamingo™ 荧光凝胶染料 •EtBr(溴乙非啶溴化物)•银 •考马斯•错误颜色 •免染•光谱 •SYBR Green•金银 •SYPRO Ruby•伪 显示凝胶图像 53 图像信息图像信息 图像信息对话框提供有关活动图像的信息单击图像工具栏上的图标可显示有 关图像信息的三个选项卡 图像详细信息图像详细信息 获取信息和图像信息会显示在此选项卡上 分析设置分析设置 对凝胶进行分析时(例如,执行条带检测和分子量分析) ,此选项卡会显示所使 用的设置 注释注释 您可以在该选项卡上添加注释,为每个泳道自定义标记,指出使用的样本类型, 或者显示其他结果相关详细信息 Gel DocTM EZ 系统 | 查看图像 54 显示数据显示数据 与凝胶图像相关的分析数据的结果可以通过使用分析表、泳道轮廓、标准曲线或 作为报告进行查看 该报告无法查看泳道轮廓和标准曲线该报告将替换这些窗口可以在报告窗口 中查看泳道轮廓。

      打开 / 关闭这些视图的按钮位于主工具栏中每个选项描述如下: 泳道和条带定义泳道和条带定义 •条带编号条带编号 — 泳道中的每个条带都具有唯一编号,这些编号按从上到下 的顺序进行排列 •条带标记条带标记 — 用户可以通过单击泳道和条带表的“条带标记”字段, 为每个条带分配一个自定义标记 •分子量分子量 — 条带的分子量根据用户定义的标准和回归方法进行计算斜 体值表示推测值 •相对前沿相对前沿 — 介于 0 和 1 之间的值,表示条带从上到下的相对位移 •绝对定量绝对定量 — 条带的绝对定量 •相对定量相对定量 — 条带相对于参考条带的相对定量 •条带条带 % — 与泳道中的所有条带体积相比,此条带体积所占的百分比 •泳道泳道 % — 与泳道的整个体积相比,此条带体积所占的百分比 体积定义体积定义 •体积编号体积编号 — 每个体积都具有唯一编号 •体积标记体积标记 — 用户可以在体积属性中更改不同体积类型 (U – 未知、 B – 背景、 S – 标准)的软件生成标记 •体积体积 — 条带边界中所有强度的总和 •已调整体积已调整体积 — 背景调整体积 •平均背景平均背景 — 背景的平均值 •绝对定量体积绝对定量体积 — 基于标准体积和回归方法的体积定量 显示数据 55 •相对定量体积相对定量体积 — 已调整体积和参考体积的已调整体积之间的比率 •像素数像素数 — 体积边界内的像素数 •最小值最小值 — 体积内部强度最小的像素强度 •最大值最大值 — 体积内部强度最大的像素强度 •平均值平均值 — 体积边界内所有像素的平均值 •标准偏差标准偏差 — 体积边界内所有像素的标准偏差 •区域区域 — mm2 中的体积区域 分析分析 表选项表选项 与分析相关联的数值数据可以在分析表中查看。

      泳道和条带分析数据可以在泳 道和条带选项卡中查看如果执行体积分析,则这些数据可以在体积表选项卡上 查看 单击分析表按钮可以打开从结果中提取的数据的表格显示 表上方的图标提供多种显示和导出分析表数据的方式 设置窗口大小设置窗口大小 若要更改分析表窗口的大小,请拖动窗口边缘,直到显示所有数据 注意:注意: “ 实验协议 ” 对话框打开时, “ 调整分析表 ” 窗口大小将 受到限制 Gel DocTM EZ 系统 | 查看图像 56 显示数据选项显示数据选项 此对话框有三个选项卡:测量、显示和导出 测量测量 — 通过单击箭头按钮将项从 “ 已显示 ” 字段移动到 “ 未显示 ” 字段, 来选择要显示的测量项 默认显示设置默认显示设置 — 是否启用 “ 将所选泳道移动到顶部 ” 设置取决于是否选中对 应的复选框 按测量精度按测量精度 — 可以在泳道和条带表以及体积表中设置测量项的精度(精确到小 数位) 示例精度示例精度 — 此字段指明如何以在 “ 按度量精度 ” 中选择的小数位数显示测 量项 导出格式导出格式 — 该字段提供两个复选框,以在导出文件中包括泳道标头(仅限泳道 和条带表选项卡)和 / 或列标头。

      导出分隔符导出分隔符 — 该字段为导出文件提供三个分隔符选项 •以逗号分隔的逗号分隔值 (CSV) •选项卡分隔 •其他用户定义分隔符 更改分析表方向更改分析表方向 使用此按钮可以在两个表方向之间切换 水平水平 — 以相邻方式显示泳道 / 体积,以便用户能够左右滚动分析表 垂直垂直 — 以上下方式显示泳道 / 体积,以便用户能够上下滚动分析表 导出分析表导出分析表 下面三个按钮提供几种导出分析表中的数据的方法请参阅第 8 章导出结果 (第 85 页) ,获取有关导出数据的详细信息 将分析表复制到剪贴板将分析表复制到剪贴板 — 单击此按钮可将分析表复制到剪贴板,以便将 其粘贴到字处理程序或演示应用程序中当需要复制到 8-1/2 x 11 英寸 的页面,以提供足够的空间显示列时,使用垂直表方向是最佳选择 将分析表导出到文件将分析表导出到文件 — 当作为 CSV 文件导出时,数据文件可以在数据 库应用程序中打开 显示数据 57 将分析表导出到电子表格将分析表导出到电子表格 — 此功能让您能够使用 Excel 的排序和公式 功能处理数据如果在计算机上安装了此程序,则会打开 Excel(或 Mac 上的 Numbers) ,同时显示相应的电子表格。

      泳道轮廓泳道轮廓 泳道轮廓选项显示所选泳道旋转 90 后的截面图 泳道轮廓窗口打开时, 可以单 击选择其他泳道 如果选中 “ 包括背景 ” 复选框, 则泳道轮廓窗口会在蓝色行下方显示已扣除的 背景,并在红色行下方显示用于条带定量的绿色区域 可以查看泳道轮廓屏幕右下方光标处的当前 Rf (相对前沿)值和强度 通过选择下拉列表中的选项,可以更改标记条带的方式默认情况下,条带会以 条带数进行标记 缩放到适合图形大小缩放到适合图形大小 选择显示屏的最高点以定义图形的范围,从而提供泳道轮廓的最佳视图 您可以清除 “ 缩放到适合图形大小 ” 复选框, 以便在图形中显示可能的强度值 的整个范围这样便能够在不同的泳道之间进行有效的比较 Gel DocTM EZ 系统 | 查看图像 58 包括背景包括背景 如果清除 “ 包括背景 ” 复选框,将不会显示表示图像背景的泳道轮廓区域 标识条带的依据标识条带的依据 您可以在表示下列属性的泳道轮廓上显示标注: •条带数 •条带标记 •分子量 •相对前沿 •体积 •绝对定量 •相对定量 •条带 % •泳道 % 显示数据 59 标准曲线标准曲线 “ 标准曲线 ” 对话框会显示符合您所定义标准的最佳曲线,以及与您在图像中 所选泳道的曲线相关的条带。

      选项卡会显示三种不同分析结果的标准曲线 标准条带以绿色显示,未知条带以红色显示您可以单击左上方的对数 Y 轴来 更改 Y 轴上线性和对数标尺之间的分子量显示不仅会显示在分子量分析工具 中选择的回归方法,还会显示该回归方法的公式 (如果适用)和 R2 值 通过此窗口中的选项卡,您可以查看分子量标准曲线、绝对定量标准曲线或体积 标准曲线 报告报告 请参阅第 7 章 生成报告 (第 81 页) ,以查找能够添加到报告中的内容 Gel DocTM EZ 系统 | 查看图像 60 分析图像 61 6分析图像分析图像 图像文件打开并准确对焦后, 便会启用分析工具箱工具Windows PC 上的活动 窗口或对焦窗口上有一个深蓝色菜单栏在 Mac 上,当窗口处于活动状态时, 窗口控制图标便会以更亮的颜色显示这一差别可帮助您识别工作区中众多打 开的图像文件中的活动窗口 自动分析设置自动分析设置 单击分析工具箱中的 “ 自动分析 ” 按钮,可以执行以下操作: •分析使用协议获取。

      点击阅读更多内容
      关于金锄头网 - 版权申诉 - 免责声明 - 诚邀英才 - 联系我们
      手机版 | 川公网安备 51140202000112号 | 经营许可证(蜀ICP备13022795号)
      ©2008-2016 by Sichuan Goldhoe Inc. All Rights Reserved.