
外文摘要信息获取之pubmedppt课件.ppt
108页外部链接,,外部链接,二、认识PubMed文献,作者AU,题名TI,,来源SO,PubMed记录类型(状态),,PubMed题录,,,PubMed记录类型(状态),PubMed除了1966年以前的OldMedline,其余文献记录按处理过程分4种类型(或状态),三、PubMed检索特点,PubMed检索特点,检索运算符AND、NOT、OR必须大写 (vitamin c OR zinc) AND common cold 支持截词检索(*),但对词组无效如bacter*, 可以检出以bacter为词干的单词bacteria、bacterium等最多600个单词截词检索时,系统的自动词语匹配功能和MeSH自动扩展功能将不再被执行,如:heart attack* 将不映射到 MeSH 词 Myocardial InfarctionPubMed检索特点,强制检索:双引号“ “或限定字段“endocrine disruption“endocrine disruption 注意:所有的 “ “ 、*、 ( )、- 都必须是英文状态下输入四、PubMed基本检索功能,1. 关键词检索,在检索框中键入一个或多个单词,如键入: vitamin c AND common cold hepatitis b AND (diagnosis OR therapy)检索词可出现于PubMed记录的标题、摘要等全部可检索字段。
作者AU,,,题名TI,来源SO,,MEDLINE 收录文献,,出版商提供 电子文献,,正在处理的文献,,OLDMEDLINE,举例,甲型病毒(H1N1)性流感(flu,influenza)/猪流感swine flu 检索词:H1N1;flu;influenza;swine flu 造血干细胞移植(hsct)治疗地中海贫血 检索词:hematopoietic stem cell transplantation;thalassemia,2. 字段限定检索,篇名字段检索 [TI] 作者字段检索 [AU] 机构字段检索 [AD] 刊名字段检索 [TA] [SO],,,常用字段(检索时大小写都可以),篇名检索,在文章的标题中进行检索 字段标识[TI] 检索举例:篇名中检索亚健康的相关文献 检索词:subhealth,sub-health 构建检索表达式: Subhealth[ti] OR sub-health[ti],,,查作者文章被收录西方人姓名书写格式:first name、 Middle Name、last name 美国肯尼迪总统:John Frank Kenedy,Kenedy为 last name(姓) Frank为middle name,比较少见,多看到 John F. Kenedy,中间名用缩写。
如果姓名中间有逗号,逗号前肯定是姓Kenedy, John F. →Kenedy jf,作者检索,中国人姓名格式:first name、last name Shi-zhen Zhong( Shi zhen Zhong ) → zhong sz Shizhen Zhong →zhong s当作者三个字以上的中国人时,注意这两种格式都要检索即: Zhong sz[au] OR zhong s[au],“姓”+空格+“名首字母缩写” 例如键入phillips c,系统会自动在作者字段内进行检索 如果想进行更精确的检索,可以用双引号将作者名引起来,再加[au](作者字段标识符),如:“phillips c“[au]Phillips CB,Phillips C,,,,检索举例,查找钟世镇院士发表的显微外科学(microsurgery)论文 检索姚开泰院士发表的鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma, NPC)论文,机构检索,查某一机构发表论文被收录情况 机构字段 [AD] 检索南方医院发表的SARS论文 南方医院:nanfang hospital;south hospital;southern hospital检索式:SARS AND nanfang hospital[ad],,,输入期刊全名,如:molecular biology of the cell→mol biol cell” [Journal Name]),系统自动转换; 键入期刊标准缩写形式如:mol biol cell,或期刊的ISSN(国际标准出版物代码)如:1059-1524进行检索; 如果期刊名恰好是MeSH词表中的词或一个单词,如:《Gene Therapy》,《Science》,《Cell》等,加[ta](杂志名称) 。
刊名检索,如果杂志全名中包括括弧或方括号,键入时应该予以取消,例如杂志名为:J Hand Surg [Am],检索时应转成:J Hand Surg Am. 语种为中文的期刊直接用汉语拼音南方医科大学学报:Nan Fang Yi Ke Da Xue Xue Bao(继承 Di 1 jun yi da xue xue bao),2018年10月4日星期四,30,检索问题,检索《南方医科大学学报》(原第一军医大学学报》有多少篇文献被收录,最早收录时间是哪一年?,五、 PubMed高级检索,,,高级检索界面,检索框,搜索器,检索历史,预览,索引,检索策略细节,高级检索,检索策略细节(Details——特征栏) 检索框(Search Box) 预览(Preview ——特征栏) 索引(Index ——特征栏) 搜索器(Search Builder) 检索史(Search History ——特征栏),搜索器(Search Builder),Choose a field to search:选定检索字段 Enter search term(s):输入检索词 Click the Show Index link to display a list of terms, if desired:点击索引链接查看索引表 Change the default AND operator, if necessary. 改变字段/算符 Click the Add to Search Box button. 单击添加到检索框按钮 Repeat steps as necessary 视情况重复上述步骤 Click Search to run your query, or click Preview to see the result count of your query in the Search History section. 单击搜索运行查询;或点击预览在检索史区显示查询结果数量。
举例,小剂量阿斯匹林治疗高血压 Small dose; aspirin;hypertension 方法:通过搜索器和索引表将检索词逐一导入 1、输入Small dose ,点击SHOW INDEX 2、在新界面选择索引表中的一个或多个索引词,加入到检索框 3、 aspirin、hypertension同理最后搜索 4、可以改变默认字段和逻辑算符 5、检索史直接显示于高级检索界面的检索史区,,,实习(1),篇名中包含SARS的论文(Severe acute respiratory syndrome,SARS) 阿司匹林(aspirin)临床应用于高血压(hypertension) Piotr J Durka发表的英文综述,要求保存下来 番石榴叶治疗腹泻 diarrhea; psidium guajava leaf 最早发表的循证医学论文(evidence based medicine) 公共卫生与热带医学学院(School of Public Health and Tropical Medicine )发表的论文,其中陈晓光教授发表了几篇论文 自己的姓名在PubMed中可能的著录格式?,PubMed (2),六、特征栏检索(重点) 七、PubMed检索结果的处理(掌握) 八、PubMed主题词检索(掌握) 九、MyNCBI个性化服务(了解),六、特征栏检索,1. Limits(限定检索) 2. Preview/Index(预览/索引) 3. History(检索史) 4. Clipboard(剪贴板) 5. Details(检索策略细节)用于查看检索词自动转换,1、 限定检索(limits),设置与选择检索条件,包括日期、文献类型、语种、子集(subsets)、年龄段、性别、文本选择(有无摘要/全文)等。
研究对象:人类或动物(Humans or Animals) 出版物类型包括:临床试验、评论、信件、Meta分析、实践指南、随机对照实验、综述 全文链接(Full Text 或 Free Full Text)、有摘要(Abstracts)检索举例,姚开泰院士1985-2010年发表的鼻咽癌(nasopharyngeal cancer)论文 分析姚开泰;1985-2010年;nasopharyngeal cancer,2、检索史(Search History),各检索式之间可以进行逻辑组配,可以#n代替检索式3、预览/索引,预览(Preview),,,索引(Index),,,,,点击剪贴板,,,加入剪贴板,,,4、剪贴板(clipboard),,,检索策略细节,,,5、检索策略细节,七、PubMed检索结果处理,(一)显示格式设置 (Display Settings) (二)文件保存(10000篇)(Send to – File) (三)放进剪贴板 (Send to – Clipboard) (四)发送电子邮件 (Send to – E-mail) (五)结果排序 (Display Settings - Sort by) (六)存为馆藏 (Send to – Collections),(一)显示格式设置(Display Settings),,,题录格式:作者、题名、出处,显示格式——Summary格式(默认),,显示格式——Abstract格式,,,显示格式——MEDLINE格式,,导入NoteExpress的必选格式,(二)文件保存,,,,,(三)放进剪贴板(Clipboard),将每次选中的检索结果暂时保存至此; 最后集中处理(下载存盘或发E-mail); 最多500条记录; 断开连接后仍可保存8小时。
选取记录,将记录发送到Clipboard,,,,,,记录保存到Clipboard后有提示信息,,,,在Clipboard中查看保存的记录,,,,,,,在检索历史中显示Clipboard操作历史,(四)发送电子邮件,,,,,,,(五)结果排序 (Display Settings - Sort by),排序字段: 1、Recently Added(收录日期) 2、Pub Date(出版时间) 3、First Author(第一作者) 4、 Last Author (最后一名作者) 5、Journal(刊名) 6、Title(篇名),,,(六)存为馆藏 (Send to – Collections),,八、PubMed主题词检索,MeSH (Medical Subject Headings),PubMed中医学主题词(MeSH)是由标引员为PubMed中的Medline文献所人工指定的词 例:ascorbic acid是MeSH词,vitamin c不是 标引员使用能恰当描述文章内容的最相关MeSH词通常一篇文章可有多个MeSH词PubMed能自动地为输入的检索词寻找相应的MeSH词 用户利用一个MeSH词能找出所有有关该主题的文献 不同拼写:leukemia(s), leukaemia(s)→leukemia 同义词:tumor(s), tumour(s), cancer(s),neoplasm(s) →neoplasms,。












