基因差异性表达分析系列产品.ppt

Atlas（（11852））SmartLiving ColorsMatchmakerAdvantage厂家优势技术厂家优势技术基因差异性表达分析系列产品基因差异性表达分析系列产品一一.mRNA水平上差异表达基因的获得水平上差异表达基因的获得此类产品的客户群此类产品的客户群Atlas Arrays 系列产品介绍系列产品介绍Array Array 的的 用用 途途寻找样本之间在寻找样本之间在mRNAmRNA水平上表达差异的基因（已知）水平上表达差异的基因（已知）转基因和基因突变对功能的影响转基因和基因突变对功能的影响 —— —— 鉴定与之相关的基因和信号鉴定与之相关的基因和信号疾病和肿瘤学研究疾病和肿瘤学研究 —— —— 研究疾病的分子机制研究疾病的分子机制药物方面的研究药物方面的研究 —— —— 药物的作用靶点和相关的路径药物的作用靶点和相关的路径环境危害的影响环境危害的影响 —— —— 生理反应的分子机制生理反应的分子机制临床样品的诊断临床样品的诊断 —— —— 鉴定疾病类型和发病阶段鉴定疾病类型和发病阶段 < <一一> >尼龙膜尼龙膜产品特点产品特点经过筛选适合杂交的经过筛选适合杂交的200-600200-600碱基的碱基的cDNAcDNA片段。

片段目前有人、小鼠、大鼠的芯片，覆盖面广目前有人、小鼠、大鼠的芯片，覆盖面广随芯片提供标记探针用的随芯片提供标记探针用的CDS Primer MixCDS Primer Mix可用同位素可用同位素/ /生物素进行标记生物素进行标记588588个基因以下的膜可用凝胶成象系统进行分析个基因以下的膜可用凝胶成象系统进行分析 生生物物素素检检测测系系统统产品种类产品种类1.2 Array1.2 Array肿瘤肿瘤细胞周期细胞周期心血管心血管神经生物学神经生物学应急反应应急反应其其 他他 配配 套套 产产 品：品：Qiagen的的mRNA纯化纯化Ambion的的RNA沉淀剂沉淀剂Epicentre的的9902K生物素标记试剂盒生物素标记试剂盒生物素检测试剂盒生物素检测试剂盒Smart cDNA 扩增试剂盒扩增试剂盒  <二二>Glass Arrays产品特点产品特点近近8080个个碱碱基基的的单单链链cDNAcDNA点点在在玻玻片片上上，，不不带带任任何何重重复序列和同源性序列复序列和同源性序列目目前前有有人人、、小小鼠鼠、、大大鼠鼠的的芯芯片片，，有有10811081个个基基因因（（Human 3.8Human 3.8有有38003800个），覆盖面广个），覆盖面广随随芯芯片片提提供供标标记记探探针针用用的的CDS CDS Primer Primer MixMix和和玻玻片片杂交液及洗脱液杂交液及洗脱液芯芯片片适适用用于于市市场场上上大大多多数数的的芯芯片片扫扫描描仪仪（（规规格格7575x25x1mmx25x1mm））可用任何荧光团标记探针（可用任何荧光团标记探针（Cy3, Cy5, BODIPY, Cy3, Cy5, BODIPY, FITC,FITC, Alexa Fluor Alexa Fluor dyes, Texas Red dyes, Texas Red 玻玻 片片 产产 品品 种种 类类•Human 3.8 （（3800个基因的个基因的80-base oligo））•Human 1.0 （（1081 个基因的个基因的80-base oligo））•Rat 1.0 （（1081 个基因的个基因的80-base oligo））•Mouse 1.0 （（1081 个基因的个基因的80-base oligo））其其 他他 配配 套套 产产 品品Qiagen的的mRNA纯化纯化Ambion的的RNA沉淀剂沉淀剂生物素标记试剂盒生物素标记试剂盒生物素检测试剂盒生物素检测试剂盒Smart cDNA 扩增试剂盒扩增试剂盒Atlas Plastic Human 8K Microarray8300个已命名基因的个已命名基因的Long oligos点在塑料片基上点在塑料片基上塑料片基大小为塑料片基大小为 8 cm x 12 cm独特的独特的Long oligos设计，近设计，近80个碱基的长度个碱基的长度几种几种Array的相互比较的相互比较竞争厂家竞争厂家二二.SSH杂交试剂杂交试剂PCR-Select Substraction Kit卖卖 点：点：无需同位素无需同位素阳性率高阳性率高对低表达量的对低表达量的RNA同样有效同样有效销售指导销售指导可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品总总RNA和和mRNA抽提试剂盒抽提试剂盒 （（QIAGEN））PCR Kit(1905-Y)TA克隆试剂盒克隆试剂盒 （（QIAGEN/UA Cloning、、Clontech advanTAge））质粒提取试剂盒质粒提取试剂盒/晶泰晶泰PCR-Select Differential Screening KitNorthern相关相关kit（（Ambion/S&S)Smart PCR cDNA 合成试剂盒合成试剂盒DD-PCR试剂试剂Delta Differencial Display Kit传统方法，比传统方法，比SSH的假阳的假阳性率高，且操作复杂性率高，且操作复杂卖卖 点：点：随机引物设计较长，扩增重复性好随机引物设计较长，扩增重复性好90对引物组合，覆盖性好对引物组合，覆盖性好LD-PCR需要做需要做PAGE电泳电泳总总RNA的抽提试剂的抽提试剂可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品总总RNA和和mRNA抽提试剂盒抽提试剂盒 （（QIAGEN））K1910-Y/1;8430-1/2TA克隆试剂盒克隆试剂盒 （（QIAGEN/UA Cloning、、Clontech advanTAge））质粒提取试剂盒质粒提取试剂盒/晶泰晶泰Northern相关相关kit（（Ambion/S&S)Smart PCR cDNA 合成试剂盒合成试剂盒全长基因及相关序列的获得全长基因及相关序列的获得SMART RACE 3’& 5’ end Amplification  Kit卖卖  点点无接头连接无接头连接(这是最关键的优点）这是最关键的优点）操作步骤少（这也是一个关键的操作步骤少（这也是一个关键的 优点）优点）SMART合成全长合成全长cDNA可可同时获得同时获得5‘和和3’的末端片段的末端片段起始起始RNA用量只需用量只需 50ng/1000cells销售指导销售指导可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品•QIAGEN总总RNA和和mRNA抽提试剂盒抽提试剂盒•QIAGEN质粒提取试剂盒质粒提取试剂盒•TA克隆试剂盒克隆试剂盒 （（QIAGEN/UA Cloning、、Clontech advanTAge））SMART cDNA Library Construction Kit卖卖  点点无接头连接无接头连接(这是最关键的优点）这是最关键的优点）全长（这也是一个关键的全长（这也是一个关键的 优点）优点）无需甲基化无需甲基化定向（定向（Sfi I)三种阅读框同时表达三种阅读框同时表达一步质粒化一步质粒化(loxP)起始起始RNA用量只需用量只需销售指导销售指导可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品可推荐的其他配套产品•总总RNA和和mRNA抽提试剂盒抽提试剂盒 （（QIAGEN））•噬菌体包装蛋白噬菌体包装蛋白 （（Epicentre MaxPlax Lamda Packaging Extracts））•cDNA筛选试剂盒筛选试剂盒 （（ClonCapture））•S&S的杂交膜的杂交膜•Ambion的生物素标记试剂盒及杂交试剂盒的生物素标记试剂盒及杂交试剂盒•Ambion的的RNA Later销售指导销售指导基基因因组组步步行行试试剂剂盒盒基因表达时空及剪切的确定基因表达时空及剪切的确定MTE膜膜•Human Multiple Tissue Expression Array       76种种人人的的组组织织和和肿肿瘤瘤细细胞胞系系的的polyA+RNA点阵点阵•Mouse RNA Master Blot       22种种 小小 鼠鼠 的的 组组 织织 的的polyA+RNA点阵点阵MTC膜膜是将是将mRNA电泳后转移到膜上电泳后转移到膜上这不仅可以确定表达谱还可以确定是否有不同的剪切这不仅可以确定表达谱还可以确定是否有不同的剪切 基因的表达与调空基因的表达与调空原核表达系统原核表达系统 昆虫表达系统昆虫表达系统 酵母表达系统酵母表达系统     逆逆转转录录表表达达系系统统Retro-XMSCVPantropicPrimary cellsHematopoietic,embrynic stem,embryonal carcinoma cellsMammalian or nomammalian腺腺病病毒毒表表达达系系统统•腺病毒在寄主细胞中呈游离腺病毒在寄主细胞中呈游离态，基因瞬时表达态，基因瞬时表达•可侵染处于分裂期或非分裂可侵染处于分裂期或非分裂期的寄主细胞期的寄主细胞•高水平的蛋白质表达高水平的蛋白质表达•双载体系统的操作双载体系统的操作•病毒的效价可达病毒的效价可达 1012  pfu/ml•平均可插入平均可插入8kb的外源片段的外源片段•会引起体内的免疫反应会引起体内的免疫反应•长期、稳定的基因表达，可长期、稳定的基因表达，可以遗传以遗传•只能侵染分裂期的寄主细胞只能侵染分裂期的寄主细胞•中度的蛋白表达水平中度的蛋白表达水平•单一载体操作单一载体操作•病毒效价达病毒效价达 106 pfu/ml•平均可插入平均可插入6.5kb的外源片段的外源片段•不会引起体内免疫反应不会引起体内免疫反应腺病毒表达系统腺病毒表达系统 逆转录病毒表达系统逆转录病毒表达系统 腺病毒载体与逆转录病毒载体的比较腺病毒载体与逆转录病毒载体的比较酵母杂交系统酵母杂交系统酵酵母母杂杂交交系系统统阳性率高阳性率高三个不同的启动子三个不同的启动子表达三个不同的报表达三个不同的报告基因告基因质粒上带有半抗原质粒上带有半抗原酵酵母母杂杂交交系系统统Mutagenesis Kit•   Diversity PCR Random Mutagenesis Kit基本原理：基本原理：       通过降低通过降低PCR反应中的反应中的Mn+和和dGTP的浓度来的浓度来增加增加PCR反应的错配率，产生随机突变，这种突变反应的错配率，产生随机突变，这种突变的分布是均匀的。

的分布是均匀的•   Transformer Site-Directed Mutagenesis Kit基本原理：基本原理：定点将突变位点通过定点将突变位点通过PCR引物带入目标质粒中引物带入目标质粒中Mutagenesis Kit•   Diversity PCR Random Mutagenesis Kit基本原理：基本原理：       通过降低通过降低PCR反应中的反应中的Mn+和和dGTP的浓度来的浓度来增加增加PCR反应的错配率，产生随机突变，这种突变反应的错配率，产生随机突变，这种突变的分布是均匀的的分布是均匀的•   Transformer Site-Directed Mutagenesis Kit基本原理：基本原理：定点将突变位点通过定点将突变位点通过PCR引物带入目标质粒中引物带入目标质粒中怎样拓展怎样拓展Clontech的市场的市场。