分析软件JADE一点使用心得.doc

分析软件JADE一点使用心得 专业关联   2008-06-20 11:02   阅读68   评论2   字号： 大大  中中  小小 相对于其它XRD分析软件，JADE系列软件应该说是做的最好的，它囊括了从定性，指标化，峰型拟合（JADE5.0）到无标定量，晶体结构分析（Jade6.0）等一系列的功能我个人以为，只要有Jade5.0就够了，至于后面两项功能，最好是用其它免费软件执行（在上应有尽有），傻瓜相机虽然好用，但要拍出好照片，还是专业相机好NO1.Jade5.0的安装和设置Jade5.0都是自动安装的，这不成问题要把PDF卡片引入，先将ICDD的光盘插入，然后pdf/setup/select all/,其它按提示进行可以对优选项进行设置：EDIT/preference/,里面包括了对显示窗口的设置，仪器参数的设置，打印输出的设置等，一般来说按默认就行，我本人则喜欢将MISC栏里的“Materials Data, Inc.”改为我自己的大名No2 数据的输入Jade软件可以直接读取Rigaku、Bruker、Philips、Scintag等很多衍射仪的原始数据打开,将出现如附件中所示画面，先（I）找到你文件位置，从（III）的下拉框中选择你的数据格式，按（II）选择。

很多仪器输出文件的格式都是*.raw,实际上都是不一样的，但格式选错了也没关系，软件会给你自动转到合适的格式中去的高级一点的：有一些数据格式在（III）的下拉框中没有，比如最常见的txt，xy等，此时你可以自己动手设置，在以上的数据输入面板中，点击工具栏上的 “import",进入格式设置画面，如附件所示，a区为注释区，b区为数据格式区，对于最简单的一列角度，一列强度的数据格式，a区不用填写，b区在” angle column“前打上勾，数据从第1行开始读，每行1列数据，强度数据从第8行开始（角度不算），角度从1至6列，所得数据格式即为附件中所示的数据格式你也可以按照自己的数据格式进行自由改动，如果a区中表明第1行有说明文字，则数据从第2行读入，相应在b区就将data starts改成2No 3 基本功能使用：平滑，扣背底一张XRD图谱出来，往往因为有空气散射，漫散射，荧光以及样品结晶差等等原因而造成图谱上存在许多“毛刺”和较高的背底，虽然提高X光强度能成倍提高信噪比，然而有时受仪器和样品所限，这两项功能需要用到但根据我个人的经验，要尽量少使用平滑和扣背底，因为这两项操作带来的可能后果就是将一些微弱的有用信息一概抹掉了，特别注意的是，如果将数据用来做Rietveld精修，更不要进行这两项操作。

当然，如果是将图谱打印出来给别人看，适当进行平滑和扣背底也是个不错的选择1 平滑打开Filters/smooth pattern或在快捷工具栏中右键点击也可随后将出现一个悬浮框，最上面的一栏中方块可以直接用鼠标拖动，大家试试看图谱会有什么变化，拖到什么位置，根据情况而定，我的经验是将方块拖到尖峰的底部出现倒生的毛刺之前再下面有“parabolic filter"和”quartic filter"的选择，选择后一个的效果稍好再下面还有选择框，我一般都不管它作完以上操作后，再用鼠标左键点击快捷工具栏中的平滑图标即可2 扣背底打开analyze/fit background或在快捷工具栏中右键点击也可随后也出现一个如附件中所示的悬浮框，（I）处所示代表了背底拟合的级数，点击越靠前，该级数越高，也可在右边选择是一次拟合，抑或二次和三次拟合，试情况而定，背底偏离线性越远，则拟合的级数要求越高背底曲线用黄线表示，红点代表了背底在局部的最高点，左键点击图谱上的某一处便可在此处添加红点，右键点击红点可以消除该点背底是否拟合好要靠肉眼观察II所指为背底以下和以上的面积，可以用来粗略估计样品的结晶度以上完成后点击“removal"即可。

No 4 寻峰和峰型拟合1寻峰在寻峰之前最好用标样校正过2theta值，这些都是仪器操作人员的事情，我就不说了打开analyze/find peaks，或右键单击快捷工具栏中的图标出现一个悬浮框，在“search”里面可以对寻峰的判据进行设置，大家可以改动不同的限制条件，然后按 “apply”看看有什么变化在“Label”里面主要是可以选定标注的内容，如d值，2 theta值，半峰宽，强度等，这些大家多试几次就OK了如果要将寻峰结果列出，按下“report”即可也可以自己手动直接在图谱上标峰，大家可以看到有一个悬浮式快捷编辑框“edit toolbar”，左键点击第3个图标然后就可以直接在峰顶标注，如果同时按住“Ctrl”键，则可以在图谱的任何位置上进行标注如果要去掉某个峰的标注，则用鼠标将竖线拖到与峰的标注线重叠，出现红颜色之后点击右键即可如果要删除所有的峰的标注，在窗口中点击右键，选定”Erase all”即可2 峰型拟合如果要得到精确的峰型，峰位信息，一般都要经过峰型拟合，JADE提供了单峰拟合的功能在峰型拟合前不要进行平滑和扣背底，也不主张预先自动寻峰就像前面一位朋友说的，对于重叠峰的分离比较有难度，也可能会导致软件“罢工”（我也遇到过这种情况），但对于多数人来说，峰型拟合就等同于分峰，因此面对重叠峰是不可避免的，我的建议是高角度的峰舍弃，并且分峰要一小段接一小段地进行（背底严重的除外）。

先在图谱上选好角度范围，在编辑栏中左键点击第7个图标，然后再右键点击，将出现一个峰型拟合的工作框（也可通过analyze/fit peak profile），然后选定你的峰（注意排除Kalfa2）或者按下“initialize”，再按下“refine”即可有时不管怎样似乎都拟合不好，此时可在工作框中调整峰型函数，以及“Exponent”和“lorentzian”的值，也可以调整背底的类型等，另外，可以重新确定峰位，去掉一个计算峰也可以用鼠标的右键拟合好坏的标准除了看R因子外，主要是观察差值线按下“report”直接查看结果，里面也有一些设置，如要修正的参数，晶粒大小计算的根据等，大家在实践中多试试，看看结果会有什么不同在结果的列表中，选定复选框可以将该峰定义为背底，一行被选定（在图谱上该峰的标注线显示红色），按下“Erase”删除，其它栏目大家都比较熟悉，最后一项为晶粒大小的计算结果，要注意的是，这种晶粒大小的计算是建立在仪器的实际宽化曲线已存入的基础上的，否则就按默认的仪器曲线（软件自带），但不同仪器有不同的宽化曲线，因此最好自己建立，这也是仪器操作人员的事情，我就不多讲了，如果有朋友感兴趣，可以和我直接交流。

再后面的事就是按下“export”进行保存了NO.5 物相鉴定我以前用过专门的PDF软件做物相鉴定，但是感觉比较费神，最重要的是不能导入实验的衍射谱，除三强线外的其它谱线要靠人工去和标准谱一一对应，给准确判定带来不少困难JADE在这方面还是蛮出色的，只需轻点鼠标，很快就能出结果，并且非常直观，易于判别，这主要得益于它具有强大的图谱处理综合功能以及先进的图谱鉴定方法，在此不作多讲，主要说说如何具体运用在进行物相鉴定之前，最好尽量多地知道样品的元素信息，有很多朋友在作定性分析之前，总是不愿意告知元素组成，甚至有人要用XRD去判别元素，这些都是对 XRD物相鉴定的一种曲解XRD的作用对象只能是“相”，而且是“结晶相”同一种结构，往往它的化学组成形式可以有成百上千种，而同一个化学组成，它也可以存在多种结构，前一个问题的解决主要靠化学分析，后一个问题的解决则非XRD莫属（TEM也能，但不普遍）在进行物相鉴定之前，预先作背底扣除，最好不平滑右键点击工具栏上的“S/M”，出现一设置面板，“General”里面首先是样品类别的选定，一般而言，我都将类选得大一些，以防不测除了物性类别外，其它的还有诸如计算谱，结构被无机晶体结构数据库收录的图谱等。

再下面是一些复选框，如单相鉴定，有否择优取向，是否自动匹配，以及化学元素限定等等最后一项是最常用到的，复选“use Chemistry”，点击“Chemistry”，出现元素周期表，直接点击你确定的元素，一次为“可能”有，二次为“肯定”有，建议点击一次变为蓝色即可，然后“OK”除Chemistry外，其它的诸如Formula，Unit Cell等等也可以，但都不常用对于一般的用户来说，完成上述操作即能进行下一步的工作点击设置面板上的“OK”，将出现检索结果，一般默认按可信度排列，点击名称，在图谱上就会出现对应的谱线，在复选框内打勾，就表示选定四种XRD分析软件比较 1.pcpdgwin我认为是最原始的了它是在衍射图谱标定以后，按照d值检索一般可以有限定元素、按照三强线、结合法等方法所检索出的卡片多时候不对一张复杂的衍射谱有时候一天也搞不定 2.search match可以实现和原始实验数据的直接对接，可以自动或手动标定衍射峰的位置，对于一般的图都能很好的应付而且有几个小工具使用很方便如放大功能、十字定位线、坐标指示按钮、网格线条等最重要的是它有自动检索功能可以帮你很方便的检索出你要找的物相。

也可以进行各种限定以缩小检索范围如果你对于你的材料较为熟悉的话，对于一张含有4，5相的图谱，检索也就3分钟效率很高而且它还有自动生成实验报告的功能！ 3.high score几乎search match中所有的功能，highscore都具备，而且它比searchmatch更实用1）它可以调用的数据格式更多2）窗口设置更人性化，用户可以自己选择3）谱线位置的显示方式，可以让你更直接地看到检索的情况（4）手动加峰或减峰更加方便5）可以对衍射图进行平滑等操作，是图更漂亮6）可以更改原始数据的步长、起始角度等参数7）可以进行0点的校正8）可以对峰的外形进行校正9）可以进行半定量分析10)物相检索更加方便，检索方式更多11）可以编写批处理命令，对于同一系列的衍射图，一键搞定 4.jade和highscore相比自动检索功能少差，但它有比之更多的功能1）它可以进行衍射峰的指标化2）进行晶格参数的计算3）根据标样对晶格参数进行校正4）轻松计算峰的面积、质心5）出图更加方便，你可以在图上进行更加随意的编辑现在将通过实例初步介绍jade5.0的基本操作步骤  1、数据输入      由于不同的X射线衍射仪输出的数据类型不同，但都可以将数据转换成txt文档或Ascii格式的文档（文件名为*.txt或*.asc），为提高软件的通用性jade5.0提供了以txt文档或Ascii格式输入数据。

运行jade5.exe首先进入以下界面     中间的窗口用于选择需打开文件，左侧选择文件路径与资源管理器的操作相同，右侧选择打开文件的类型，一般选择XRD Pattern files(*.*)，这时在右下方的窗口中将显示左侧被选择文件夹中所有能被该软件识别的文件，然后选择需要分析的数据文件，点击菜单栏Read进入主窗口，此选择窗口可以通过主窗口中进入  2、背景及Ka2线扣除  在主菜单栏中选择analyze/fit background进入如下窗口：     该窗口用于设置扣除背景时的参数，一般选择默认值直接选择apply，回到主窗口，此时软件自动运行Edit bar/B.E按钮，用于手动修改背景， Edit bar工具栏如下：    此工具栏提供了。