实验转座子随机突变及目标表型的筛选.ppt

实验转座子随机突变及目标表型的筛选实 验 内 容♣ 染色体步移法克隆已知序列的侧翼序列染色体步移法克隆已知序列的侧翼序列♣ 转座子随机突变及目的表型的筛选转座子随机突变及目的表型的筛选♣ 大肠杆菌大肠杆菌β-半乳糖苷酶的诱导半乳糖苷酶的诱导♣ 利用利用SDS-PAGE分析融合蛋白的可溶性分析融合蛋白的可溶性♣ 绿色糖单胞菌的发酵及孢外酶的提取绿色糖单胞菌的发酵及孢外酶的提取转座子随机突变及目的表型的筛选李丽萍实验目的实验目的1.了解细菌常见转座子Tn5的结构及转座机理2. 学习利用转座子进行随机插入突变的实验过程3. 掌握双亲接合实验的原理及过程实验原理转座子：转座因子或跳跃因子，它可以从遗传物质的一部分跳跃到另一部分，从而引起遗传变异转座子的发现：20世纪50年代初期，美国冷泉港实验室遗传育种学家McClintock 通过对玉米籽粒色斑不稳定现象的研究而发现转座现象，首次发现了能在基因组内不同区域转移的控制成分实验原理细菌转座子的类型：插入序列 (Insertion sequence);复合转座子 (Composite transposons); Tn5TnA 转座子家族 (TnA family);可移动噬菌体 (Mu phage).实验原理Tn5：发现于，序列全长5818bp。

核心序列：编码三个抗生素(新霉素、博莱霉素、链霉素)； 两个倒置的IS50：IS50R编码53KD的Tnp和48KD的转座阻遏蛋白(Inh),两者使用同一阅读框，但启动子不同IS50L的第1442碱基处存在一个赭石突变，IS50具有19bp的倒置末端，二者有7个碱基不相同，是转座酶(Tnp)的作用位点kanr strr bleorOE IE IE OEIS50L IS50RP1 (Tnp)P2 (Inh)P3P4突变位点(Mutation site)Tn5的转座机理实验原理实验原理DNA sequencing实验原理非转移性质粒：转移性质粒：能自动地从一个细胞转移到另一个细胞，甚至还能 带动供体细胞的染色体DNA向受体细胞转移;接合作用：质粒在细菌间的转移，需要供体和受体细胞间的直接 接触才能进行.受体菌，Ap Nx巴西固氮螺菌Sp7供体菌 S17-1质粒pRL1063a,Km重组巴西固氮螺菌，Ap Nx Km实验原理植物生长激素，由植物根系细菌合成，对植物的生长及一些发育阶段的调控起关键作用细菌中IAA合成的几种途径A-B：吲哚乙酰胺途径；E-F-D：吲哚丙酮酸途径；C-D：色氨酸侧链途径实验材料1.菌株 E. coli S17-1/pPRL1063a; 巴西固氮螺菌sp72. 培养基及试剂(1). 细菌丰富培养基LB培养基 LD培养基胰蛋白胨 (g) 10 10酵母提取物 (g) 5 5氯化钠 (g) 10 2.5pH 7.0 6.8固体培养基加入1.3% 琼脂粉，dH2O定容至1L，121℃灭菌20min(2).用于IAA摇瓶培养的培养基(MAZ培养基)(3).抗生素抗生素名称 贮存液配制方法氨苄青霉素 (Ap) 100 mg/ml 水溶液，-20℃ 25 μg/ml卡那霉素(Km) 100 mg/ml 水溶液，-20℃ 50 μg/ml 30-50 μg/ml萘啶酮酸(Nx) 20 mg/ml 水溶液，-20℃ 5 μg/mlE.coli A.brasilense使用浓度3. 主要仪器 小型离心机实验步骤第一天：第一天：中午中午12：：30～～13：：30接种sp7 至5ml LD 液体培养基中，30℃振荡培养约20小时。

晚晚5：：30，接种供体菌pRL1063a/E.coil S17-1 至5ml LB+Km液体培养基中，37℃振荡培养约16小时第二天：上午9：00，用同一个1.5 ml 离心管收集适量供体菌和受体菌12000rpm 离心30 sec，弃上清，用移液器将菌泥悬浮混匀后移入LD平板中央，尽量减少气泡的产生 30℃正置培养过夜 注意：事先准备好LD平板 第三天：用液体LD培养基洗下菌泥，铺于同时含有Km、Ap、Nx的LD平板上，30℃培养，筛选接合子第四天：挑取接合子在含有上述三种抗生素的LD培养基平板上划线分离，保证得到的为单菌落第五天：挑单菌落分别接种于5ml MAZ培养基中30℃摇瓶培养（野生菌对照）.第六天：用比色法测定菌液中的IAA含量比色试剂：含12g/L FeCl3 的H2SO4 注意安全取1ml 测量OD600；取1ml 菌液12000rpm 离心 5min后取上清与比色试剂等量混合，摇匀后在暗处放置30 min，然后测OD540nm注：空白对照，未接菌的培养基与比色用试剂的混合液标准曲线实验结果菌株(Strains) (OD600) (OD540) IAA浓度 (μg/ml)ck(培养基)Sp71-11-21-31-4表 巴西固氮螺菌 Yu62 野生型及突变体的IAA产量。