Rietveld结构精修原理与应用特选资料.ppt
41页Rietveld 结构精修原理与应用1专业课主要内容•1. 原理•2. 精修步骤与策略•3. 结构精修2专业课1.原理技术方法:(1)单晶衍射技术 得到上千个数据,通过傅里叶转换得到电子云密度图(直接法,patterson 法)优点:方法简单,结果可信度高缺点:但是经常很难得到足够大的单晶(0.1~0.2mm)来测试分析3专业课(2)粉末衍射技术: 三维空间数据被压缩成一维,数据太少,无法得到电子云密度图,因此很难解出结构 缺点:方法很复杂4专业课1966年,荷兰科学家Hugo M Rietveld 采用拟合整个衍射图谱(峰位、强度、线形等)来精修晶体结构,最初用于中子粉末衍射 某衍射峰(hkl)的衍射净强度: Yhkl=Ghkl*IhklGhkl为峰形函数:Gauss,Lorentz,Viogt,Pearson-Ⅶ ,Pseudo-Voigt;Ihkl为某hkl衍射峰的积分强度5专业课而Ihkl=SMhklLhkl | Fhkl |2S:标度因子,Mhkl:衍射线hkl的多重因子,Lhkl洛伦兹因子,Fhkl 结构因子Fhkl 计算公式:Xj , Yj , Zj是原子j的原子坐标;hkl是产生衍射的晶面指数;fj是j原子的散射因子。
6专业课衍射图上任何一处(2Ɵ)的计算强度:Y(2Ɵ)c为计算强度值,Y(2Ɵ)b为背景强度,Ghkl*Ihkl为衍射峰强度7专业课 w2Ɵ为权重因子,Y(2Ɵ)O 为观测的强度, Y(2Ɵ)c计算的强度 不断的调整峰形参数和晶体结构参数,并采用最小二乘法使计算谱拟合实测谱 当差值(M)达到最小值,即精修结构完成Rietveld 方法就是利用电子计算机程序逐点比较衍射强度的计算值和实测值,用最小二乘法调节结构原子参数和峰形参数,使计算峰形和实测峰型符合在最小二乘方法精修过程中,要达到最小化的量值称为残差 M:8专业课•判别拟合好坏的R因子Rp 全谱因子Rwp加权的全谱因子Rexp期望因子χ2拟合度因子wi为统计权重因子;yio为点 i 处的实测(毛)强度值;yic是点 i 处的计算强度值;N 为衍射图谱数据点的数目;P 为拟合中的可变参数的数目9专业课2.精修步骤与策略(1)高质量衍射数据的获取•中子衍射 中子与原子核相互作用,适合于确定点阵中轻元素的位置和值邻近元素的位置•同步辐射 波长连续可调,高强度,光性单一• X射线衍射 扫描范围尽可能的宽,以获取高角度部分的数据; 步进扫描,步长一般为半高宽的1/5~1/8(0.02或者0.01) 停留时间1秒以上; 最高峰强度应至少在背景的50倍以上。
10专业课(2)CIF数据American Mineralogist Crystal structure DatabaseICSD数据库Crystallograpgy Open DatabaseFindit(3)精修软件GSAS,Topas ,fullprof ,Jana2006 ,MDI Jade, Maud ,DBWS11专业课(4)精修策略(GSAS为例) 第一类:峰形(profile) 取决于样品和仪器 包括:峰形函数、峰形参数、 背景函数、标度因子、 零点校正、晶胞参数 第二类:强度(intensity) 取决于晶体结构 包括:原子类型、坐标、占位、热振动12专业课 峰形函数: 样品原因(颗粒大小、应力、缺陷) 仪器原因(辐射源、衍射仪、狭缝大小) X射线衍射: Pesudo-Voigt (Lorentz与Gaussian函数的线性组合) Pearson-Ⅷ 中子衍射: Gaussian13专业课•峰形参数:峰宽:Gu、Gv、Gw由仪器造成Lx:样品晶粒宽化引起Ly:应力引起Gp:样品晶粒宽化引起asym:低角度不对称trns:样品透明,轻元素化合物shift :样品偏心14专业课•背景函数选第一种类型(多项式类型)terms:先小后大•标度因子不可以同时把两个选上多个物相时,在各物相后面的refine打钩;而scale后面的refine不打勾•峰位置zero ;晶胞参数; shift15专业课•结构参数:原子类型坐标占位热振动分步精修——整体精修先重原子后轻原子引入限制和约束16专业课3.结构精修①准备工作:CMPR转出GSAS实验档11107986254317专业课543216②准备工作:峰形参数:U、V、W、X、Y的获得18专业课8719专业课10121311915161420专业课③建立项目(XXX.exp)以Al2O3例21专业课21534622专业课④CIF数据录入13223专业课这是选择使用汇入晶格资料档的画面24专业课⑤ 衍射数据、仪器参数的录入选择XXX.gsas数据选择实验仪器参数档XXX.ins25专业课这是输入完成后的画面26专业课⑥ 精算各个参数选择背景函数27专业课标度因子标度因子28专业课选择峰型函数类型,根据CMPR修改各个峰型参数14236529专业课这是按下“powpref”的画面,跑完后按任意键继续30专业课再按一下“genles”开始计算最小平方循环递回次数31专业课32专业课红色x为实验值,绿色实线为拟合值,紫色实线为实验值与拟合值的差,这一个图形窗口我们可以留着不要关掉,他会随着我们的精算一路更新。
33专业课34专业课精修所有原子的坐标,热振动,占位精算峰型函数35专业课36专业课当精算的到的最佳的時候,如上图,紫色的差值几乎成为一直线χ2与R-factor都到达最佳后,我们可以把结果給输出37专业课⑦ 精修结果的判定•差值线尽量平直• Rwp ,Rp尽可能的低,低到15%认为可以接受,低到10%以下,认为精修结果能令人满意•χ2拟合度因子应趋近等于1•化学键长键角应该在合理的范围内38专业课⑧数据的导出与处理•1.精修数据的导出Results → hstdmp →弹出对话框后按回车可以查看每个选项的含义,然后输入L,表示copy the entire profile to the .LST file, 再输入1,表示输出第一个相,如果有多个相的话可以继续输入,最后输入0结束这样我们就可以在工作目录下面找到Al2O3.LST文件,用写字板打开,所有的信息都包括在里面包括晶格常数,峰形函数,背景函数,温度因子及其他们的误差需要注意的所有拟合的数据都在里面,所以我们要选取最后的数据39专业课•2.衍射晶面的导出 点击菜单栏Results,在下拉菜单中选择reflist,分别按提示输入1,R,1 , AL2O3,0,具体意义操作窗口会显示,然后就可以在AL2O3.RFL文件中找到晶面指数和位置。
•3. 键长和键角计算 点击菜单栏Results,在下拉菜单中选择disagl,就可以计算出所有的键长和键角,可以提取你有用的信息•4. CIF文件输出 点击菜单栏Import/Export,在下拉菜单中选择CIF export,再选择gsas2cif,然后按照提示就可以完成cif文件的制作40专业课Thank you!41专业课。

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