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生物化学资料整理.docx

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    • 生物化学资料整理 生 物 化 学第一章:糖类的构造与性质本章主要内容一、糖类概况 二、糖的旋光性三、单糖〔构造、性质、代表性单糖及衍生物〕 四、寡糖五、复合糖〔糖胺聚糖、蛋白聚糖、糖蛋白〕 六、糖链构造分析 根本概念异构:化合物具有一样的分子式,但原子连接次序或原子空间排布不同 构型:具有一样的分子式和构造式,但原子在空间的排布不同,称之构型 旋光异构:由于存在手性碳〔不对称碳原子〕而具有旋光性不对称碳原子:与四个不同的原子或基团相连并因此失去对称性的四面体碳用C*表示 对映体:一个不对称碳原子的取代基在空间里的两种取向是物体与镜像的关系,并且两者不能重叠这两种旋光异构体称为对映体两个对映体具有程度一样但方向相反的旋光性〔D+与L-;D-与L+〕和不同的生物活性,其他物理和化学性质完全一样含n个C*的化合物,其旋光异构体的数目是2n, 组成2n /2对对映体 任一旋光化合物都只有一个对映体,它的其他旋光异构体在理、化性质都与之 不同,不是对映体的旋光异构体称非对映体 仅一个手性碳构型不同的非对映体称差向异构体〔有几种状况〕 异头物:单糖由直链构造变成环状构造后,羰基碳成为新的手性碳〔异头碳〕,导致C1差向异构化,产生两个非对映体,称之。

      α、β异头物判定:有2种方式见P9-10 高碘酸氧化:糖中邻二羟基间的C-C键被断裂, 形成二醛基,继而有一个醛基被氧化成甲 酸测定聚合度、分支点数目和糖苷键位置糖苷〔键〕:环状单糖的半缩醛或半缩酮羟基与另一化合物发生缩合形成糖苷;糖苷键有O-苷、N-苷、S-苷等;糖苷是缩醛,无醛的性质单糖性质:异构化、复原、氧化〔重点:高碘酸氧化〕、成酯、成醚〔酰基化、甲基化反响〕、形成糖苷〔重点〕高碘酸氧化:糖中邻二羟基间的C-C键被断裂, 形成二醛基,继而有一个醛基被氧化成甲酸测定聚合度、分支点数目和糖苷键位置糖苷〔键〕:环状单糖的半缩醛或半缩酮羟基与另一化合物发生缩合形成糖苷;糖苷键有O-苷、N-苷、S-苷等;糖苷是缩醛,无醛的性质 其次章:脂类的构造与性质 重要概念脂质:是一类微溶于水而易溶于非极性溶剂的有机分子,大多数是脂肪酸和醇所形成的酯类及其衍生物两亲化合物:具有极性头部〔亲水〕和非极性尾部〔亲脂〕的分子称之 必需脂肪酸:亚油酸和亚麻酸对人体功能必不行少,但必需由膳食供应,称之 碘值:指101g油脂卤化时所能汲取碘的克数脂质过氧化:一般是指多不饱和脂肪酸或多不饱和脂质的发生自动氧化产生过氧化物的现象,它是典型的活性氧参加的自由基链式反响;活性氧:指氧或含氧的高反响活性分子,如超氧阴离子自由基、羟基自由基、过氧化氢、单线态氧等的统称。

      脂肪酸概况脂肪酸的种类及简写符号: 分为饱和脂肪酸、单不饱和脂肪酸、多不饱和脂肪酸;偶数碳与奇数碳脂肪酸〔奇数碳脂肪酸含量极少!〕;简写符号用碳数:双键数△双键位号(含顺反式)表示,如18:2 △9c,12c多不饱和脂肪酸家族: 分为ω-3和ω-6系列〔指离羧基最远的双键到甲基末端3个碳和6个碳〕如亚油酸和γ-亚麻酸为ω-6系列,而α-亚麻酸为ω-3系列人体内二者不能互转且二者对血脂的影响不同见89页表格 三酰甘油的化学性质 皂化值〔水解与皂化〕:皂化1g油脂所需的KOHmg数; 碘值〔氢化和卤化〕:101g油脂卤化时所汲取的碘的克数;乙酰值〔乙酰化〕:中和1g乙酰化物所释放的乙酸所须要的KOHmg数; 酸值〔酸败与自动氧化〕:中和1g油脂中的游离脂肪酸所需的KOHmg数 萜和类固醇萜:由两个或多个异戊二烯单位组成;如类胡萝卜素为四萜;单萜、倍半萜等 类固醇:即甾类,环戊烷多氢菲衍生而来; 胆固醇衍生物:激素:5类 胆汁酸 维生素D 其它脂蛋白:由脂质和蛋白质以非共价键结合而成的复合物,血浆可分为乳糜微粒、VLDL、IDL、LDL、HDL五类;血浆脂蛋白的构造与各自的功能! 第3章:氨基酸〔重点〕学问点氨基酸分类氨基酸的酸碱性质 氨基酸的化学反响 氨基酸混合物的分别氨基酸:是蛋白质的构件分子,具有酸碱性质、手性、聚 合实力、特定的侧链构造及多样的化学反响; 兼性离子:指氨基酸分子含有一个正电荷和一个负电荷的形式。

      在氨基酸晶体中或中性水溶液中以兼性离子形式存在等电点:指氨基酸处于净电荷为零的兼性离子状态时的pH等电点与离子浓度无关,只决定于等电兼性离子两侧的pKa值 氨基酸的酸碱性质依据酸碱质子理论,HA A- + H+氨基酸是两性电解质,既是质子供体,又是质子受体当氨基酸完全质子化时,可看作是多元酸;COOH和NH3+可以发生解离,用Ka表示它们的解离常数;在氨基酸溶液中,pH值 计算公式如下: pH=pKa+lg〔质子受体/质子供体〕 当pH大于等电点时,氨基酸带净负电荷;当pH小于等电点时,氨基酸带净正电荷在必须的pH范围内,氨基酸溶液的pH离等电点愈远,氨基酸所携带的净电荷愈大氨基酸的化学反响α-氨基参与的反响 与亚硝酸反响〔生成羟基氨基酸和氮气〕 与酰化试剂反响〔氨基被酰基化而被爱护〕烃基化反响: DNFB反响〔生成DNP-氨基酸〕;PITC反响〔生成PTH-氨基酸〕 形成西佛碱反响〔与醛类化合物〕 脱氨基反响α-羧基参与的反响 成盐成酯成酰氯〔与二氯亚砜等〕 脱羧基反响叠氮反响〔氨基酸酯与肼、亚硝酸〕α-氨基与α-羧基共同参与反响 与茚三酮反响〔氨与复原茚三酮发生作用生成紫色物质〕 成肽反响侧链R基参与的反响 酪氨酸酚羟基 组氨酸咪唑 精氨酸胍基 色氨酸吲哚基 半胱氨酸巯基氨基酸的旋光性与光谱性质氨基酸的旋光性:氨基酸的构型〔指α-碳〕也以甘油醛为参考物,从蛋白质的酸水解或酶水解液中得到的都是L型,但D型氨基酸在自然界也存在;蛋白质用碱水解或有机合成氨基酸时,得到的都是无旋光性的DL-消旋物。

      氨基酸的光谱性质: 参加蛋白质组成的20多种氨基酸在可见光区没有光汲取,在红外区和远紫外区都有光汲取,但在近紫外区只有芳香族氨基酸有光汲取 氨基酸混合物的分析分别分别方法 柱层析纸层析〔相对迁移率,非极性性质〕 薄层层析离子交换层析〔电荷和非极性〕 气相层析 高效液相层析氨基酸洗脱依次的判定:氨基酸与树脂的亲合力主要确定于它们之间的静电吸引,其次是氨基酸侧链与树脂聚苯乙烯之间的疏水相互作用;亲和力愈大愈难洗脱 第四章:蛋白质〔重点〕蛋白质概况蛋白质是一类最重要的生物大分子,英文称protein,意为“最原初的,第一重要的” 蛋白质的化学组成:碳〔50%〕、氢〔7%〕、氧〔23%〕、氮〔16%〕、硫〔0-3%〕、其它元素微量;蛋白质的平均含氮量为16%,此为凯氏定氮法测定蛋白质含量的根底分类Ⅰ 单纯蛋白质〔如清蛋白、球蛋白、组蛋白、谷蛋白、硬蛋白等〕 缀合蛋白质〔如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白、金属蛋白、黄素蛋白等〕分类Ⅱ 按生物学功能可将蛋白质分为酶、调整蛋白、构造蛋白、转运蛋白等等; 分类Ⅲ 纤维状蛋白质〔一般不溶于水典型的有:胶原蛋白、弹性蛋白、角蛋白、丝蛋白、肌球蛋白等〕 球状蛋白质〔可溶性好。

      典型的有:胞质酶类等〕 膜蛋白〔与细胞的膜系统结合而存在〕 分类Ⅳ 单体蛋白质 〔寡〕多聚蛋白质蛋白质构造的层次构象:指具有一样构造式和一样构型的分子在空间里可能的多种形态;构象形态间的变更不涉及共价键的裂开每一种自然蛋白质都有自己特有的空间构造或三维构造,称之为蛋白质的构象;一个给定的蛋白质可以有多种构象,但只有一种或少数几种在能量上是有利的蛋白质的构造〔蛋白质的一级构造即多肽链的氨基酸序列确定蛋白质的高级构造〕 一级构造〔即共价构造,指多肽链的氨基酸序列〕 二级构造〔指多肽链借助氢键形成α螺旋和β折叠片〕 三级构造〔指多肽链借助各种非共价键弯曲、折叠成具有特定走向的严密球状构造〕 四级构造〔指多聚蛋白质的各亚基之间在空间上的相互缔合关系〕蛋白质的功能:催化、调整、转运、储存、运动、构造组分、支架作用、免疫、异样功能 蛋白质的共价构造〔一级构造〕氨基酸残基:肽链中的氨基酸由于参与肽键的形成因而 不在是原来完整的分子,称为氨基酸残基; 两个氨基酸形成一个肽键时失去一分子水,因此失去的水分子数比氨基酸残基数少一个每个氨基酸残基的平均分子量为110肽:由两个或多个氨基酸残基通过肽键相连而形成的化合物;肽有寡肽和多肽之分。

      一条肽链通常在一端含有一个游离的末端氨基,称为N-末端,而另一端含有一个游离的末端羧基称为C-末端肽键: 具有局部双键的性质 肽键比一般碳-氮单键短 与肽键相连的氢原子和氧原子呈反式构型 肽键不行自由旋转 肽的理化性质: ①肽键的酰氨氢不解离,肽的酸碱性质主要确定于肽键中的游离末端α-NH2、α-COOH及侧链R基上的可解离基团; ②肽中末端α-羧基的pKa值比游离氨基酸的大,末端 α-氨基的pKa值比游离氨基酸的小; ③游离的α-氨基、 α-羧基和R基可发生与氨基酸中相应的类似反响,如茚三酮反响等; ④蛋白质局部水解后所得的肽假设不发生消旋,那么具有旋光性,短肽的 旋光度约等于组成氨基酸的旋光度之和,较长的肽的旋光度那么不是简洁加和 活性肽:具特别的生物学功能的肽段,如脑啡肽、谷胱甘肽、肌肽等 蛋白质测序的重要方法N-末端测定 二硝基氟苯〔DNFB〕法:肽游离末端NH2与DNFB反响生成DNP-肽,最终水解生成黄色DNP-氨基酸丹磺酰氯〔DNS〕法:用DNS取代DNFB,生成DNS-氨基酸 苯异硫氰酸〔PITC〕法:生成PTH-氨基酸,从肽上断裂下来 氨肽酶法:外切酶,但效果不好C-末端测定 肼解法:测定C-末端的最重要的化学方法,肽与肼反响,除C-末端氨基酸游离外,其他氨基酸转变为氨基酸酰肼化物复原法:C-末端氨基酸用硼氢化锂复原成相应的α-氨基醇羧肽酶法:最有效、最常用:羧肽酶A、羧肽酶B、羧肽酶C、羧肽酶Y二硫键的断裂 过甲酸氧化法:将二硫键氧化成磺酸基巯基化合物复原法:将二硫键复原成巯基,然后用烷基化试剂如碘乙酸爱护巯基,防止其重新被氧化氨基酸组成的测定 酸水解:是主要方法,多用HCl,同时辅以碱水解;所得氨基酸不消旋,但Trp全部被破坏,Ser,Thr,Tyr局部破坏,Asn和Gln的酰氨基被水解,生成Asp和Glu。

      多肽链的裂解 酶裂解:胰蛋白酶:专一性强,断裂Lys或Arg的羧基参加形成的肽键 糜蛋白酶:断裂Phe,Trp,Tyr,Leu等疏水氨基酸的羧基端肽键嗜热菌蛋白酶:专一性差,断裂Val,Leu,Phe,Tyr,Trp等氨基参加形成的肽键 胃蛋白酶:在酸性条件稳定,肽键 两侧均为疏水氨基酸在确定二硫键位置时,常用到此酶 其它酶:略 化学裂解:溴化氰〔CNBr〕:只断裂Met的羧基形成的肽键羟氨〔NH2OH〕:在pH9时,专一性断裂Asn-Gly之间的肽键,其它条件下不专一肽段的氨基酸测序 Edman化学降解法:用Edman试剂PITC与游离氨基作用生成PTH-氨基酸,并可用各种层。

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