PCR基因扩增实验室的规范化设置.pdf

PCR 基因扩增实验室的标准化设置为防止污染，必须严格遵循《临床基因扩增检验实验室设置标准》设置临床基因扩增检验实验室 临床基因扩增检验实验室四个隔开的工作区域中每一区域都须有专用的仪器设备各区域都必须有明确的标记，以防止设备物品如加样器或试剂等从其各自的区域内移出从而造成不同的工作区域间设备物品发生混淆进入各个工作区域必须严格遵循单一方向顺序，即只能从试剂贮存和准备区、标本制备区、扩增反应混合物配制和扩增区〔简称扩增区〕至产物分析区，防止发生交叉污染在不同的工作区域应使用不同颜色或有明显区别标志的工作服，以便于鉴别此外，当工作者离开工作区时，不得将各区特定的工作服带出 清洁方法不当也是污染发生的一个主要原因，因此实验室的清洁应按试剂贮存和准备区至扩增产物分析区的方向进行不同的实验区域应有其各自的清洁用具以防止交叉污染〔一〕试剂贮存和准备区下述操作在该区进行：贮存试剂的制备、试剂的分装和主反应混合液的制备贮存试剂和用于标本制备的材料应直接运送至试剂贮存和准备区，不能经过产物分析区在打开含有反应混合液的离心管或试管前，应将其快速离心数秒试剂原材料必须贮存在本区内，并在本区内制备成所需的贮存试剂。

当贮存试剂溶液经检查可用后，应将其分装贮存备用，防止由于经常打开反应管吸液而造成污染含反应混合液的离心管或试管在冰冻前都应快速离心数秒大多数用于扩增的试剂都应冰冻贮存为防止因单次反应取液而频繁的冻融主贮存试剂，应分装冰冻贮存试剂溶液贮存试剂的分装体积根据通常在实验室内一次测定所需的扩增反应数来决定主反应混合液的组成成份尤其是聚合酶的适用性和稳定性通过预试验来检查，评价结果必须有书面报告对于"热启动"技术〔在第一个高温变性步骤后加入酶〕，聚合酶也可不包含在主反应混合液中在整个本区的实验操作过程中，操作者必须戴手套，并经常更换此外，操作中使用一次性帽子也是一个有效地防止污染的措施 严禁用嘴吸取液体，加样器和吸头等必须经高压处理工作结束后必须立即对工作区进行清洁本工作区的实验台外表应可耐受诸如次氯酸钠的化学物质的消毒清洁作用实验台外表的紫外照射应方便有效由于紫外照射的距离和能量对去污染的效果非常关键，因此可使用可移动紫外灯〔254nm 波长〕，在工作完成后调至实验台上 60~90cm 内照射由于扩增产物仅几百 bp，对紫外线损伤不敏感，因此紫外照射扩增片段必须延长照射时间，最好是照射过夜实验室及其设备的使用必须有日常记录。

〔二〕标本制备区下述操作在该区进行：临床标本的保存，核酸〔RNA、DNA〕提取、贮存及其加入至扩增反应管和测定 RNA 时 cDNA 的合成 要正确使用加样器由于在加样操作中可能会发生气溶胶所致的污染，所以应防止在本区内不必要的走动可通过在本区内设立正压条件防止从邻近区进入本区的气溶胶污染为防止样本间的交叉污染，加入待测核酸后，必须盖好含反应混合液的反应管对具有潜在传染危险性的材料，必须有明确的样本处理和灭活程序 用过的加样器吸头必须放入专门的消毒〔例如含次氯酸钠溶液〕容器内实验室桌椅外表每次工作后都要清洁，实验材料〔原始血标本、血清标本、提取中的标本与试剂的混合液等〕如出现外溅，则必须分别处理并作出记录 对实验台适当的紫外照射〔254nm 波长，与工作台面近距离〕适合于灭活去污染可移动紫外线管灯可用来确保工作后对实验台面的充分照射 样本处理对核酸扩增有很大影响，必须使用有效的核酸提取方法，可在开展临床标本检测前对提取方法进行评价 用于 RNA 扩增检测样本制备好以后，应立即进行 cDNA 合成，因为cDNA 链较 RNA 稳定，保存相对容易为保证逆转录反应的需要，应在标本制备区设置一个以上的温育装置。

cDNA 合成的理想温度依所使用的酶而定，倾向于使用一步法：即使用在扩增反应缓冲液条件下具有逆转录活性的热稳定的 DNA 聚合酶进行逆转录，其较 cDNA 合成后再开盖以调节缓冲液或加入聚合酶进行扩增发生污染的可能性降低 待测 RNA 的 cDNA 拷贝须保存在标本制备区，不得在本区对样本进行 PCR 扩增〔三〕扩增区下述工作在本区内进行：DNA 或 cDNA 扩增此外，已制备的 DNA 模板和合成的 cDNA〔来自样本制备区〕的加入和主反应混合液〔来自试剂贮存和制备区〕制备成反应混合液等也可在本区内进行在巢式 PCR 测定中，通常在第一轮扩增后必须打开反应管，因此巢式扩增有较高的污染危险性，第二次加样必须在本区内进行 不能从本区再进入任何"上游"区域，可降低本区的气压以防止气溶胶从本区漏出 为防止气溶胶所致的污染，应尽量减少在本区内的走动如有加样则应在超净台内进行打开预处理过的反应混合液时必须防止液体溅出，尤其是在巢式扩增步骤之间一个简单的方法是在打开反应管前快速离心数秒可使用体积较小的离心机，因其所占实验台面小，易于用一只手操作，适合于大多数超净台防潮屏障如石蜡油或轻矿物油也具有防污染作用，但必须注意的是，矿物油本身也可能成为一种持续性的污染源。

用过的加样器必须注意清洁消毒 完成操作及每天工作后都必须对实验室台面进行清洁和消毒，紫外照射方法与前面区域相同如有溶液溅出，必须处理并作出记录〔四〕扩增产物分析区下述操作在本区内进行：扩增片段的测定 核酸扩增后产物的分析方法多种多样，如膜上或微孔板上探针杂交方法〔同位素标记或非同位素标记〕、琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳、Southern 转移、核酸测序方法等目前国内的商品试剂盒绝大部分均采用非同位素标记的微孔板上探针杂交方法，即 PCR-ELISA 方法，也有膜上探针杂交方法 本区是最主要的扩增产物污染来源，因此必须注意防止通过本区的物品及工作服将扩增产物带出在使用PCR-ELISA 方法检测扩增产物时，必须使用洗板机洗板，废液必须收集至1mol/L HC1 中，并且不能在实验室内倾倒，而应至远离 PCR 实验室的地方弃掉用过的吸头也必须放至 1mol/L HCl 中浸泡后再放到垃圾袋中按程序处理，如燃烧由于本区有可能会用到某些可致基因突变和有毒物质如溴化乙锭、丙烯酰胺、甲醛或同位素等，故应注意实验人员的安全防护 本区的清洁消毒和紫外仅供参考照射方法同前面区域本区如采用负压条件或减压情况下〔如安装排风扇〕可减少扩增产物从本区扩散至前面区域的可能性。