BLAST的M8格式结果文件说明.doc

m alignment view options: 比对显 示选项，其具体的说 明可以用以下的比对实例说明0 = pairwise,显示具体匹配信息（缺省）1 = query-anchored showing identities,查询-比上区域 ，显示一致性2 = query-anchored no identities,查询-比上区域，不显示一致性3 = flat query-anchored, show identities,查询- 比上区域的屏文形式，显示一致性4 = flat query-anchored, no identities,查询- 比上区域的屏文形式，不显示一致性5 = query-anchored no identities and blunt ends,查询-比上区域，不显示一致性，无突然的结束6 = flat query-anchored, no identities and blunt ends,查询 -比上区域的屏文形式，不显示一致性7 = XML Blast output,XML 格式的输出8 = tabular,TAB 格式的输出9 =tabular with comment lines,带注释行的 TAB 格式的输出10 =ASN, text,文本方式的 ASN格式输出11 =ASN, binary [Integer] default = 0,二进制方式的 ASN 格式输出-m 8 用法举例说明如下：A_query B_Sbjct 97.61 585 3 3 309 886 94498 95078 0.0 1017A_query B_Sbjct 100.00 303 0 0 913 1215 95092 95394 2e-172 601A_query B_Sbjct 100.00 209 0 0 1 209 94196 94404 3e-116 414A_query B_Sbjct 100.00 123 0 0 1234 1356 95413 95535 6e-65 244A_query B_Sbjct 100.00 41 0 0 210 250 94096 94136 5e-16 81.8A_query B_Sbjct 100.00 35 0 0 251 285 94440 94474 2e-12 69.9A_query B_Sbjct 100.00 29 0 0 885 913 95747 95775 7e-09 58.0A_query A_query 97.61 585 3 3 309 886 403 983 0.0 1017A_query A_query 100.00 303 0 0 913 1215 997 1299 2e-172 601A_query A_query 100.00 209 0 0 1 209 101 309 3e-116 414A_query A_query 100.00 123 0 0 1234 1356 1318 1440 6e-65 244A_query A_query 100.00 41 0 0 210 250 1 41 5e-16 81.8A_query A_query 100.00 35 0 0 251 285 345 379 2e-12 69.9A_query A_query 100.00 29 0 0 885 913 1652 1680 7e-09 58.0结果 12 列Query id,Subject id,% identity,alignment length,mismatches,gap openings,q. start,q. end,s. start,s. end,e-value,bit score本文详细出处参考：http://liuchen g.name/39/。