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应用ROC曲线评价耐甲氧西林葡萄球菌的检测方法

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  • 上传时间:2022-08-07
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    • 1、应用ROC曲线评价耐甲氧西林葡萄球菌的检测方法摘nbsp;要nbsp;目的:nbsp;nbsp;通过对耐甲氧西林葡萄球菌(MRS的常用检测方法及实验条件进行评价,选择特异性和敏感性较 nbsp;nbsp;好的方法和理想的实验条件。方法:nbsp;nbsp;以PCR法检测葡萄球 菌的mecA基因为“金标准王震,周丽萍, 刘智成,庄建伟,汪海青 摘 要 目 的:通过对耐甲氧西林葡萄球菌(MR$的常用检测方法及实验条件进行评价,选择特异性和敏感性较好的方法和理想的实验条件。方法: 以PCF法检测葡萄球菌的mecA基因为“金标准”,比较PBP2a交乳凝集试验法、头抱 西丁( FOX琼脂筛选法、苯唑西林(OXA琼脂稀释法(MIC)、FOX纸片扩散 法、OXA琼脂筛选法、OXA纸片扩散法检测MRS勺敏感性和特异性。同时应用 ROC曲线对实验方法及不同的实验条件进行评价。结果:PCR法共检出79株mecA基因阳性菌株,阳性率为73.8%。以PCR法为“金标准”,上述6种 方法的 ROC曲线下面积分别为0.994,0.964,0.955,0.946,0.932,0.862。结论: 选择最佳实验条件,用

      2、两种表型检测方法作平行检测,对可疑 结果用PBP2a交乳凝集试验或PCR法确诊。关键词 耐甲氧西林葡萄球菌 ; 药敏实验 ; 评价Application of ROC curve in theevaluation of the methods for detectionof methicillin-resistantstrains of staphylococciWANG Zhe,n ZHOU Li-ping , LIUZhi-cheng , ZHUANG Jian-wei, WANG Hai-qing(1.Department ofClinical Laboratory , the Second People s Hospital of Zhenjiang,Zhenjiang Jiangsu 212002;2. Department of Molecular Biol-ogy,School of Medical Technology , Jiangsu University, Zhenjiang Jiangsu212001;3. Department Nosocomial Infec

      3、tion Control, theSecondPeople s Hospital of Zhenjiang, Zhenjiang Jiangsu212002, China )Abstract Objective: To evaluate of sixtests for detection of methicillin-esistant strains of staphylococci. Then choosed the better methods and conditions for clinical experiment. Methods: To compare the sen-sitivity and thespecificity of the PBP2a latex agglutination method, efoxitin agarscreening method , oxacillinagar dilution method( MIC),cefoxitin disk diffusion method, oxacillin agar screening test andox

      4、acillin diskdiffusion method for detecting of MRS using PCRamplification mecA gene as “ gold standard ” . Receiver op - erating characteristic( ROC) curve was drawn , and the area under the curvewas calculated. Results: Therewere 79 isolates showing mecA-positive among 107 staphylococcal isolates by PCR, the rate was73.8%. The area under ROC curve of the six methods was 0.994,0.964, 0.955, 0.946, 0.932, 0.862 respectively.Conclusion: Foradvancing the sensitivity and the specificity, two methods

      5、should betested simultaneously.If the results were conflicting, the PCRassay or PBP2a latex agglutination test for detection of MRS should be operated.Key wordsMRS;antimicrobialsusceptibility test;evaluation近年来,随着广谱抗菌药物的应用,耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌(MRCNS的分离率逐渐增高、耐药 性不断增强 1,据报道该菌对苯唑西林的耐药率达 70%以上 2,因此,对临床分离的葡萄球菌进行耐甲氧西林葡萄球菌(MRS检测具有非常重要的临床意义。目前临床实验室对 MRS的常用表型检测方法有苯唑西林(OXA纸片扩散法、OXA琼脂稀释法(MIC)、OXA琼脂筛选法,2004年美国临床实验室标准化委员会(NCCLS推荐使用含30卩g /片的头抱西丁(FOX进行纸片扩散试验3,也有报道用FOX琼脂筛选法进行检测4。而判断MRS勺“金标准”,仍是PCR法检测葡萄球菌mecA基因,或检 测该基

      6、因编码的青霉素结合蛋白(PBP 2a,但由于实验条件限制及试剂价格昂 贵,这两种方法在一般基层实验室难以开展。而表型检测法仍然是大部分实验室的首选方法,但其实验影响因素较多,且各实验室之间检测条件及判断标 准不一,使结果缺乏可比性。本文对 107株临床送检标本中分离的 CNS以PCR 法扩增mecA基因片段作为“金标准”,对不同实验条件下的多种表型检测方法 进行检测,利用ROC曲线进行综合评价。1材料和方法1.1 材 料1.1.1 菌株来源葡萄球菌临床分离株 107株,从 2005年 1 月至 2006年 6月期间由本室及江苏大学 附属 医院检验科、江苏大学附属人民医院检验科从临床标本中留取,所有菌株按全 国临床检验操作规 程第二版鉴定到种,包括表皮葡萄球菌 51 株、溶血葡萄 球菌 16株、腐生葡萄球菌 10株、人葡萄球菌 6 株、模仿葡萄球菌 5株、头 状葡萄球菌 5株、耳葡萄 球菌 4株、华纳葡萄球菌 4株、孔氏葡萄球菌 3 株、木糖葡萄球菌 3 株。质控菌株为金黄色葡萄球菌 ATCC 25923( MSSA)、 ATCC2921(MSSA,购于浙江杭州天和微生物有限公司。JS0

      7、405 (MRSA由江苏省临床检验中心程梅老师提供。1.1.2试剂及仪器OXA纸片(1 卩 g/ 片),FOX纸片(30 卩 g/ 片),Mueller-Hinton(MH 琼脂为Oxoid 公司商品。OXA FOX抗生素标准品购于中国药品生物制品检定所;抗PBP2aK乳凝集试剂为法国生物梅里埃公司商品(批号:796773801) ;PCR所需的各种试剂均为TAKARA公司商品,引物参照文献由宝生物工程(大连)有限公司合成5, P1:5 5 -GTA GAA ATG ACT GAA CGT CCG ATA A3, P2:5 5 -CCA ATT CCA CAT TGT TTC GGT CTA A-;仪器: Hettich- UNIVERSAL 16型 低温高速离心机,德国Mastercycler Perso nal 5332型PCRT增仪。1.2方法1.2.1 OXA纸片扩散法采用 K-B 法,把 0.5 麦氏单位浊度的菌悬液分别均匀涂布于普通 M-H琼脂以及加入1% 2% 3% 4% NaC1的 M-H琼脂表面上,贴 OXA氏片(1 卩g/片),置30E和35C于24 h和48 h两

      8、个时点孵育后,对着透射光线仔 细观察,测量抑菌环直径,CNS以18 mm为敏感,w 17 mm 为耐药。质控菌 株为金黄色葡萄球菌ATCC259231.2.2 OXA琼脂稀释法将0.5 麦氏单位浊度的 菌悬液用无菌生理盐水 10倍稀释后,接种在 OXA 浓 度(卩 g/ml )分别为 0.125,0.25,0.40,0.50,0.60,0.70,0.80,1.0, 2.0,4.0,6.0,8.0并含2% NaCl的MH琼脂上,接种量大约为 104 CFU, 35C培养24 h,仔细观察,判定MICo质控菌株为金黄色葡萄球菌ATCC292131.2.3 OXA琼脂筛选法将0.5麦氏单位浊度的菌悬液分别点种在 OXA浓度为 0.40, 0.50, 0.60,0.70,0.80,1, 2, 4,6卩g/m1并含4%NaC的MH脂上,35 C培养48 h,仔细观察,只要有一个菌落生长即判为阳性。质控菌株为金黄色葡萄球菌ATCC29213用不同OXA浓度所检测的结果,计算ROCS线下面积,选择面积最大时的 OXA浓度作为琼脂 筛选法的最适药物浓度。1.2.4 FOX 纸片扩散法采用普通M-H琼脂

      9、,培养温度为35 C,其他操作同苯唑西林纸片扩散法。判断标准:CNS以抑菌环直径25 mm为敏感,w 24 mm为耐药。质控菌株为金黄色葡萄球菌 ATCC 25923。1.2.5 FOX 琼脂筛选法参照文献 4进行。头抱西丁的浓度分别为1, 2, 4, 8, 16卩g/m1。平板上只要有一个菌落生长即判为MRS1.2.6抗PBP2at乳凝集法操作严格按说明书进行。1.2.7 PCR 反应 参照文献 5操作,以 310 bp处 出现区带判为mecA基因阳性。金黄色葡萄球菌ATCC25923( MSSA为阴性对照, JS0405(MRS)A 为阳性对照。1.3 统计学处理采用SPSS10.0统计软件绘制ROCS线并计算曲线下面积。本文以OXA琼脂稀释法为例作图,其他方法图略。2结果2.1 mecA基因及PBP2a检测结果107株CNS中检出mecA基因阳性为79株,阴性28株。阳性检出率为73.8%。以mecA基因 检测结果作为“金标准”,PBP2at乳凝集法的敏感性为98.7%(78/79),特异性为100% (28/28 )。其ROCS线下面积为0.994。2.2 OXA纸片扩散法检测结果孵育24h与48 h的结果基本一致;相同条件下30 C比35 C特异性高;用不同NaCI 浓度的MH 琼脂置30E孵育24 h检测,其ROCS线下面积分别为:S普通 MH =0.734, S1%NaCI=0.807, S2%NaCI=0.862 , S 3%NaCI =0.843,S4%NaCl=0.8302.3 OXA琼脂稀释法检测结果按CLSI / NCCLS 2005 标准 6, CNS以 MIC 0.25 卩 g/m1 为敏感,0.50 卩g/m1为耐药作为

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