NMDS分析过程--精选文档
2页PCORD5:Nonmetric Multidimensional scaling (NMDS)以微量热指标数据为例1. 数据输入格式其中,Number指的是土样个数;Species指测定指标;Excel文件格式为.xls(因为PCORD5只识别这个格式)。2. 安装并打开PCORD5软件软件界面:导入数据:FileImport MatrixMain Matrix我们文件类型是Excel所以就选择Excel Spreadsheet选项,点击OK。选择所需要的文件。3. 数据分析Ordination菜单栏NMS/NMDS选项。Autopilot:三种模式,根据需要选择模式。Distance Measure:根据数据选择合适的方法常用的是Sorensen(Bray-Curtis)、Relative Sorensen、Relative Euclidean不用修改点击OK。4. 结果输出5. 作图(1)(2)二维图结果(3)Statisticscorrelations with Main Matrix,点击OK。(4)StatisticsPercent of Variance In Distance Matrix。点击OK。Origin8作散点图:由于PCORD5做出来的图不好修改,所以将数据拷贝出来用Origin8来做图。
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