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现代分子生物学要点总结(朱玉贤版)

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  • 卖家[上传人]:鲁**
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  • 上传时间:2023-08-12
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    • 1、#现代分子生物学要点总结(朱玉贤版)一、绪论两个经典实验1、 肺炎球菌在老鼠体内的毒性实验:先将光滑型致病菌(S型)烧煮杀活性以后、以及活的粗糙型细菌(R型)分别侵染小鼠发现这些细菌自然丧失了治病能力;当他们将经烧煮杀死的S型细菌和活的R型细菌混合再感染小鼠时, 实验小鼠每次都死亡。解剖死鼠, 发现有大量活的 S型细菌。实验表明,死细菌 DNA进行了可遗传的转化,从而导致小 鼠死亡。2、 T2噬菌体感染大肠杆菌:当细菌培养基中分别带有 35S或32P标记的氨基酸或核苷酸, 子代噬菌体就相应含有 35S标记的蛋白质或32P标记的核酸。分别用这些噬菌体感染没 有放射性标记的细菌,经过12个噬菌体DNA复制周期后进行检测,子代噬菌体中几 乎不含带35S标记的蛋白质,但含30%以上的32P标记。说明在噬菌体传代过程中发挥 作用的可能是DNA而不是蛋白质。基因的概念:基因是产生一条多肽链或功能RNA分子所必需的全部核苷酸序列。1、染色体与DNA嘧啶腺嘌呤鸟嘌呤胞嘧啶尿嘧啶胸腺嘧啶嘌呤染色体性质:1、分子结构相对稳定;2、能够自我复制,使亲、子代之间保持连续性;3、能指导蛋白质的合成,从而控制生命

      2、过程;4、能产生可遗传的变异。组蛋白一般特性:1、进化上极端保守,特别是H3、H4; 2、无组织特异性;3、肽链上氨基酸分布的不对称性;4、存在较普遍的修饰作用;5、富含赖氨酸的组蛋白 H5非组蛋白:HMG蛋白;DNA结合蛋白;A24非组蛋白真核生物基因组 DNA真核细胞基因组最大特点是它含有大量的重复序列,而且功能DNA序列大多被不编码蛋白质的非功能蛋白质所隔开。人们把一种生物单倍体基因组DNA的总量称为C值,在真核生物中C值一般是随着生物进化而增加的,高等生物的C值一般大于低等动物,但某些两栖类的C值甚至比哺乳动物还大,这就是著名的C值反常现象。真核细胞DNA序列可被分为 3类:不重复序列、中度重复序列、高度重复序列。真核生物基因组的特点:1、真核生物基因组庞大,一般都远大于原核生物的基因组;2、真核基因组存在大量的的重复序列;3、真核基因组的大部分为非编码序列,占整个基因组序列的90%以上,这是真核生物与细菌和病毒之间的最主要的区别;4、真核基因组的转录产物为单顺反之;5、真核基因组是断裂基因,有内含子结构;6、真核基因组存在大量的顺式元件,包括启动子、增强子、沉默子等;7、真核

      3、基因组中存在大量的 DNA多态性;8真核基因组具有端粒结构。原核生物基因组的特点:1、结构简练,绝大部分用来编码蛋白质,只有很少一部分控制基因表达的序列不转录;2、存在转录单元,原核生物 DNA序列中功能相关的 RNA和蛋白质 基因,往往丛集在基因组的一个或者几个特定部位, 形成功能单位或转录单元, 可以被一起 转录为含多个 mRNA的分子;3、有重叠基因,所谓重叠基因就是同一段 DNA携带两种或 以上不同的蛋白质的编码信息。DNA的结构DNA又称脱氧核糖核酸,是deoxyribonucleic acid的简称。L=T+W,L指环形DNA分子两条链间交叉的次数,只要不发生断裂,L是一个常量。T为双螺旋的盘绕数, W为超螺旋数。双螺旋 DNA的松开导致负超螺旋,而拧紧则导致正超螺 旋。双螺旋碱基间距(nm)螺旋直径(nm)每轮碱基数螺旋方向A-DNA0.262.611右B-DNA0.342.010右Z-DNA0.371.812左DNA的复制半保留复制: Semi -conservative replication ;半不连续复制: Semi-discontinuous replicati

      4、on 把生物体的复制单位称为复制子,一个复制子只含一个复制起始点。归纳起来,无论是原核生物还是真核生物,复制起点是固定的,表现为固定的序列,并识别参与复制起始的特殊蛋白质。复制叉移动的方向和速度虽是多种多样的,但以双向等速方式为主。复制的几种主要方式双链DNA的复制大都以半包六复制方式进行的,通过眼”型、0型、滚环型或 D-环型等以复制叉的形式进行。1、 线性DNA双链进行双向复制时,由于已知的DNA聚合酶和RNA聚合酶都只能从 5 到3移动,所以,复制叉呈眼型;2、环状双链DNA复制可分为6型、滚环型和D-环形几种类型I、0型,大肠杆菌染色体 DNA是环状双链DNA ,它的复制是典型的6型复制,从一个起点 开始,同时向两个方向进行复制,当两个复制叉相遇时,复制就停止H、滚环型,是单向复制的一种特殊方式,在噬菌体中很常见。DNA的合成由对正链原点的专一切割开始,所形成的自由5端被从双链环中置换出来并为单链 DNA结合蛋白所覆盖,使其3 -OH端在 DNA聚合酶的作用下不断延伸川、D-环形,也是单向复制的一种特殊方式,双链环在固定点解开进行复制,但两条链的合成是高度不对称的,最初仅以一条

      5、母链作为新链合成的模板,迅速合成出互补链,另一条链则称为游离的单链环。原核生物和真核生物DNA复制的特点原核生物DNA复制特点DNA双螺旋的解旋拓扑异构酶(DNA topoisomerase):消除解链造成的正超螺旋的堆积,消除阻碍解链继续进 行的这种压力,使复制得以延伸。拓扑异构酶I,催化DNA链的断裂和重新连接,每次只作用于一条链,不需要辅助 因子如ATP等;拓扑异构酶H能同时断裂和连接两条DNA链,通常需要辅助因子。DNA解链酶(DNA helicase):解开双链 DNA (DnaB蛋白:解螺旋酶; DnaA蛋白:辨认复 制起始点;DnaC蛋白:辅助DnaB在起始点上结合并打开双链)单链结合蛋白(SSB):保证被解链酶解开的单链在复制完成前能保持单链结构 DNA复制的引发所有的DNA复制都是从一个固定起点开始的,而且目前所知的DNA聚合酶都只能延长DNA链而不能从头合成 DNA链。DNA复制时,往往先由 RNA聚合酶在DNA模板上合成 一段RNA引物,再由DNA聚合酶从RNA引物3末端开始合成新的 DNA链。DNA聚合酶功能DNA聚合酶IDNA聚合酶n (修复)DNA聚合酶川聚

      6、合作用5t3有有有外切酶活性5宀3有无无外切酶活性3宀5有有有生物学活性10.0515聚合酶川部分亚基的功能亚基a03功能聚合活性3宀5核酸外切 酶活性组建核心酶两个 迎基形成滑动夹子,提咼酶的持 续合成能力真核生物DNA复制的特点真核生物DNA复制与原核生物 DNA复制有很多不同,例如,真核生物每条染色体上可以 有多个复制起点,而原核生物只有一个复制起点;真核生物DNA的复制只能在分裂期进行,原核细胞在整个细胞周期都能进行;真核生物的染色体在全部完成复制前,各个起点上DNA不能再开始,而在快速生长的原核生物中,复制起点可以连续开始新的DNA复制,表现虽然只有一个复制单元,但却可有多个复制叉。真核生物DNA复制叉的移动速度不到大肠杆菌的1/20,因此,人类 DNA中每隔30000300000个碱基就有一个复制起始点;真核生物 DNA聚合酶有15种以上,大肠杆菌中存在的聚合酶有5种DNA复制的调控真核细胞中DNA复制有3个水平的调控:1、细胞生活水平调控,也称限制点调控,决定 细胞停留在G1期还是进入S期;2、染色体水平调控;3、复制子水平调控,决定复制的起始与否。DNA的修复错配修复一

      7、旦复制通过复制起点,母链就会在开始DNA合成前的几秒至几分钟内被甲基化,此后只要两条DNA链上碱基配对出现错误,错配系统就会根据“保存母链,修正子链”的原则, 找出错误碱基所在的 DNA链,并在对应于母链甲基化腺苷酸上游鸟苷酸的5位置切开子链,合成新的子链片段。切除修复切除修复是DNA损伤最为普遍的方式,主要分为碱基切除修复和核苷酸切除修复重组修复(复制后修复)先从同源DNA母链上将相应核苷酸序列片段移至子链缺口,然后再用新合成的序列补上母 链空缺,主要作用是重新启动停滞的复制叉。DNA直接修复DNA直接修复不需要切除碱基或核苷酸,最常见的例子是DNA光解酶把在光下或经外线光照射形成的环丁烷胸腺嘧啶二体及6-4光化物还原成单体的过程。SOS反应细胞DNA受到损伤或复制系统受到抑制的紧急情况下,细胞为求生存而产生的一种应急措施,当DNA两条链的损伤邻近时,损伤不能被切除修复或重组修复,这时损伤处的DNA出现空缺,再随机加上核苷酸,容易造成突变。DNA的转座DNA的转座或称移位,是由可移位因子介导的遗传物质重排的现象,频率很低。转座子(Tn)是存在于染色体 DNA上可自主复制和移位的基本单

      8、位,原核生物的转座子包 含4类:1插入序列(IS); 2、类转座子因子;3、复合转座子,两端由IS或类IS构成, 带有某些抗药性基因或其他宿主基因,一旦形成复合式转座子,IS序列就不能再单独移动;4、TnA转座子家族,两端为IR,可编码转座酶,解离酶和抗性物质。真核生物中的转座子主要包括转座子和反转座子。玉米细胞内存在自主型和非自主型两类转座子,非自主型转座子单独存在时是稳定的,不能转座,当基因组同时含有属于同一家族的自主型转座子时,它才具备转座功能。 转座子可分为复制型和非复制型,转座酶和解离酶分别作用于原始转座子和复制转座子。转座作用的遗传学效应1引起插入突变;2、产生新的基因;3、产生染色体畸变(DNA重复、缺失或倒位);4、 引起生物进化 组蛋白的种类、修饰类型及其生物学意义根据电泳性质可以把组蛋白分为Hi、H2A、H2B、H3、H4,这些组蛋白都含有大量赖氨酸和精氨酸。组蛋白的修饰作用包括甲基化,乙酰化,磷酸化以及ADP核糖基化等。一般来说,组蛋白乙酰化能选择地使某些染色质区域的结构从紧密变的松弛,开放某些基因的转录, 增#强其表达水平;而组蛋白甲基化即可抑制也可增强基因表达

      9、,乙酰化修饰和甲基化修饰往往是相互排斥的。简述DNA聚合酶I和 Klenow的结构和功能占DNA聚合酶I蛋白2/3的C端区域,相对分子质量 68000,具有DNA聚合酶活性和 3 t5核酸外切酶活性,即可合成也可降解DNA,保证DNA复制的准确性;占 DNA聚合酶I蛋白1/3的N端区域,相对分子质量 35000,具有5 3核酸外切酶活性,可做用于双链 DNA,又可水解5 端或距5 端几个核苷酸处的磷酸二酯键。DNA聚合酶I在 DNA直接修复、除去冈崎片段 5端RNA引物方面具有重要作用。Klenow大片段是用蛋白酶水解 DNA聚合酶I所得的大片段区域, 具有53聚合酶活性和35 核酸外切酶活性,在基因工程中有广泛应用,主要有:修复反应、制备平末端;标记 DNA3突出末端;双脱氧末端终止法进行DNA序列分析等。三、生物信息的传递(上)RNA转录的基本过程模板识别真核细胞中的模板识别与原核细胞不同,真核生物RNA聚合酶不能直接识别基因的启动子区,需要转录因子的辅助蛋白质按特定的顺序结合于启动子上,RNA聚合酶才能与之相合并形成复杂的前起始复合物(PIC),以保证有效的起始转录。转录起始转录起始就是RNA链上第一个核苷酸键的产生,该过程不需要引物,RNA聚合酶通过启动子的时间代表一个

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