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各款荧光定量PCR仪的性能比较

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  • 卖家[上传人]:工****
  • 文档编号:485241152
  • 上传时间:2023-11-15
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    • 1、各款荧光定量PCR仪的性能比较本人从事荧光定量PCR检测试剂的开发工作,用过市场上主流的多款荧光定量PCR仪, 如 ABI5700, ABI7700, ABI7000, ABI7300, ABI7500, MJ opticon, MJ opticon2, bio-rad ICycler, LightCycler1.5,roter-gene3000,Stratagene Mx3000P,line-gene 等等。这 种仪器各有各的特点,但都存在不足之处。ABI公司的荧光定量PCR仪产品比较多,成系列,但目前而言ABI5700和ABI7700不能 实时在线地检测荧光,因而已经退出历史舞台,尤其是ABI7700,不但很贵,而且采用苹果 机电脑,使用很不方便ABI7000目前也已经淘汰,我用的这台仪器老出问题,曲线极不光 滑,但同样的反应体系在国产机杭州博日line-gene上曲线非常好,在ABI7500上曲线也很 光滑,所以,本人估计是ABI7000设计上有不足之处。而且卤钨灯特别容易坏,在南方,我 们实验室平均5个月换一个,配件容易坏,后续使用成本就会高一些。现在市场上的ABI7300就是

      2、ABI7000的简单升级版,硬件设计上几乎没有改变,只是 换过几个性能更好的配件,软件有所升级。另外我个人感觉ABI7900(ABI公司第二代产品)有些华而不实,价格应该是所有荧光 定量PCR仪中最贵的,硬件上跟ABI7700差不了太多,但性能指标还不如ABI7500(ABI公 司第三代产品),硬件设计上也不如ABI7500合理。所以这个型号的仪器,谁买了,用的时 候会不呼上当。ABI7500是ABI公司最成功的产品,各方面性能都不错,虽然加热模块还是有一些边缘 效应,但使用中央的孔位效果可以得到保证,在96孔板使用中间的48个孔位,结果都能得 到保证。总的来说,ABI公司在荧光定量领域上还是做出很多贡献的,其仪器在科研上还是可以 用的,但由于硬件设计上的缺陷,需要额外的ROX染料进行校正,并且占用了一个检测通道。 国内的试剂厂商都不加ROX染料,科研用户一般也不使用,所以其检测的准确性和重复性还 是很难保证的,尤其浓度较低的模板进行检测时效果不佳,偏差会很大。罗氏Roche的LightCycler以运行速度快而著称,在国内市场占有率最高,其设计保 证了临床诊断的准确性,又充分考虑了科

      3、研功能。但本人最初使用时老出问题,有时候阳性 曲线做不出来,后来发现这跟其独特的毛细管设计有关系,因为毛细管很细,所以反应液在 毛细管中的对流交换非常不畅,没有充分混匀时就加入毛细管会影响反应的进行,当然,热 启动酶就不会有这方面的问题了。所以本人在操作时都特意将反应液混合充分后再加入毛细 管,这样在后来的实验中就没有出现过问题。本人开始使用罗氏的仪器时最怕毛细管断裂,操作时特别担心,熟练以后,规范使用 随机赠送的操作配件,也没见毛细管断过。而且最重要的是,罗氏的仪器稳定性非常好,灵 敏度明显比其它仪器高,这也许跟毛细管和其检测元件有关系,检测重复性也非常好,所得 定量结果可信度高。本人所使用的罗氏LightCycler1.5三四年了也没出现硬件的故障。另外,采用毛细管最大的优点恐怕就是可以大量节省成本,因为目前只有毛细管这种 反应装置才可以采用10uL的反应体系而不影响试剂的检测灵敏度和稳定性,这样大大地节 省了试剂的成本。同样用普通PCR反应管进行10uL体系的荧光定量实验,效果很差,而且 明显灵敏度下降,检测结果不稳定。罗氏公司Roche推出的LightCycler2.0在原有基

      4、础上 检测通道增加到六个,软件功能也更加丰富。据说最新推出的LightCycler480是目前全球 最先进的荧光定量PCR仪,突破了传统技术的瓶颈,推出了不具边缘效应的高通量荧光定量 PCR仪。具体没有用过,听说使用非常灵活。MJ的仪器总体上而言比较稳定,但检测灵敏度不高,功能单一,检测通道不多,运行 时间太长,一般一次实验要两个多小时。所谓的温度梯度功能在荧光定量PCR平台上一点用 处都没有,这主要是由该技术的原理决定的,所以这个功能只是作秀了。伯乐的ICycler仪器也许是设计上的缺陷还是什么原因,同样的反应体系,在该仪器 上进行实验时,阳性样本的扩增曲线荧光增量比较低,检测效果不好,所以在全国很少用户 使用该仪器。伯乐的荧光定量PCR仪目前在国际上仍属低端产品,返修率太高。Line-gene仪器的使用比较方便,但返修率较高,不过厂家就在国内,售后服务非常及 时。roter-gene3000跟罗氏公司的LightCycler有很多相似之处,只是roter-gene在操作 时比较麻烦,而且采用普遍反应管,光透性不好,影响了检测结果,这可以从其原始曲线上 看出来,但该仪器的软件所表现的

      5、是对数曲线,把其原始曲线上的曲析不平掩盖了,其灵敏 度不高,在进行微量检测时往往会得到大量假阴性结果。Stratagene Mx3000P据说是信价比最高的荧光定量PCR仪,但做工非常粗糙,打开样 本仓都可以看到线路和齿轮,估计是为了降低成本而偷工减料了。其采用的卤钨灯光源,使 用成本也非常高。该仪器一般在使用中央孔位进行实验时,结果不错,但使用周边孔位时效 果很差。而且其检测灵敏度也比较低。听说去年Stratagene公司因为PCR的酶侵犯了美国第三浪潮公司的专利权,判罚了 2 200万美元,其荧光定量PCR仪也属侵权产品,这让我想起MJ破产的案例,由于MJ的荧光 定量PCR仪侵犯了 ABI和Roche的专利权而被重罚,最终破产而被伯乐公司低价收购。如果 Stratagene被罚破产的话,其不一定这么幸运有公司收购它,最终的受害者是广大用户, 其售后服务无法得到保证,配件得不到供应。一般而言,用户要选择什么样的仪器,关键看自己将来开展的工作,我个人认为,在 临床诊断上,仪器的稳定性和检测准确性、检测灵敏度当然是首选的指标,在科研上荧光定 量PCR技术只会用于整个课题中一个环节,其结果并没有实际意义,其意义在于对后续研究 的指导性,当然所得数据越准确,对后续研究的指导性就越高。结果偏差越大的仪器反而会 误导用户。仪器厂商推出的所谓四色五色检测通道都是骗人的。80%的用户一辈子只用到一个通 道,而且科研用户不会因为做了多通道检测实验而发好文章,除非期刊的编委太弱智。只不 过检测通道多了,对荧光素的选择余地比较大。仪器的整体性能才是更值得关注的,如检测 灵敏度、各反应孔位的一致性、仪器稳定性等等。当然还要看一下经费情况,经费充足可以买个好的,经费不多,就买个实用的,花哨 的低端产品很难解决实际问题。(以上观点只代表作者本人)。

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