pubmed文献检索.ppt

PubMed 网上MEDLINE检索 基本情况检索方法结果处理 基本情况 PubMed简介 PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心 NCBI 开发的用于检索MEDLINE数据库的网上检索系统 进入PubMed的方法 Http www ncbi nlm nih gov pubmed 数据来源 MEDLINEInProcessCitationsPublisher SuppliedCitations Medline 收录文献起止时间1948年以来医学 护理 牙科 兽医 卫生保健 基础医学70多个国家和地区的5000多种生物期刊 图书书目文摘条目2000万条 InProcess 1998年开始建立 是一个临时性医学文献数据库收录由出版商提供的尚未经过规范化处理的新数据提供简单的书目信息和文摘数据每周转入MEDLINE一次有inprocess的标记 Publisher SuppliedCitations 由出版商提供的电子文献记录 不属于MEDLINE收录范围的标记为 PubMed 或 PubMed assuppliedbypublisher 出版商提供的先于印刷版文献出现的网络版题录 Epubaheadofprint 检索方法 基本检索功能Limits检索功能高级检索功能主题词数据库检索功能其他检索功能 基本检索功能自动词语匹配功能强制检索功能截词检索布尔检索字段检索 自动词语匹配功能 自动词语匹配是PubMed最具特色的检索功能之一 PubMed会自动对输入的检索词进行分析 匹配 转换并检索 是一种智能化的检索过程 自动词语匹配基本原理 对输入的检索词 系统首先在多个索引词表MeSH转换表刊名转换表著者索引及转换表进行搜索 比对 并自动转换为相应的MeSH主题词 著者或刊名 自动词语匹配基本原理 再将检索词在allfields 所有字段 中检索 并执行 OR 布尔逻辑运算 如果输入多个检索词或短语词组 系统会继续将其拆分为单词后分别在allfields 所有字段 中检索 单词之间的布尔逻辑关系为 AND 如果在3个转换表中都没有 把词组分开重复进行自动匹配直到找到匹配词为止 如果还没有找到匹配词系统将把单个词用逻辑 与 组配并到所有字段中检索 singlecell singleperson MeSHTerms OR single AllFields AND person AllFields OR singleperson AllFields OR single AllFields AND cell AllFields OR cells MeSHTerms OR cells AllFields 强制检索功能 如果将短语作为一个词组进行检索 可用 将其引起来 系统不进行自动词语匹配的转换系统不能进行扩展检索 singlecell single cellsinglecell ti 截词检索 截词符 可代表多个字符PubMed一次最多可以检索出600个词形变异词 截词功能只限于单词 对词组无效 布尔检索 布尔运算符AND OR NOT必须大写从左至右进行布尔运算以通过加圆括符改变运算顺序 检索词后附加字段标识字段标识要用方括号括起来 位于检索词之后例如dna mh ANDcrick au AND1993 dp 字段限定检索 Limits限定检索功能 出版日期出版类型语种研究对象限制检索子集年龄性别可以对全文 文摘限制检索可以限制检索字段 练习 查找1997 2000高血压 hypertension 与鼻出血 nosebleed 的有关文献 高级检索 advancedsearch 检索栏searchbox检索编辑器searchbuilder检索史history更多资源moreresources检索细节details 检索编辑器searchbuilder 查找微量元素铜 铁 锌与白血病的文献 CopperIronZincleukemia MeshDatabase检索 浏览Mesh词表选择规范化主题词选择副主题词查看主题词注释浏览树状结构表建立检索式 利用MeSH主题词检索有关艾滋病的文献 MeSH主题词检索是PubMed最具特色的检索功能之一 能保证较好的查全率和查准率 这是因为 1 主题词对同一概念的不同表达方式进行了规范 2 主题词可以组配相应的副主题词 使检索结果更加专指 3 用主题词的树状结构表 可以很方便进行主题词的扩展检索 Explode 默认状态下 系统自动对含有下位概念的主题词进行扩展检索 点选DoNotExplodethisterm则不进行主题词扩检 4 应用MeSH主题词的MajorTopic 主要主题词 检索 可以使检索结果更加准确 点选RestrictionsSearchtoMajorTopicheadingsonly 限定检索结果为主要主题词 建立检索式 如果有多个主题词 可以先分别对每个主题词进行检索 再在高级检索的SearchHistory中用检索序号进行布尔逻辑运算 也可以通过主题词检索页面的PubMedsearch直接建立检索式 膝关节滑囊炎的诊断 要求膝关节为主要主题词 其他检索功能 特定文献检索 点击singlecitationmatcher或batchcitationmatcher按界面提示输入所知信息点击search ClinicalQueries临床咨询 研究范畴 一般疾病的病因学 预后 诊断 预防以及治疗FindingSystematicReviews 提供系统评价 meta分析 临床试验综述临床指南等循证医学文献信息的查找MedicalGeneticsSearches 检索结果的处理 显示保存与输出 显示 默认格式 显示设置 保存与输出 其他工具 MYNCBISAVEHISTORY 小结 1 PubMed基本检索提供的自动词语匹配功能一般适合检索经验有限的初级用户 也适合对课题做初步检索 大致了解检索结果的分布情况 因为自动词语匹配检索有较好的查全率 但因为自动进行词语拆分 查准率有时不能令人满意 2 PubMed的主题词检索是其最具特色的功能之一 能保证较好的查准率及查准率 主题词组配副主题词使检索结果更为专指 限定在主要主题词检索能使结果更准确 3 但是主题词检索也有一些固有的缺陷 比如很多专指的概念没有相应的主题词 一些新出现的概念要几年后才收录为主题词这种情况下 不宜采用主题词检索 采用字段限定检索等方法也能得到较好的查准率 此外 主题词检索还可能会漏掉一些最新的文献 inprocesscitations 这也是需要注意的 4 熟练运用PubMed限定功能 和临床查询 引文匹配等工具能大大提高检索效率 作业 1 查找有关活体供 Livingdonor 肝移植 livertransplantation 的有关信息 要求查找2005年以来的临床试验 并且用英文发表的文献2 用Meshdatabase检索主要内容为前列腺癌 prostatecancer 的文献 将检索的结果的题录和文摘存储到本地硬盘中 3 查找涉及儿童骨肉瘤 osteosarcoma 手术后使用顺铂 cisplatin 进行化疗的文献 要求骨肉瘤作为主要研究内容 选择部分文献通过e mail发送到个人信箱中 4 检索有关更昔洛韦 Ganciclovir 用于预防与治疗器官移植 OrganTransplantation 后巨细胞病毒感染 CytomegalovirusInfection 的文献 使用基本检索 Mesh主题词检索和字段限制检索 将检索词限制到标题字段 比较三种检索的结果 评价这三种检索的检索效率 。