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药物设计与CADD中常用的指标和范围.docx

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  • 卖家[上传人]:ni****g
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  • 上传时间:2023-01-03
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    • 表3药代虚拟筛选的指标和范围指标内容范围CNS预测中枢活性,-2 (非活性),+2 (活性)-2 - +2QPlogHERG预测阻断HERG K+通道的IC50的对数值< -5QPPCaco肠吸收模型,预测在Caco-2细胞的穿透能力(nm/sec)<25 差,>500 非 常好QPlogBB预测脑-血分配系数的对数值-3.0 - 1.2QPPMDCK预测对MDCK的穿透能力(nm/sec )<25 差,>500 非 常好QPlogKp预测对皮肤的穿透能力log Kp-8.0 - -1.0#metab可能存在的代谢反应数1-8QPlogKhsa预测与人血浆白蛋白的结合常数的对数-0.5 -1.5Human OralAbsorption预测人的吸收程度,1、2、3分别代表低、 中、高PercentHuman OralAbsorption定量预测人吸收的程度0 - 100%>80%高吸收,<25%低吸收i)药学性质的虚拟筛选药学性质在早期筛选中最关注的是稳定性、溶解性,透膜性通常归在药代性 质中,稳定性的化合物本身分解或参与反应的综合表现,是化学反应活泼程度的 反映,溶解性和透 膜性是决定制剂的重要性质。

      药学虚拟筛选主要采用 Schrodinger QikProp 3.2和方法和指标,也是比较成熟的计算工具具体指标 和范围如下表4:表4药学性质虚拟筛选的指标和范围指标内容反映性质范围QPlogPC16预测化合物在正十六烷和气相 中的分配系数脂溶性和挥 发性4.0 - 18.0QPlogPoct预测化合物在辛醇和气相中的 分配系数脂溶性和挥 发性8.0 - 35.0QPlogPw预测化合物在水和气相中的分 配系数水溶性和挥 发性4.0 -45.0QPlogPo/w预测化合物在辛醇和水中的分 配系数油水分配系 数-2.0 -6.5QPlogS预测饱和水溶液中化合物的溶 解度(mol/L)对数溶解度-6.5 -0.5CIQPlogS预测饱和水溶液中化合物的溶 解度(mol/L)对数(构象不依 赖的算法)溶解度-6.5 - 0.5#rtvFG具有反应性的功能团数量稳定性0 - 2IP(ev)PM3计算的离子化势稳定性7.9 -10.5EA(eV)PM3计算的电子亲和势稳定性-0.9 -1.7ii) 虚拟筛选的综合初筛指标为了减少无效的筛选,人们一直在总结简单的方法对分子进行早期初筛,著 名的“Lipinski五规则”就是一个综合初筛指标:mol_MW < 500, QPlogPo/w < 5, donorHB < 5, accptHB < 10。

      后来又增加 了 “Jorgensen 3 规则”:QPlogS > -5.7, QP PCaco > 22 nm/s, # Primary Metabolites < 7,超过这个规则口服 可能性极低表5 Schrodinger QikProp 3.2还总结了范围更精确的指标:指标内容范围mol_MW分子量130.0 -725.0dipole分子偶极1.0-12.5SASA溶剂可及面积300.0 -1000.0FOSA疏水性溶剂可及面积0.0 -750.0FISA亲水性溶剂可及面积7.0 -330.0donorHB氢键供体数0.0 - 6.0accptHB氢键受体数2.0- 20.0QPlogPo/w油水分配系数-2.0 -6.5。

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