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中华骨髓库cwd表22版本资料.pdf

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    • 中国中国常见及确常见及确认的认的 HLA 等位基因表等位基因表(CWD)2.2 版本版本 中华骨髓库中华骨髓库 CWDCWD 表编撰组表编撰组 2012016 6- -0 02 2- -1 15 5 前言前言 自 1958 年发现第一个人类白细胞抗原(HLA)A2 抗原以来,各国科学家多年来通过协作 和技术创新,极大推动了 HLA 领域的发展和应用,在 HLA 结构、功能、多态性、组织器官 移植应用、人类群体遗传和进化分析等方面取得了重大成就目前 HLA 分型技术已广泛应 用于多个领域,如造血干细胞捐献者建库、HLA 群体遗传多态性、HLA 生物学功能、实体器 官和造血干细胞移植供受者组织相容性配型、与某些疾病的关联、人类遗传进化、药物个 性化选择等方面 HLA 系统具有高度遗传多态性,现发现的 HLA 抗原共有 165 个,其中 HLA-A 位点有 28 个、HLA-B 位点有 62 个、HLA-C 位点有 10 个、HLA-DR 位点有 24 个、HLA-DQ 位点有 9 个、 HLA-Dw 位点有 26 个、HLA-DP 位点有 6 个根据 IMGT/HLA 数据库 3.23 版本(2016 年 1 月 19 日发布),总共发现 14232 个 HLA 等位基因,其中 HLA-A 位点为 3356 个、HLA-B 位点为 4179 个、HLA-C 位点为 2902 个、HLA-DRB1 位点为 1860 个、HLA-DQB1 位点为 900 个。

      一一、、HLAHLA 常见及确认等位基因表的提出常见及确认等位基因表的提出 HLA 基因分型技术已得到广泛的应用,主要方法有 PCR-SSP、PCR-SSO、Luminex 技术、 PCR-SBT 等由于 HLA 基因高度多态性和检测技术的限制,在检测特定座位的分型中存在模 棱两可的等位基因分型结果模棱两可的基因型结果是指在 HLA 基因分型过程中,标本指 定结果中存在一种以上的 HLA 等位基因组合方式 1、HLA 分型检测存在模棱两可的等位基因分型结果 随着 HLA 等位基因数量的增加,等位基因间碱基序列高度同源性也越来越高,同一位 点不同等位基因之间碱基差异序列越来越少,造成检测区分难度相对增加;此外在测序过 程中存在多种等位基因组合在测序区域内具有相同的杂合序列,可导致 HLA 基因分型时出 现模棱两可的基因型结果 2、常见及确认等位基因表的提出 HLA 分型方法产生模棱两可结果后不能得到单一的 HLA 分型结果,为解决这些模棱两可 的结果,国际上提出了多种方法,其中之一为常见及确认等位基因表原则2007 年美国组 织相容和免疫遗传协会(ASHI)成立了一个特设委员会,提出常见及确认的等位基因表 (Common alleles and well documented alleles,CWD)。

      CWD 原则分型中将常见等位基 因和确认等位基因合并为 CWD,当模棱两可的等位基因组合中出现 CWD 等位基因需要进一步 区分,而出现罕见等位基因组合其临床分型中实际意义有限可予以排除,此表给临床 HLA 高分辨分型检测及实验室评估提供了参考依据 3、国际 CWD 表指导 HLA 高分辨分型和高分辨分型实验室的评估 3.1 美国 ASHI/NMDP 对 HLA 高分辨分型实验室的要求 ⑴如果实验室所报的结果以单一等位基因或者等位基因组(P 组和 G 组)的分辨率为主, 实验室将被授予 HLA 高分辨分型实验室资格⑵质控盲样分型结果必须至少有 80%为高分辨 率分型结果⑶为获得高分辨分型实验室的认证,高分辨分型实验室必须在前三个连续的 质控调查中高分辨分型结果至少要达到 80% 3.2 高分辨分型的定义和要求 ⑴高分辨分型必须是单一等位基因型的结果 ⑵除特定的不表达等位基因外,实验室并不需要区分如下不同等位基因之间的差异 ①在 HLA-Ⅰ类基因中,等位基因的第 2 和第 3 外显子编码的氨基酸序列相同,而它们 的差异仅在于第 2 和第 3 外显子之外的碱基序列; ②在 HLA-Ⅱ类基因中,等位基因的第 2 外显子编码的氨基酸序列相同,而它们的差异 仅在于第 2 外显子之外的碱基序列; ③这些信息应在目前的 IMGT/HLA 数据库和 CWD 表格中可查找到。

      ④HLA-Ⅰ类基因的第 2 和 3 外显子,HLA-Ⅱ类基因的第 2 外显子编码相应 HLA 分子的 抗原识别部位(ARS),所以在表述中也可以用 ARS 来替代 HLA-Ⅰ类基因的第 2 和 3 外显 子,HLA-Ⅱ类基因的第 2 外显子 ⑶高分辨分型实验室需要区分那些特定的或者“经常发现”的不表达等位基因 这些 不表达等位基因可在 CWD 表查找(见下表)它们的频率大于 0.001,并与某些等位基因或 某些单体型关联 ⑷在临床实践中实验室可以利用一种以上的方法作为补充方法,例如利用血清学分型 或序列分析等实验室的手段,来鉴定这些“经常发现”的不表达等位基因 表 1 需要鉴定和区分的不表达等位基因情况 不不表达等位基因表达等位基因 Null AlleleNull Allele 二选一的常见等位基因二选一的常见等位基因 Alternative Common Alternative Common AlleleAllele 单体单体型型中相关联的等位基因中相关联的等位基因 Associated Alleles Associated Alleles in Haplotypein Haplotype 多态性所处位置多态性所处位置 Location of Location of PolymorphismPolymorphism A*24:09N A*24:02:01:01 B*40 or B*27 Exon 4 B*51:11N B*51:01:01 A*02:01 and DRB1*04:02 and C*15:BJ Exon 4 C*04:09N C*04:01:01:01 B*44:03 Exon 7 ⑸一个基因位点的高分辨率分型结果只能包括一个单一的基因型,或者多个可能的基因型但其中只有 一个基因型包括两个 CWD (见下表所列的例子)。

      表 2 高分辨分型结果可能组合中可接受的情形 可能组合可能组合 Possible CombinationsPossible Combinations 例子例子 ExamplesExamples 结果结果 ResultsResults CWD1, CWD2; or rare 1, rare 2 B*35:01, B*46:01 or B*35:62, B*46:08 可接受 Acceptable CWD1, CWD2; or CWD3, CWD4 B*35:01, B*49:01 or B*50:01, B*53:01 不可接受 NOT Acceptable CWD1, CWD2g1; or CWD1, CWD3g1 B*35:01, B*07:05 or B*35:01, B*07:06** 可接受** Acceptable CWD1, CWD2; or CWD1,rare B*35:01, B*46:01 or B*35:01, B*46:08 不可接受*** NOT Acceptable CWD1, CWD1; or CWD1, rare B*35:01, B*35:01 or B*35:01, B*35:62 不可接受*** NOT Acceptable 注解:**,*** ①**B*07:05 和 B*07:06 的差异在第 2 和 3 外显子外,两者都可以在 CWD 表查到,虽然属于常见等位基 因,但它们的模棱两可不需要解决。

      B*07:05/07:06 在亚洲人中常见,在高加索人种和非洲人种也有记 录 ②***二选一的基因型中包括一对为 CWD,另一对由一个 CWD 和一个罕见的等位基因组成的基因型组合(见 上表中的例子),如果实验室有相关证据证明解决这种模棱两可组合为单一基因型是不必要的,则不需要 做进一步区分,实验室可以申请作为例外而报告所得结果为最终结果,但申请作为例外报告时应谨慎 (摘自 NMDP Policy for Confirmatory Typing Requirements Effective May 1, 2009). 二、中国二、中国常见及确认的常见及确认的 HLAHLA 等位基因表等位基因表制订制订 1、中国常见及确认的 HLA 等位基因表(CWD)1.0 版本 2010 年 8 月中华骨髓库成立了国内 CWD 表编撰小组开始此项工作,由张志欣教授担任 组长同年 11 月边收集资料边进行初步的数据分析,2011 年 2 月对新补充数据进行分析 后,于同月将第一稿中国 CWD 表发给各委员,并对每个委员承担的等位基因进行了分配和 提出要求2011 年 3 月 14 日召开 CWD 编撰小组全体会议,对每个等位基因逐个进行充分讨 论,并制定了中国 CWD 准入标准,该标准将逐渐过渡到采用国际标准,并于 2012 年进行了 完善和补充。

      中国常见及确认的 HLA 等位基因表(CWD)1.0 版本,根据国内具体情况和中国 人群 HLA 遗传数据,提出了适合国内 HLA 分型指导的 CWD 表,为中国造血干细胞捐献者资 料库高分辨分型检测入库和临床 HLA 分型提供了参考标准 2、中国常见及确认的 HLA 等位基因表(CWD)2.0 版本 随着中国常见及确认的 HLA 等位基因表(CWD)1.0 版本的广泛应用,积累了大量的应用 经验此外中国造血干细胞捐献者资料库中各家实验室提交的分型数据不断增加,而且新 的技术不断发展和应用在此基础和背景下,中华骨髓库提出组成专家对 1.0 版本进行修 订2014 年 8 月 19 日召开 CWD 协作组会议,讨论制定了相应的修订原则和时间,并拟定于 2014 年 9 月 17 日在中华骨髓库组织的会议上发布质量控制中心实验室周晓阳博士对中国 造血干细胞捐献者资料库最近几年的约 34 万份高分辨分型数据进行了分析,编撰组在 8 月 27 日将 CWD 2.0 版本的初审表发给各委员,并对每个委员承担的等位基因进行了分配和提 出要求在汇总各位委员的意见和建议后,遵循多数的原则,于 9 月 2 日将 CWD 2.0 版本 的复审表发给各委员。

      于 9 月 9 日形成进行了中国常见及确认的 HLA 等位基因表(CWD)2.0 版本(初稿),并交顾问、组长、副组长及其有关国内外专家审核形成最终版本 3、中国常见及确认的 HLA 等位基因表(CWD)2.1 版本 按照中国造血干细胞捐献者资料库管理中心的要求和 CWD 工作组制定的原则,根据 CWD 表应用情况和中国造血干细胞捐献者资料库新增标本分型结果,每年年初对上年度执行的 CWD 表进行适当完善浙江省血液中心实验室对中国造血干细胞捐献者资料库近 70 万份高 分辨分型数据进行分析,编撰组在 2015 年 2 月 2 日将 CWD 2.1 版本数据表发给各委员,并 对每个委员承担的等位基因初审和复审进行了分配在汇总各位委员的意见和建议后,遵 循多数的原则,于 2015 年 2 月 16 日形成进行中国常见及确认的 HLA 等位基因表(CWD)2.1 版本(初稿),并交顾问、组长、副组长及其有关国内外专家审核形成最终版本,于 2015 年 3 月 18 日在中国造血干细胞捐献者资料库管理中心组织的会议上进行发布 4、中国常见及确认的 HLA 等位基因表(CWD)2.2 版本 2.2 版本在 2.1 版本基础上,增加了中国造血干细胞捐献者资料库 2015 年入库数据, 总体分析高分辨分型数据达到 84 万余份。

      编撰组在 2016 年 1 月 7 日将 CWD 2.2 版本数据 表发给各委员,并按照既往分工指定每个委员承担的等位基因初审、复审任务在汇总各 位委员的意见和建议后,。

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