慢病毒颗粒RNA提取试剂盒.pdf
8页研究用 说明书 TaKaRa MiniBEST Viral RNA/DNA Extraction Kit Ver.5.0 Code No. 9766 v201401Da 目 录 内 容 页 码 ● 制品说明 1 ● 制品内容 1 ● 保存与运输 1 ● 实验前的准备 1 ● 操作方法 2 ● 实验例 3 ● 注意事项 4 ● 实验材料最大起始量 4 ● Q&A 4 ● 制品说明 本试剂盒是专门用于从血浆、 全血 、无细胞体液 、 病毒原液 和感染病毒的组织 中提取各种病毒( Virus)RNA/DNA 的小量纯化试剂盒试剂盒采用了独特的病毒裂解系统,由病毒裂解液裂解病毒释放 RNA 或DNA,再结合核酸制备膜 技术纯化 RNA 或 DNA,适用于各种 RNA 或 DNA 病毒的核酸提取本试剂盒具有高效、快速、方便之特点,病毒裂解后,提取操作仅需 20 分钟便可完成 本试剂盒 配有 Carrier RNA可提取样品中微量 的 RNA/DNA使用本试剂盒可 从低至 1.0E+04 copies 的甲肝病毒 或 1.6E+05 copies的 flury 株狂犬病毒 中提取得到 RNA,所得 RNA 可通过 RT-PCR 进行检测 。
提取得到的 RNA 可用于RT-PCR 反应、 Northern 杂交等多种分子生物学实验 ● 制品内容( 50 次量) 本试剂盒分 Part I 和 Part II 两部分 ■ Part I 部分 ( -20℃保存) Proteinase K( 20 mg/ml) 1 ml Carrier RNA 50 μl ■ Part II 部分(请于室温 15~25℃保存) Buffer VGB*1 12 ml Buffer RWA*1 28 ml Buffer RWB*2 24 ml RNase free dH2O 2 ml×2 Spin Columns 50 支 Collection tubes 50 支 RNase free collection tubes (1.5 ml) 50 支 *1 含有强变性剂,应避免与皮肤、衣物等接触。
若不小心接触到眼睛或皮肤时,请立即到医院进行处理 *2 在首次使用前 ,请添加 56 ml 的 100%乙醇,混合均匀 【试剂盒之外所需准备试剂】 ◆ 无水乙醇 ◆ PBS 溶液 ● 保存与运输 1. 本试剂盒分两部分保存, Part I 请保存在 -20℃; Part II 在室温下( 15-25℃)保存 2. 本试剂盒分两部分运输, Part I 请在 -20℃条件下运输; Part II 于室温下( 15-25℃)运输 ● 实验前的准备 1. 准备 56℃水浴 2. Buffer RWB 在首次使用前,请添加 56 ml 的 100%乙醇,混合均匀 3. 洗脱制备膜上的 RNA 时, 请使用 RNase free dH2O -1- ● 操作方法 操作流程见图 1, 分为病毒裂解、 RNA 或 DNA 与膜结合、 RNA或 DNA 纯化等步骤, 病毒 裂解后 的 操作约需 20 分钟(如果 起始材料为感染病毒的组织则需要经过液氮研磨 ),详细说明如下: 1. 病毒 的裂解: 使用不同的实验材料需采用不同的裂解步骤,具体说明如下: ◆ 血浆、血清、无细胞体液 、 病毒原液 中病毒 的裂解: ① 取 10~ 200 μl 的 血浆、血清、无细胞体液 、 病毒原液 ,10~100 μl 的全血, 如果起始量不足 200 μl,用 PBS 溶液或 RNase free dH2O 补足至 200 μl。
② 加入 200 μl 的 Buffer VGB、 20 μl 的 Proteinase K 和 1.0 μl的 Carrier RNA, 充分混匀 于 56℃水浴 温浴 10 分钟 ③ 向裂解液中加入 200 μl 无水 乙醇 ,充分 吸打 混匀 ◆ 感染病毒的组织的裂解 : ① 取 10 mg 感染病毒的组织 进行液氮研磨,研磨后的组织加入200 μl PBS 溶液或 RNase free dH2O ② 加入 200 μl 的 Buffer VGB、 20 μl 的 Proteinase K 和 1.0 μl的 Carrier RNA,充分混匀于 56℃水浴温浴 10 分钟 ③ 向裂解液中加入 200 μl 无水 乙醇,充分吸打混匀 2. 将 Spin Column 安置于 Collection Tube 上 , 溶液移至 Spin Column 中, 12,000 rpm 离心 2 分钟,弃滤液 3. 将 500 μl 的 Buffer RWA 加入至 Spin Column 中, 12,000 rpm 离心 1 分钟,弃滤液 4. 将 700 μl 的 Buffer RWB 加入至 Spin Column 中, 12,000 rpm 离心 1 分钟,弃滤液。
注)请确认 Buffer RWB 中已经加入了指定体积的 100%乙醇 请沿 Spin Column 管壁四周加入 Buffer RWB,这样有助于完全冲洗沾附于管壁上的盐份 5. 重复操作步骤 4 6. 将 Spin Column 安置于 Collection Tube 上, 12,000 rpm 离心 2 分钟 7. 将 Spin Column 安置于新的 1.5 ml RNase free collection tube 上,在 Spin Column 膜的中央处加入 30~ 50 μl 的RNase free dH2O,室温静置 5 分钟 注) 洗脱制备膜上的 RNA 时,请使用 RNase free dH2O 8. 12, 000 rpm 离心 2 分钟洗脱 DNA/RNA 如需获得更大收量,可将离下液重新加入到 Spin Column 膜的中央或再加入 30~ 50 μl 的 RNase free dH2O,室温静置 5 分钟后, 12, 000 rpm 离心 2 分钟洗脱 DNA/RNA 9. DNA/RNA 检测 由于提取时加入了 Carrier RNA,不能通过电泳或吸光度测定 定量。
可进行 PCR、 RT-PCR、 qPCR 检测 -2- 图 1. 操作流程简图 直接裂解或液氮研磨 加 Buffer VGB、 Proteinase K和 Carrier RNA 56℃温浴 裂解液 向裂解液中加无水乙醇 溶液移至 Spin Column 中 弃滤液 Buffer RWA Buffer RWB 弃滤液 Spin Column 移至 1.5 ml RNase free tube 上 RNase free dH2O RNA 或 DNA 溶液 实验材料 清洗 Spin Column ● 实验例 1. 从 甲肝疫苗原液中提取 HAV RNA 并进行 RT-PCR 检测 的实验例 使用本试剂盒从 1 μl、 0.1 μl、 0.01 μl 甲肝疫苗原液 (分别相当于 6.0E+06、 6.0E+05、 6.0E+04 copies的 HAV)中提取 其 RNA,并 使用 TaKaRa One Step RNA PCR Kit(AMV) (Code No. RR024)进行RT-PCR 检测, 扩增 289 bp 片段, 电泳结果见图 2 M 1 2 3 + - M 1% Agarose 凝胶电泳图 M : 100 bp DNA Ladder( Dye Plus) 1 : 6.0E+06 HAV 检测结果 2 : 6.0E+05 HAV 检测结果 3 : 6.0E+04 HAV 检测结果 +/- : 正负对照 (Code No. RR024) 图 2. 从甲肝疫苗原液中提取 HAV RNA 并进行 RT-PCR 检测 2. 从 HL60 细胞培养液、全血、唾液、尿液、小鼠肝脏中提取 HAV 病毒 RNA,并进行 RT-PCR 检测 的实验例 使用本试剂盒 从 200 μl 培养细胞( HL60)、 10 μl 全血、 200 μl 唾液、 200 μl 尿液、 10 mg 小鼠肝脏中提取 HAV RNA,并 使用 TaKaRa One Step RNA PCR Kit(AMV) (Code No. RR024)进行 RT-PCR 得到 289 bp 片段, 其电泳结果见图 3。
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 + - M 1% Agarose 凝胶电泳图 M: 100 bp DNA Ladder( Dye Plus) 1.2: HL60 细胞培养液中 HAV 检测结果 3.4:全血中 HAV 检测结果 5.6:唾液中 HAV 检测结果 7.8:尿液中 HAV 检测结果 9:小鼠肝脏中 HAV 检测结果 +/-:正负对照 (Code No. RR024) 图 3. 从 HL60 细胞培养液、全血、唾液、尿液、小鼠肝脏中提 取 HAV 病毒 RNA, 并进行 RT-PCR 检测的实验例 3. 从 狂犬疫苗 Flury 株中提取 RNA 并 进行 RT-PCR 检测 的实验例 使用本试剂盒从 10 μl 和 0.1 μl 狂犬疫苗 Flury 株原液中提取 RNA,并 使用 TaKaRa One Step RNA PCR Kit(AMV) (Code No. RR024)进行 RT-PCR 得到 500 bp 片段, 检出感度分别为 1.6E+07 copies和 1.6E+05 copies, 其电泳结果见图 4。
M 1 2 1% Agarose 凝胶电泳图 M: DL2,000 DNA Marker 1: 1.6E+07 copies 狂犬疫苗 Flury 株检测结果 2: 1.6E+05 copies 狂犬疫苗 Flury 株检测结果 图 4. 从狂犬疫苗 Flury 株中提取 RNA 并 进行 RT-PCR 检测的实验例 -3- ● 注意事项 1. 应尽量使用新鲜的实验材料,以确保 样品中的 RNA 不被降解 2. 使用液氮研磨组织材料时,应随时加入液氮,以确保提取的 RNA 不被降解 3. 部分试剂中含刺激性化合物,操作时请戴上乳胶手套和眼镜,避免沾 染皮肤和眼睛等,并应尽量在通风橱中进行操作若沾染皮肤、眼睛,要立即用大量清水冲洗,必要时应寻求医疗咨询 4. 建议用 RNase free dH2O 洗脱 5. 由于试剂盒使用的 Carrier RNA 是 大肠杆菌 来源的 RNA,其主要作用是提高微量 DNA/RNA 提取时的回收率,并保护提取得到的微量 RNA 不被降解但一旦待检样品引物与 Carrier RNA 同源性较高时,偶尔会产生假阳性检出(假阳性判断标准:不添加检测样品,使用 dH2O 替代样品提取核酸后,经过PCR 反应也得到明显扩增)。
如果产生假阳性检出时,可重新设计引物, 或选择不使用 Carrier RNA,不使用 Carrier RNA 时 , 微量 DNA/RNA 的收率会有所降低,导致病毒的检出感度会略有下降。





