常见猪病的检测引物汇总.docx

腹泻诊断：田小艳 猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus ,PEDV)、猪 传染性胃肠炎病毒(Porcine t rans2 missible gast roenteritis virus , TGEV) 和猪轮状病毒( Porcine rotavirus , PRV) 是3 种引起猪病毒性腹泻的重要病 原引物设计与合成根据GenBank中PRV、TGEV和PEDV核酸序列分别设计引物： 上游P1 : 5’ -AAAGATGCTAGGGACAAAATTG-3‘；下游P2 :5’ -TTCAGATTGTGGAGCTATTCCA -3‘P1/ P2为PRV检测引物，扩增VP6基因片段的309bp 上游P3 : 5’ -GATGGCGACCAGATAGAAGT -3’下游P4 : 5’ -GCAATAGGGTTGCTTGTACC -3’P3/P4 为TGEV 检测引物，扩增N 基 因保守片段的612bp上游P5:5’ -GAAA TAACCA GGGTCGTGGA-3’；下游P6 : 5’ - GCTCACGAACA GCCACA TTA -3’P5/ P6为PEDV检测引物，扩增N基因保守片段的492 bp。

张坤，本试验旨在建立能同时检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(T GEV)和猪A群轮状 病毒(GAR)的多重RT PCR检测方法PEDVP1 5-TTCGGTTCTATTCCCGTTGATG -3P2 5-CCCATGAAGCACTTTCTCACTATC -3 扩增长度663TGEVP3 5 TT ACAAACTCGCT AT CGCAT GG3P4 5 TCTT GTCACAT CACCTTT ACCTGC3 扩增长度528GARP5 5 CCCCGGT AT TGAATATACCACAGT3P6 5 TTT CTGT TGGCCACCCTT TAGT3扩增长度333李敬双 猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪流行性腹泻病毒(PEDV)基因序列及其相关 的RT-PCR检测方法TGEV P：5’1TGEV P：5’2PEDV P：5’1PEDV P：5’2-TTGTCAACACACAAGGGCAAGC-3’-CAAGTCCAAAAGTGCGATCA CC-3- TCGTTTTGGGTGGTTACCTAC-3’- AGTGGCAAATACATTGGCAGCG-3扩增片段长度TGEV为426 bp, PEDV为584 bp。

由大连宝生物公司合成蓝儿诊断:何玲，JXA1变异野毒与JXA1-R疫苗毒的快速鉴别体系，其目的片段大小分别为400、290 bp,根据PRRSV 经典毒株CH1a（ GenBank 登录号：AY032626）、VR2332 （ GenBank登录号：EF536003）与变异毒株GD （ GenBank 登录号：EU109503）、HuN4（ GenBank 登录： 号EF635006）、PJX143 （ GenBank 登录号：EF488048）、JXA1 （GenBank 登录号：EF112445） 的序列差异设计了针对变异毒株的特异性引物, BYFP ： 5-GTCCTAACGGTTCGGAAGAAAC-3; BYRP： 5-GAGCTGAGTATTTTGGGCGTGT-3根据疫苗毒JXA1 R （ GenBank 登录号：FJ548853）与野毒 株的序列差异设计了PRRSV疫苗毒的特异性引物，H MFP: 5-GAATGTTCGCACGGTCTC-3;HMRP：5-TCAAGGAAATGGCTGGT-3PRRSV JXA1与JXA1-R目的基因大小分别为400、290 bp,与预期大小相符。

疫苗毒JXA1-R 用BYFP/ BYRP也能扩增出大小为400 bp的目的条带，但是变异野毒JXA1不能扩增出引物对 HMFP/ HMRP 的目的片段（ 图1）王鑫,参考VR 2332 （ AY150564）、CH 1a （ AY032626）、JXA1 （ EF112445）及HUN4（ EF635006）等毒株的ORF5基因序列，设计1对引物P1: 5-TCTTTTTGGCATACTGTTGGCA,P2: 5-GCCGTGCTATCAAGACAGAAGT在美洲株VR2332 的位置分 别为13 750~ 13 772, 14 394~14 41跨越整个0RF5区域，扩增片段长666 bp引物送长春 联星生物制品公司合成猪瘟诊断：扩增CSFV NS5B区599 bp目的片段P1 TRACCAYGCAYATGWCAGAAGTACC 11053 － 11077。