种猪数据上传与应用.ppt

种猪数据上传与应用种猪性能测定员培训班种猪性能测定员培训班2011.03.21，武汉，武汉种猪数据种猪数据l性能测定性能测定l数据格式数据格式l2011数据上传情况数据上传情况l上传常见问题上传常见问题国家核心育种场数据流程国家核心育种场数据流程用户注册上传性能测定数据 登录平台猪只登记性能测定内容l种猪个体号的唯一性种猪个体号的唯一性l数据的完整性数据的完整性l数据的正确性数据的正确性l数据的准确性与精确性数据的准确性与精确性l系谱记录系谱记录种猪个体号DDBBSC199001001杜洛克杜洛克北京养猪中心北京养猪中心资源场资源场1999年出生年出生本年度出生的第本年度出生的第1窝窝中的第中的第1头猪头猪例例种猪个体号l采用全国统一的种猪编号系统，由采用全国统一的种猪编号系统，由15个字个字符组成符组成1～～2：：品种代码（字母），品种代码（字母），DD－杜洛克，－杜洛克，LL－－长白，长白，YY－大白，－大白，PP－皮特兰，－皮特兰，HH－汉普－汉普夏夏3～～6：：出生场代码（字母）出生场代码（字母）7：：场内分场序号（先用数字场内分场序号（先用数字1～～9，然后用大写，然后用大写字母字母A～～Z，无分场的种猪场用，无分场的种猪场用1））8～～9：：个体出生年度，取自然年度的后两位数个体出生年度，取自然年度的后两位数10～～13：：场内年度内窝顺序号（数字）场内年度内窝顺序号（数字）14～～15：：窝内个体顺序号（数字）窝内个体顺序号（数字）场内耳号场内耳号种猪个体号l几点说明几点说明–全国的种猪场必须要有统一的代码，由专家组全国的种猪场必须要有统一的代码，由专家组统一认定，每个场的代码具有唯一性。

统一认定，每个场的代码具有唯一性–每个个体的个体号一旦确定后，就不再变动，每个个体的个体号一旦确定后，就不再变动，该个体号将伴随其一生当该个体转入其他场该个体号将伴随其一生当该个体转入其他场时，仍沿用此个体号时，仍沿用此个体号–对于由国外引入的种猪（包括精液或胚胎），对于由国外引入的种猪（包括精液或胚胎），保留其原个体号保留其原个体号(注册号注册号)，并在该号前加国家，并在该号前加国家代码24家核心场猪场代码家核心场猪场代码 猪场名称 FXBF 阜新原种猪场 SHXX 上海祥欣畜禽有限公司 AHCF 安徽长风农牧科技有限公司 ZBBK 江西原种猪场有限公司吉安长白猪原种场 ZBBL 江西原种猪场有限公司安远大约克原种场 RZYZ 山东省日照原种猪场 HAQG 河南省诸美种猪育种集团有限公司 HAAB 河南省新大牧业有限公司 HNMY 牧原食品股份有限公司 HBTZ 湖北天种畜牧股份有限公司 HNWS 广东华农温氏畜牧股份有限公司 GDZC 广州广三保养猪有限公司 NMZC 深圳市农牧实业有限公司 GXRX 广西农垦永新畜牧集团有限公司良圻原种猪场 KXYZ 广西柯新源原种猪有限责任公司 TQLS 四川铁骑力士牧业科技有限公司 BJXD 北京顺鑫农业股份有限公司小店畜禽良种场 NHPF 天津市宁河原种猪场 YFJA 河北裕丰京安养殖有限公司 JPBF 浙江加华种猪有限公司 FQYC 福清市永诚畜牧有限公司 XWFX 湖南新五丰股份有限公司湘潭分公司 LNSN 海南罗牛山种猪育种有限公司 LESH 四川省乐山牧源种畜科技有限公司24家核心场猪场代码家核心场猪场代码国外种猪的国家代码国外种猪的国家代码United States （美国）USACanada（加拿大）CANDenmark（丹麦）DENFrance（法国）FRAGreat Britain（英国）ENGSweden（瑞典）SWEIreland（爱尔兰）IREBelgium（比利时）BELNorway（挪威）NORFinland（芬兰）FINNetherlands（荷兰）HOLAustralia（澳大利亚）AUSGenus-PICPICHypor(海波尔)HYPTopigs（托佩克）TOP数据格式数据格式--种猪个体信息种猪个体信息名称名称格式格式范围范围备注备注种猪种猪IDYYTEST104123456长度长度15位位必填必填性别性别公公公公/母母必填必填状态状态在群在群在群在群/离群离群必填必填父亲父亲ID同同 种猪种猪ID长度长度15位位必填必填母亲母亲ID同同 种猪种猪ID长度长度15位位必填必填出生日期出生日期年年—月月—日日小于当前日期小于当前日期必填必填入场日期入场日期年年—月月—日日本场出生：入场日期本场出生：入场日期与出生日期相同；与出生日期相同；外购：入场日期大于外购：入场日期大于出生日期；出生日期；必填必填数据格式数据格式--种猪个体信息种猪个体信息名称名称格式格式范围范围备注备注断奶日期断奶日期年年-月月-日日大于出生日期；大于出生日期；断奶日龄：断奶日龄：7～～40天；天；出生场编号出生场编号TEST1长度长度5位；位；前四位总场编号，前四位总场编号，4位字符；位字符；后一位分场编号，后一位分场编号，1位字符或数字；位字符或数字；必填必填现在场编号现在场编号TEST1长度长度5位；位；前四位总场编号，前四位总场编号，4位字符；位字符；后一位分场编号，后一位分场编号，1位字符或数字；位字符或数字；来源本场出生：现在场编号应与出生场编号来源本场出生：现在场编号应与出生场编号相同；相同；来源购入：现在场编号不应与出生场编号相来源购入：现在场编号不应与出生场编号相同；同；必填必填数据格式数据格式--种猪个体信息种猪个体信息名称名称格式格式范围范围备注备注来源来源本场出生本场出生本场出生；国外引种；本场出生；国外引种；国内购入；国内购入；必填必填品种品种大白大白参考参考必填必填品系品系英系大白英系大白参考参考必填必填出生胎次出生胎次11～～10胎胎出生场耳缺号出生场耳缺号123456必填必填出生重出生重(kg)1.50.5~3kg同窝仔猪数同窝仔猪数111~30个个断奶体重断奶体重(kg)8.73~15kg左乳头左乳头71～～10个个右乳头右乳头71～～10个个应激基因型应激基因型NNNN,Nn，，nn数据格式数据格式--生长测定信息生长测定信息名称名称格式格式范围范围备注备注种猪种猪ID同个体信息种猪同个体信息种猪ID长度长度15位；位；必填必填始测日期始测日期年年—月月—日日日龄：日龄：60～～100天；天；始测体重始测体重35.2720～～50Kg结测日期结测日期年年—月月—日日日龄：日龄：100～～250天天必填必填结测体重结测体重85.4665～～150Kg必填必填结测耗料结测耗料320.4597.597.5～～420Kg420Kg；；平均背膘厚平均背膘厚12mm5~40mm必填必填平均眼肌厚平均眼肌厚30.8720～～100mm平均眼肌面积平均眼肌面积44.4420~100平方厘米平方厘米测定场编号测定场编号TEST15位完整编号位完整编号必填必填数据格式数据格式--繁殖信息记录繁殖信息记录名称名称格式格式范围范围备注备注种猪种猪ID同个体信息种猪同个体信息种猪ID长度长度15位；位；必填必填胎次胎次11～～10胎胎必填必填产仔日期产仔日期年年-月月-日日妊娠天数：妊娠天数：100～～130必填必填总仔数总仔数121～～30个个必填必填活仔数活仔数120～～30个个必填必填公仔数公仔数61 1～～3030个个母仔数母仔数61～～30个个畸形数畸形数00～～30个个木乃伊木乃伊00～～30个个死胎死胎00～～30个个数据格式数据格式--繁殖信息记录繁殖信息记录名称名称格式格式范围范围备注备注弱仔数弱仔数00~30个个健仔数健仔数00～～30个个死仔数死仔数00~30个个出生窝重出生窝重50.551～～75kg必填必填本胎次首次配种日期本胎次首次配种日期年年-月月-日日返情次数返情次数01 1～～1010次次配妊日期配妊日期年年-月月-日日必填必填公猪公猪ID同种猪同种猪ID长度长度15位位必填必填断奶日期断奶日期年年-月月-日日大于产仔日期，大于产仔日期，小于当前日期；小于当前日期；必填必填断奶窝仔数断奶窝仔数110～～30个个必填必填断奶窝重断奶窝重90.673~375kg必填必填2011年数据上传情况年数据上传情况l22家核心场上传数据家核心场上传数据l数据记录数据记录–猪只登记猪只登记 288507–生长记录生长记录 76882–繁殖记录繁殖记录 47663l问题：重复上传，增大文件，降低上传速度，问题：重复上传，增大文件，降低上传速度，甚至上传失败甚至上传失败l要求：仅上传新增数据要求：仅上传新增数据2011年数据上传情况年数据上传情况猪只登记猪只登记生长生长繁殖繁殖长白长白总记录总记录平均记录数平均记录数78861788613429342922648226489449441492814928622622大白大白总记录总记录平均记录数平均记录数16336416336468076807408034080317001700270032700311251125杜洛克杜洛克总记录总记录平均记录数平均记录数385873858718371837126781267855155155575557242242数据上传中的常见问题l用户注册的猪场代码与该用户上传数据中的用户注册的猪场代码与该用户上传数据中的猪场代码不同，导致数据上传失败猪场代码不同，导致数据上传失败数据上传中的常见问题l用户注册时，其下属分场没有定义，那么该用户注册时，其下属分场没有定义，那么该分场数据上传失败分场数据上传失败l上传性能测定数据前没有先上传种猪登记数上传性能测定数据前没有先上传种猪登记数据，导致性能测定数据无效据，导致性能测定数据无效–每个有测定记录的个体都必须先做种猪登记每个有测定记录的个体都必须先做种猪登记数据上传数据上传l登记（全国种猪遗传评估信息网登记（全国种猪遗传评估信息网））lEXCEL模板进行登记后上传模板进行登记后上传lGBS用户可从用户可从GBS中导出数据，然后上传中导出数据，然后上传lGPS用户及其他软件用户已提供用户及其他软件用户已提供XML数据数据格式，将本场数据导出，然后上传格式，将本场数据导出，然后上传l增加了更加详细的数据校验功能增加了更加详细的数据校验功能数据应用数据应用数据应用数据应用l信息统计信息统计l数据变更、修改数据变更、修改l遗传评估遗传评估l配种计划配种计划l群体近交系数群体近交系数信息统计信息统计信息统计信息统计信息统计信息统计数据变更数据变更数据变更数据变更遗传评估遗传评估l为种猪选择提供科学依据为种猪选择提供科学依据l为评价育种效果提供科学依据为评价育种效果提供科学依据l育种工作的中心任务育种工作的中心任务遗传评估遗传评估l遗传评估中心利用各种猪场上报的性能测定遗传评估中心利用各种猪场上报的性能测定数据进行遗传评估数据进行遗传评估l采用动物模型采用动物模型BLUP方法估计各个性状的育方法估计各个性状的育种值种值l用各性状的估计育种值计算选择指数用各性状的估计育种值计算选择指数l全国遗传评估中心每季度公布一次全国遗传全国遗传评估中心每季度公布一次全国遗传评估结果评估结果l可根据各场需要进行适时遗传评估，并将结可根据各场需要进行适时遗传评估，并将结果返回给各场果返回给各场遗传评估遗传评估-评估方法评估方法l育种值估计模型育种值估计模型日龄日龄(背膘厚背膘厚) = 场场-年年-季季-性别性别 + 窝窝 + 个体育种值个体育种值日龄、背膘厚（两性状模型）：日龄、背膘厚（两性状模型）：产仔数（单性状模型）：产仔数（单性状模型）：产仔数产仔数 = 场场-年年-季季 + 窝窝 + 永久环境永久环境 + 个体育种值个体育种值遗传评估遗传评估-评估方法评估方法l选择指数选择指数–父系指数（父系指数（SLI））•用于父系品种的种猪选择用于父系品种的种猪选择•强调强调生长速度生长速度和和瘦肉率瘦肉率FAT：背膘厚：背膘厚EBV，，AGE：日龄：日龄EBV遗传评估遗传评估-评估方法评估方法l选择指数（续）选择指数（续）–母系指数母系指数（（DLI））•用于母系品种的种猪选择用于母系品种的种猪选择•强调强调生长速度生长速度、、瘦肉率瘦肉率和和繁殖性能繁殖性能NB：产活仔数：产活仔数EBV遗传评估遗传评估-评估方法评估方法l场内遗传评估场内遗传评估–各场利用本场测定数据独立进行评估各场利用本场测定数据独立进行评估–自行评估（需有遗传评估软件）自行评估（需有遗传评估软件）–可提请全国遗传评估中心协助评估可提请全国遗传评估中心协助评估–不同场的遗传评估结果没有可比性不同场的遗传评估结果没有可比性遗传评估遗传评估-评估方法评估方法l跨场联合遗传评估跨场联合遗传评估–联合育种的核心联合育种的核心–将各场的数据集中同时进行评估将各场的数据集中同时进行评估–由遗传评估中心进行评估由遗传评估中心进行评估–不同场的遗传评估结果具有可比性不同场的遗传评估结果具有可比性–前提：一定程度的场间关联性前提：一定程度的场间关联性遗传评估遗传评估-申请申请遗传评估遗传评估-申请申请遗传评估遗传评估l本场评估结果查询本场评估结果查询遗传评估遗传评估l本场评估结果查询本场评估结果查询遗传评估遗传评估-结果下载结果下载遗传进展分析遗传进展分析选种选种l根据指数选择根据指数选择–父系指数还是母系指数？父系指数还是母系指数？–可以自定义指数可以自定义指数l根据根据EBV选择选择–根据实际需要选择在某个性状上表现突出根据实际需要选择在某个性状上表现突出的个体的个体l场间种猪比较场间种猪比较–场间是否有足够的关联性？场间是否有足够的关联性？配种计划（配种计划（1））配种计划（配种计划（2））配种计划（配种计划（3））配种计划（配种计划（4））群体近交分析群体近交分析谢谢 谢！谢！。