snomedct及其在电子病历标准化中应用(刘丹红).pdf

SNOMED CT及其在电子病历及其在电子病历 标准化中的应用标准化中的应用 刘丹红 第四军医大学卫生信息研究所 刘丹红 第四军医大学卫生信息研究所 郑州郑州• 2013-6-8 2013中华医院信息网络大会中华医院信息网络大会 C H I S C . N E T - 国内第一医疗信息化网站 , 业内最强大和中立的互联网共享交流平台 利用信息技术提高卫生服务的质量和效率利用信息技术提高卫生服务的质量和效率 计算机及时获取、准确识别和处理医学信息计算机及时获取、准确识别和处理医学信息 信息以适宜的形式表达，传达明确、完整的语 义，且在信息共享的范围内达到协调统一 信息以适宜的形式表达，传达明确、完整的语 义，且在信息共享的范围内达到协调统一 医学术语系统：医学概念的结构化、形式化表 示，方便计算机一致性地阅读和处理 医学术语系统：医学概念的结构化、形式化表 示，方便计算机一致性地阅读和处理 2 2013中华医院信息网络大会 一、一、SNOMED CT概述概述 二、二、SNOMED CT的主要内容的主要内容 三、三、SNOMED CT与临床信息模型与临床信息模型 四、四、SNOMED CT与电子病历信息标准化与电子病历信息标准化 内 容 3 2013中华医院信息网络大会 一、一、SNOMED CT概述概述  系 统 医 学 命 名 法系 统 医 学 命 名 法 Systematized Nomenclature of Medicine (SNOMED)，，1978年由美国病理学家学会年由美国病理学家学会 College of American Pathologists (CAP) 提出提出  1999年，年，CAP和英国和英国NHS联合将联合将SNOMED Reference Terms和和Clinical Terms Version 3 结合，更名为系统 医学命名法 结合，更名为系统 医学命名法---临床术语临床术语Systematized Nomenclature of Medicine - Clinical Terms, SNOMED CT 4 2013中华医院信息网络大会  2007 年 ， 国 际 卫 生 术 语 标 准 研 发 组 织年 ， 国 际 卫 生 术 语 标 准 研 发 组 织 International Health Terminology Standards Development Organization (IHTSDO)成立并收 购了 成立并收 购了SNOMED CT及相关产品，包括及相关产品，包括SNOMED CT的技术设计、核心内容及相关技术文档的技术设计、核心内容及相关技术文档  此 后 由此 后 由 IHTSDO拥 有 并 发 布 、 维 护 和管 理拥 有 并 发 布 、 维 护 和管 理 SNOMED CT，英文版在每年，英文版在每年1月和月和7月发布月发布 5 2013中华医院信息网络大会  随着版本的变化，随着版本的变化，SNOMED CT内容不断更内容不断更 新，目前最新的版本为新，目前最新的版本为January , 2013  IHTSDO成员国主要有美国，英国，加拿大，成员国主要有美国，英国，加拿大， 澳大利亚，丹麦，爱沙尼亚，中国香港，西 班牙等 澳大利亚，丹麦，爱沙尼亚，中国香港，西 班牙等22个国家，中国不属于成员国，目前 国内没有使用权 个国家，中国不属于成员国，目前 国内没有使用权 6 2013中华医院信息网络大会  SNOMED CT是一个综合性医学术语集，包含 了健康和卫生保健领域中大量的专业术语 是一个综合性医学术语集，包含 了健康和卫生保健领域中大量的专业术语  精确表达医学概念，可用来编码、提取和分析精确表达医学概念，可用来编码、提取和分析 临床数据，支持医学数据的一致性索引、存储、 调用和跨专业、跨机构集成，促进 临床数据，支持医学数据的一致性索引、存储、 调用和跨专业、跨机构集成，促进EHR系统的 语义互操作 系统的 语义互操作  SNOMED CT是统一医学语言系统是统一医学语言系统UMLS的主的主 要来源之一要来源之一 7 2013中华医院信息网络大会 二、二、SNOMED CT的主要内容的主要内容 1. 概念概念Concepts ：表达临床概念，大约：表达临床概念，大约311,000个个 2. 描述描述Descriptions ：赋予：赋予SNOMED CT概念的名称概念的名称 或术语，接近百万个描述或术语，接近百万个描述 3. 关系关系 Relationships ：用来说明两个临床概念之间的 关系，超过百万种关系 ：用来说明两个临床概念之间的 关系，超过百万种关系 8 2013中华医院信息网络大会 SNOMED CT中的每个概念都有一个完整、清晰的描述中的每个概念都有一个完整、清晰的描述 （人读）和唯一的标识符（机读）（人读）和唯一的标识符（机读）——概念标识符概念标识符 校验数字校验数字 SCT标识符标识符 分割分割 标识符标识符 条目条目 标识符标识符 SCTID 101291009 00 = 核心命名空间，概念核心命名空间，概念 01 = 核心命名空间，描述核心命名空间，描述 02 = 核心命名空间，关系核心命名空间，关系 例如：概念例如：概念 Myocardial infarction 22298006 9 1. 概念表概念表 2013中华医院信息网络大会 SNOMED CT的层级结构示意图的层级结构示意图 分分 解解 (more clinical detail) 操操 作作 淋巴结检查淋巴结检查 淋巴结淋巴结 切除活检切除活检 淋巴结淋巴结 手术活检手术活检 淋巴结活检淋巴结活检 聚聚 合合 (more aggregation) 所有概念按照颗粒度形成层级结构所有概念按照颗粒度形成层级结构 10 2013中华医院信息网络大会 SNOMED CT 的19类顶层概念 的19类顶层概念 临床临床发现发现 Clinical finding 外力外力 Physical force 操作操作 Procedure 事件事件 Event 观察观察实体实体 Observable entity 环境或环境或地理位置地理位置 Environment or geographical location 身体身体结构结构 Body structure 社会社会背景背景 Social context 生物体生物体 Organism 临床临床语境语境 Situation with explicit context 物质物质 Substance 分期和分期和等级等级 Staging and scales 药物药物/生物制品生物制品 Pharmaceutical/biologic product 物体物体（（设备设备）） Physical object 标本标本 Specimen 限定限定值值 Qualifier value 特殊特殊概念概念 Special concept 记录记录 Record artifact 关联关联概念概念 Linkage concept 11 2013中华医院信息网络大会 用用term（术语）或（术语）或name（名称）说明概念（名称）说明概念 一个概念可对应多个描述一个概念可对应多个描述 每个描述都有自己的每个描述都有自己的DescriptionID（描述代码）（描述代码） 描述的类型：描述的类型： 规范化全称规范化全称(Fully Specified Name)：必须：必须 的，没有歧义的，没有歧义 首选术语首选术语(Preferred term)：临床常用的词或词组：临床常用的词或词组 同义词同义词 2. 描述描述 12 2013中华医院信息网络大会 概念描述实例概念描述实例：： 规范化全称：规范化全称：Myocardial infarction (disorder) DescriptionID 751689013 首选术语：首选术语：Myocardial infarction DescriptionID 37436014 同义词：同义词：Cardiac infarction DescriptionID 37442013 同义词：同义词：Heart attack DescriptionID 37443015 同义词：同义词：Infarction of heart DescriptionID 374410 以上所有描述都有唯一标识符，与概念22298006相关联 概念概念 Myocardial infarction 22298006 13 2013中华医院信息网络大会 3. 关系关系 定义（定义（Defining）） IS A 关系：关系：Supertype – Subtype relationships，，Parent – Child relationships Attribute 关系：用关系：用50多个属性描述概念多个属性描述概念 限定（限定（Qualifying）） 历史（历史（Historical）） 附加（附加（Additional）） 14 2013中华医院信息网络大会 IS A （隶属）关系实例（隶属）关系实例 15 脚部开放性脚部开放性 骨折骨折 脚部疾病脚部疾病 脚部损伤脚部损伤 脚部骨折脚部骨折 蜂窝组织炎蜂窝组织炎 脚部疾病脚部疾病 脚部蜂窝织炎脚部蜂窝织炎 2013中华医院信息网络大会 ATTRIBUTE（属性）（属性） 关系关系 临床发现、手术临床发现、手术/操作、事件、身体结构、药物操作、事件、身体结构、药物/生物生物 制品、设备、标本等各类概念均有其特有的制品、设备、标本等各类概念均有其特有的属性 属性 临床发现：发现的部位、形态学表现、与其他（如 原因）的关系、严重度、临床进程等 临床发现：发现的部位、形态学表现、与其他（如 原因）的关系、严重度、临床进程等 手术手术/操作：手术部位、手术目标部位、手术方法、操作：手术部位、手术目标部位、手术方法、 手术路径、手术用药、优先度等手术路径、手术用药、优先度等 16 2013中华医院信息网络大会 临床发现实例临床发现实例 53057004:363698007=(76505004:272741003=7771000),272141005=24484000 手疼痛 发现部位 拇指结构 严重性 剧烈的 左侧 偏侧性 左手拇指的严重疼痛左手拇指的严重疼痛 17 2013中华医院信息网络大会 感染性肺炎感染性肺炎 312342009 病因病因 病理过程病理过程 部位部位 形态学表现形态学表现 细菌细菌 41146007 感染感染 441862004 肺部肺部 39607008 炎症炎症 257552002 18 临床发现实例临床发现实例 2013中华医院信息网络大会 19 细菌性肺炎 细菌 SNOMED CT 概念概念 临床发现 微生物 躯体结构 肺部结构 肺炎 感染性肺炎 is a is a is a is a is a is a is a 部位 病因 is a 2013中华医院信息网络大会 20 定义型定义型 定义型关系是源概念逻辑定义的一部分定义型关系是源概念逻辑定义的一部分 • appendicectomy: procedure site = appendix • 阑尾切除术阑尾切除术: 手术部位手术部位 =阑尾阑尾 限定型限定型 限定型关系提供了一个可选择限定词限定型关系提供了一个可选择限定词, 可以应用于 源概念 可以应用于 源概念 • appendicectomy: approach = laparascopic • 阑尾切除术阑尾切除术: 方法方法 = 腹腔镜腹腔镜 2013中华医院信息网络大会 每个概念都有唯一的标识，可有多种描述 每个概念都有唯一的标识，可有多种描述 同一概念的所。