在GaussView中利用对称性画分子结构图.doc

PointGroupSyuetry在GaussView5.0中利用对称性画二茂铁的分子结构图Example:二茂铁分子Software:Gaussview5.01.在GaussView的视窗中按五边形大致画出五个C原子2. 点击Edit/Pointgroup.…,EnablePointgroupsymmetryEESEnableFnintGroupSj-TTimetiryCurretlIlpui肮七gi_oup:C1Allch：±TLgeEvD5hToler：=LTLce:AwfullyIoaee(0.5)|Sj-TTirTietrizeConsaintosubgroup:Approximatehigher-orderpointgroupe:ReborLilelSjTTimmtrizingAlwaystrackpointgi_oupEj-TTimettyIgrLureIhjjTimyAtomifTl3. SymmetrizeD5h或者较低的对称性,然后constraintosubgroupto最高对称性D5h4. 调整(ModifyBond)C-C键为1.44angstrom5. 添加H原子：点击BuildFragment的下三角，点选CustomMode下的"BondtoTargetAtomInsteadofDeletingIt”,这样才能顺利添加C-H键;设置C-H键为1.07angstrom6.将画好的环戊烷分子复制粘贴一个,大致调整两个分子的间距（Alt+鼠标左键点在单个分子上，只转动这个分子；Alt+鼠标中键点在单个分子上，只平动这个分子;Alt+Ctrl+鼠标左键点在单个分子上，绕垂直于屏幕的方向转动这个分子）7.（把这两个分子constrainpointgrouptoD5h，）调整分子使两个分子交叉重叠，然后constrainpointgrouptoD5d;8.选定所有原子，再选定要添加的Fe原子，右键中选Build,PlaceFragmentatcentroidofselectedatoms;（GaussView5.0新增加功能）V玄jBuilderFile►Edit►View►C：ilculatE►RseijIIe卜Windowe►Help►10.Done!。