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osmpk3即tey型水稻c组mapk、磷酸化与e-box元素结合的转录因子水稻osbhlh65..doc

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  • 卖家[上传人]:今***
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    • OsMPK3即TEY型水稻C组MAPK、磷酸化与E-box元素结合的转录因子水稻OsbHLH65摘要主要信息 OsMPK3是一种TEY型水稻C组MAPK,它直接在细胞核内磷酸化OsbHLH65OsMPK3和OsbHLH65在生物胁迫下被诱导表达,同时还可以抵抗相关激素摘要 MAPKs参与大部分的信号通路,如通过目标分子的磷酸化调节植物生长和抗逆性根据活性环中的TXY(X=E或D)模体,植物MAPKs被分为两个亚型,即TEY和TDY;TDY结构域是植物MAPKs所独有的在水稻中,17个MAPKs被分为6组到目前为止,TDY型的水稻MAPKs的功能已经清楚,但是,TEY型水稻C组MAPKs和它们可能的目标底物所知甚少在本研究中,我们认为TEY型水稻MAPK属于C小群,命名为OsMAPK3,它在细胞核中磷酸化其底物OsbHLH5我们的电泳迁移率改变分析结果表明:OsbHLH65特异结合E-box的顺式元件而不是G-boxOsMPK3和OsbHLH65都是被诱导治疗稻瘟病、稻褐飞虱和防御相关激素,如茉莉酸甲酯和水杨酸我们的研究结果表明:OsMPK3通过磷酸化bHLH转录因子促进防御信号转导。

      关键词 水稻 稻瘟病菌 MAPK bHLH 生物胁迫 E-box顺式元件缩略词MAPK(MPK) 促丝裂原活化蛋白激酶BPH 稻褐飞虱ERK 胞外信号调节激酶CD 常见停靠位点TF 转录因子MAPKsbHLH 基本螺旋-环-螺旋前言MAPKs在胞内信号转导中扮演关键角色MAPK级联顺序包括3个蛋白激酶,即MAPKKK、MAPKK和MAPK(Ichimura et al.2002)根据活性环中TXT(X=E或D)模体类型,植物MAPKs分为两个亚型,而且它们都可以被MAPKK磷酸化TEY模体类似于动物ERK型MAPKs,但是TDY是植物特有的(Cristina et al.2010;Do’czi et al.2012;Hamel et al.2006)从藻类到高等植物,这两个模体都是高度保守的根据序列的相似性和蛋白质结构,拟南芥MAPKs被分为4组,A-D(Ichimura et al.2002),然而在水稻中已经确定有17个基因编码MAPKs被分为6组,A-F(Reyna and Yang 2006;Rohila and Yang 2007)在水稻中,A、B、C组MAPK有一个TEY模体和一个MAPKK的CD。

      相比之下,D、E、F组MAPKs缺少CD,其活性环有一个TDY模体(Reyna and Yang 2006)TDY型MAPKs在活性环附近有3-4个氨基酸插入很多TDY型水稻MAPKs的功能已经清楚,但是对C组MAPK知之甚少(Liu and Xue 2007;Pires and Dolan 2010;Rohila and Yang 2007)无论在动物还是植物基因组中,TFs中的bHLH结构域都是高度保守的bHLH结构域是由50-60个氨基酸组成,形成两个不同的片段,一个基本片段是由10-15个氨基酸组成,一个HLH通过一个可变环将两个两亲螺旋分开(Carretero-Paulet et al.2010)DNA结合域位于bHLH的N-端两个bHLH蛋白的两亲螺旋可以相互绑定形成同源或异源二聚体总共167个和162个bHLH编码基因分别在水稻和拟南芥中被确定(Carretero-Paulet et al.2010),曾有报道bHLHs参与植物防御反应两个拟南芥bHLH TFs MYC3和MYC4需要JA调控生理过程,包括根系生长、抑制和抵抗病原体和昆虫(Ferna’ndez-Calvo et al.2011)。

      在水稻中,WRKY和基本亮氨酸拉链(bZIP)TFs已确定作为MAPKs的目标分子,但是bHLH的类似信息仍然缺乏(Singh et al.2012)最近,据报道:水稻bHLH TF、RAI1被A组MAPKs磷酸化,如OsMAPK5和OsMAPK6(Reyna and Yang 2006),同时可以调节诱导子应答基因PAL1和WRKY19对抗稻瘟病(Kim et al.2012)然而,bHLH TFs家族相对较大,多个目标底物被水稻MAPKs磷酸化,在防御反应中这些目标底物被活化小粒野生稻很早就有研究(Cho et al. 2005;Shim et al. 2004),它抗褐飞虱和稻瘟病我们一个水稻MAPK,命名为OsMAPK3,与OmMPK同族在本研究中,我们筛选它可能的底物OsbHLH65,使用酵母双杂筛选系统鉴定该转录因子是否被OsMPK3磷酸化,我们也研究与OsbHLH65作用的顺式作用元件,用以分析在响应稻瘟病及褐飞虱和防御相关激素(如MeJA和SA)时OsMAPK3和OsbHLH65基因的表达材料与方法植物材料和病原菌处理水稻变种:华城幼苗25℃生长,光周期:16 h光照培养、8 h黑暗培养。

      致病的KJ101和不致病的KJ301用于水稻稻瘟病接种我们大量喷射分生孢子悬浮液于生长4周的幼苗水稻褐飞虱侵染参考Shim et al(2004)我们将褐飞虱幼虫放置于生长4周的幼苗上,每次10 s激素处理水稻变种的无菌种子:韩国华城种子在湿滤纸的培养皿25°C 1周在黑暗条件下发芽之后,转移到组织细胞培养基上,其中有四层纱布(5×5厘米)和45mLMS培养基,25°C条件下,以光照培养16h黑暗培养8h为光周期培养2周幼苗根系三个不同的植物激素分别处理,即:茉莉酸甲酯、乙烯利、水杨酸,其使用浓度分别是100、500、200µMOsMAPK3和OsbHLH65的克隆以分别被稻褐飞虱和稻瘟病处理的水稻叶片为材料提取总RNA,混合后反转录成cDNA,以cDNA为模板PCR扩增得到全长OsMPK3和OsbHLH65.PCR产物克隆到pGEM-T简单载体(Promega)构建克隆表达重组蛋白,用SmaI酶切OsMPK3、EcoRI和XbaI 双酶切OsbHLH65分别多克隆到pGEX4T-3和pMAL-c2X然后转化到大肠杆菌BL21菌株内根据说明书分别用谷胱甘肽琼脂糖和直链淀粉树脂制备OsMPK3-GST和Osb HLH65-MBP融合蛋白。

      体外活性测定用4个反应缓冲液进行活性测定(20 mM HEPES, 10 mM MnCl2or MgCl2, 1 mM Na2-VO4, 0.5 mM PMSF, 2 mM EDTA, 2 mM DTT, 200 nMATP, 1µCi [ɣ32]-P-ATP) ,将缓冲液和纯化的OsMPK3-GST和Osb HLH65-MBP融合蛋白各1ug用15uL反应体系反应髓磷脂碱性蛋白作为阳性对照使用10mMMn2+ 或者Mg2+测试金属离子辅助因子偏好性反应混合物30°C孵育30分钟,通过添加十二烷基硫酸钠(SDS)样品缓冲(250 mM Tris-Cl pH 6.8,10% SDS、30%甘油、0.02% 间溴苯芬蓝色)终止反应立即95°C煮沸5分钟然后10% SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳凝胶用考马斯亮蓝R - 250染色、晒干然后使用富士胶片bas - 2500图像分析系统进行放射自显影双分子荧光互补分析为构建BiFC分析克隆载体、OsMPK3和OsbHLH cDNA分别被克隆在pUC-SPYNE载体的Spe I/ XhoI位点和pUC-SPYCE载体的Spe I/ SmaI位点(Walter et al . 2004年)。

      每1ug载体样品混合成同等体积氦启动粒子输送系统(pds - 1000 / HeTM;Bio-Rad)使用1100 psi的防爆膜和1.0 um黄金微载体导入洋葱表皮细胞然后样本MS固体培养基上25°C在黑暗培养12 h用DAPI(4 6-diamino-2-phenylindole)孵育洋葱表皮细胞5分钟给细胞核染色(1ug mL-1 DAPI的磷酸缓冲盐)BX51荧光显微镜下观察荧光反转录聚合酶链式反应和q RT - PCR分析使用TRI试剂提取总RNA,根据说明书以用低聚糖(dT)为引物用Super Script III反转录酶将5ug总RNA反转录成cDNA,RT- PCR分析,OsMPK3和OsbHLH65使用24个周期 EF1a作为内参基因使用22个周期RT- PCR条件是95°C 3min、22 - 24 个循环、95°C30s、57°C20s、72°C30s实时PCR,根据说明书以Light Cycler 480 SYBR Green I控制系统实时定量PCR循环程序包括95°C 10分钟激活初始聚合酶,其次95°C10s、58 °C10s、72°C20s、40个循环每个循环的72°C延伸后用Mono Hydrolysis Probe setting (483–533 nm)检测荧光。

      用Light Cycler480 定量软件中的倒数最大法分析数据每个cDNA样品扩增的时候做3个重复,为使其标准化用水稻EF1α作为内参基因反转录PCR和实时定量PCR所用引物见附录表S1电泳迁移率分析(EMSA)根据说明书用一个非同位素方法轻移发光EMSA试剂盒(Thermo Scientific),检测DNA–蛋白复合物用四种生物素标记的寡核苷酸(G-box,GCC盒,W-box,E-box)作为探针(20 nm;补充表S1)一个2ug OsbHLH65-MBP融合蛋白的样品在20 uL反应混合物中室温下搅拌20分钟用结束标记DNA中孵育蛋白酶因子Xa(0.2 LG;NEB)被添加到反应混合物中除去麦芽糖结合蛋白(MBP)然后,反应样品(20ul)用6.5%天然聚丙烯酰胺凝胶电泳然后转尼龙膜通过davinch-Chemi TM cas-400sm检测DNA–蛋白质复杂的图像(davinch-Chemi)用于EMSA检测所有探针都在补充表S1列出酵母菌双杂系统筛选媒人TM图书馆建设和筛选工具(Clontech)是用于分析蛋白质相互作用根据制造商的协议构建一个GAL4广告融合图书馆,我们使用池rna提取o .漂白亚麻纤维卷叶处理稻瘟病,前列腺肥大,乙烯利,我是的,或SA。

      开放阅读框(ORF)Os MPK3 c DNA克隆在坐标系到pGBKT7向量被用作诱饵屏幕cDNA表达文库酵母b-galactosidase化验,Os MPK3-p GBKT7和Osb HLH65-p GADT7 constructswere co-transformed酵母AH109应变转换后的酵母细胞培养在合成辍学介质(缺乏低浓缩铀,Trp,他和正面)根据说明书Matchmaker文库的构建和筛选试剂盒(Clontech)用于分析–蛋白相互作用我们混合稻瘟病,BPH,乙烯利,MeJA和SA处理下的水稻叶片提取的RNA以构建一个GAL4 AD文库以OsMPK3的 cDNA的开放阅读框(ORF)克隆到质粒载体上以筛选cDNA表达文库构建的osmpk3-pgbkt7和osbhlh65-pgadt7共转化酵母菌AH109菌株,以测定酵母β-半乳糖苷酶转化的酵母细胞在缺失培养基上培养(缺乏亮氨酸、色氨酸、组氨酸和腺嘌呤)结果和讨论序列比较和系统发育分析OsMPK3OsMPK3,与OmMPK同源,是水稻栽培稻的野生稻O.minuta在以前的研究中获得数据的褐飞虱和稻瘟病抗病因子(Cho等.110你等。

      2007)被选为种植水稻的抗病因素o .马唐基于之前的研究中获得的数据在一个普通野生稻minuta,这是抗稻瘟病和BPH(Cho et al.2005;You et al . 2007)OsMPK3,与OmMPK之间氨基酸序列同源性为99%(数据没有显示)OsMPK3曾有两个不同的名字,OsMPK3,O。

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