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小鼠基因组DNA抽提原理、仪器试剂和操作步骤.docx

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  • 卖家[上传人]:s9****2
  • 文档编号:420999821
  • 上传时间:2023-06-09
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    • 小鼠基因组 DNA 抽提原理、仪器试剂和操作步骤一、原理与意义先用细胞裂解液对已制备好的组织匀浆充分裂解,然后用蛋白酶去除其中的蛋 白,再用氯仿一次抽提(无需用酚抽提)、预备液沉淀、RNase去除RNA、乙醇 再沉淀即可得到完整DNA该方法适用于从人或动物的各种组织、血液、培养细 胞、G+/G-细菌中快速抽提基因组DNA抽提出来的DNA能用于几乎所有的分子 生物学实验,如DNA梯度分析、PCR、限制性内切酶反应、克隆、Southern Blot 分析等二、 试剂及其配制抽提试剂盒购于上海生工公司,内含以下试剂:1、 TE 缓冲液:PH8.0,由 10 mM Tris HCl 和 1 mM EDTA 配成2、 RNase A(3 mg):使用前加入300 ul无菌双蒸水,煮沸10 min后使其自然 冷却后使用,-20 °C冻存3、 Proteinase K (12 mg):使用前加入600 ul无菌水,分装成小份,-20 C冻存4、 Cell Lysis Solution 与 Precipitation Solution:溶液出现絮状沉淀 50 C加热溶 解后使用5、 1.2 mol/L NaCl。

      冰冷乙醇和氯仿自备三、 实验器材水浴锅、普通冰箱、1.5/2 ml离心管、移液器及枪头、紫外分光计、离心管架、 剪刀、镊子、滤纸等四、 操作步骤1、 组织匀浆制备:取30 mg左右新鲜组织,加600 ul TE缓冲液,手工匀浆数 次2、 细胞裂解:吸取300 ul匀浆加600 ul Cell Lysis Solution,混匀3、 消化蛋白:再加入9 ul Proteinase K (可适当增加)混匀,置于55 C水浴30 min以上(可达2.5 h),其间上下混匀几次4、 氯仿抽提:加入600 ul氯仿(用户自备),轻柔上下混匀,不能太剧烈,以保证DNA的完整性5、 沉淀:在台式离心机上,10000转/分,室温离心2 min此时应分成三层, 基因组 DNA 在上层中,如未能分层,表明样品与氯仿未混匀(可通过延长离心 时间或增加离心速度获得上清)取500 ul上清液,置于无菌1.5 ml离心管中, 加入500 ul Precipitation Solution,混匀多次至出现絮状物,室温静置2 min10000 转/分,离心 2 min6、 去除RNA:弃除上清,注意不要倒掉沉淀,立即加入100 ul 1.2 mol/L NaCI, 轻轻振荡直至DNA样品完全溶解,加入3 ul RNase A,置于37 °C 10 min,以去 除 RNA。

      7、 沉淀DNA:加入300 ul冰冷乙醇(终浓度为75%,沉淀效果最佳),-20 C 放置10 min10, 000转/分,离心2 min倒掉乙醇,倒置室温干燥10~15 min 若DNA量多,可再重复沉淀一次DNA用TE缓冲液或100 ul三蒸水溶解五、注意事项1、 应避免多次冻融样品,因为每次冻融都大大降低完整DNA的产率2、 加氯仿充分混匀,若离心后上清不到500 ul,可适当延长离心时间或增加离 心速度3、 吸取DNA上清时,可用剪刀稍剪枪头尖部,以防止虹吸现象4、 操作步骤中许多数值可进行成比例改变,如上清与预备液按 1: 1,氯化钠 与无水乙醇按1: 3等5、 转录活性很高的组织或细菌中通常含有大量的RNA,他们可能与DNA 一起 被分离出来RNA的存在并不影响PCR反应如果需要制备RNA- free的基因组 DNA可在第6步加入200 ul的RNase A,37 C保温10 min即可6、 用分光光度计测量DNA含量按1 OD260=50 mg基因组DNA;进行0.7%琼脂 糖凝胶电泳判定DNA的完整性,也可以判定样品中是否有RNA本试剂盒可抽 提长抵达50kb以上的DNA。

      一般在DNA样品,0D260/0D280比值大于1.8,可 能存在RNA; OD260/OD280比值小于1.6,可能存在蛋白质或酚但RNA样品中 OD260/OD280比值小于2可能存在蛋白质或酚,均需要进一步纯化7、 通常50ul体系PCR反应中用1~5 ul DNA。

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