高等生化实验报告:蛋白质分子量的测定.docx
9页实验一 蛋白质分子量的测定—凝胶层析法一、原理凝胶层析法也称分子筛层析法,是利用具有一定孔径大小的多孔 凝胶作固定相的层析技术当混合物随流动相经过凝胶层析柱时,其 中各组分按其分子大小不同而被分离的技术该法设备简单、操作方 便、重复性好、样品回收率高凝胶是一种不带电的具有三维空间的多孔网状结构、呈珠状颗粒 的物质,每个颗粒的细微结构及筛孔的直径均匀一致,像筛子,小的 分子可以进入凝胶网孔,而大的分子则排阻于颗粒之外当含有分子 大小不一的蛋白质混合物样品加到用此类凝胶颗粒装填而成的层析 柱上时,这些物质即随洗脱液的流动而发生移动大分子物质沿凝胶 颗粒间隙随洗脱液移动,流程短,移动速率快,先被洗出层析柱;而 小分子物质可通过凝胶网孔进入颗粒内部,然后再扩散出来,故流程 长,移动速度慢,最后被洗出层析柱,从而使样品中不同大小的分子 彼此获得分离若分子大小介于上述完全排阻或完全渗入凝胶的物 质,则居二者之间从柱中流出总之,各种不同相对分子质量的蛋白 质分子,最终由于它们被排阻和扩散的程度不同,在凝胶柱中所经过 的路程和时间也不同,从而彼此可以分离开来将凝胶装在柱后,柱床体积称为“总体积”以Vt表示。
实质上 Vt是由Vo, Vi与Vg三部分组成,Vo称为“孔隙体积”或“外水体 积”,即存在于柱床内凝胶颗粒外面空隙之间的水相体积,相应于一 般层析法中柱内流动相的体积;Vi为内体积,即凝胶颗粒内部所含水 相的体积Vg为凝胶本身的体积洗脱体积(Ve)与Vo与Vi之间 的关系可用下式表示:Ve二Vo+KdVi式中 Ve 为洗脱体积,自加入样品时算起,到组分最大浓度(峰) 出现时所流出的体积;Kd为样品组分在二相间的分配系数,也可以 说 Kd 是分子量不同的溶质在凝胶内部与外部的分配系数它只与被 分离的物质分子的大小和凝胶颗粒孔隙的大小分布有关,而与柱的长 度粗细无关,也就是说它对每一物质为常数,与柱的物理条件无关 Kd可通过实验求得,上式可以改写为:Kd=(Ve-Vo)/Vi上式中Ve为实际测得的洗脱体积;Vo可用不被凝胶滞留的大分 子物质的溶液(最好是有颜色以便于观察,如血红蛋白,印度黑墨水, 分子量约 200万的蓝色葡聚糖-2000 等)通过实际测量求得; Vi 可由 gXWr求得(g为干胶重量,单位为克;Wr为凝胶的“吸水量”以 毫升每克表示)因此,对一层析柱胶床来说,只要通过实际实验得 知某一物质的洗脱体积就可算出它的Kd值。
如果假定蛋白质分子近于球形,同时没有显著的水合作用,则不 同大小分子量的蛋白质,在洗脱时峰的位置和该物质相对分子质量有 直接的定量的关系在一根凝胶柱中,凝胶颗粒间空隙所含水相体积 为外水体积Vo,不能进入凝胶孔径的那些大分子,当洗脱体积为Vo 时,出现洗脱峰凝胶颗粒内部孔穴的总体积为内水体积Vi,能全部渗入凝胶的那些小分子,当洗脱体积为Vo+Vi时,出现洗脱峰Ve与分子量的关 系:对同一类型的化合物,洗脱特性与组分的分子量有关,流过凝胶 柱时,按分子量大小顺序流出,分子量大的走在前面 Ve 与分子量 的关系可用下式表示:Ve二K1-K2logM,式中M为相对分子质量,K1 和K2为常数,Ve也可用Ve-Voo二、 仪器和试剂1. 标准蛋白质:蓝色葡聚糖-2000 (200KD)、牛血清蛋白(67KD)、胃蛋 白酶(36KD)、CytC(13.7KD)等,均为分析纯2. 仪器:层析柱核酸蛋白检测器(或紫外分光光度计)、自动部分收集 器、刻度管3. 试 剂 : 蓝 色 葡 聚 糖 2000 、 SephardexG-75 、 洗 脱 液 :0.2mol/LTris-HCL-KCL,PH7.5o三、 实验步骤测定蛋白质的分子量根据需要可选用 SephadexG-75、 G-100 或G-150 型凝胶,凝胶颗粒一般在 40—120 微米,柱管选用直径1.0-1.3cm,高 90-100cm。
1•标准曲线的制定:层析柱用1.2< 100cm,凝胶用SephadexG-75 或 G-100o(1)蛋白质标准样品混合液:分别称取 4mg 蓝色葡聚糖-2000 (200KD)、牛血清蛋白(67KD)、胃蛋白酶(36KD)、CytC(13.7KD)共同 溶于 2ml PH7.5 0.025mol/L Tris-Hcl 缓冲液中 2 )上柱和洗脱:将标准样品混合液上柱,然后用 PH7.5 0.025mol/L Tris-Hcl缓冲液洗脱,流速15d/min, 2ml/管,用部分收集 器收集,紫外检测仪 280nm 出检测,或收集后用紫外分光光度仪于 280nm 出测定每管 OD 值,以管号(或洗脱体积)为横坐标, 0D 值 为纵坐标绘出洗脱曲线根据洗脱峰位置量出每种蛋白质的洗脱体积(Ve)然后以蛋白 质分子量的对数(IgM)为横坐标,Ve为纵坐标,作出标准曲线为 了结果可靠,应以同样条件重复1-2 次,取 Ve 平均值作图2.未知数品分子量的测定:完全按照标准曲线的条件操作,根据 紫外线检测的洗脱峰位置,得出体积重复1-2 次,取其平均值,由 标准曲线可查得样品的分子量四、实验结果牛血清蛋白 蓝色葡聚糖-2000Ve(ml)OD值Ve(ml)OD 值00.04100.03920.04120.00640.1640.0056060.00180.0180100.025100.015120.223120.341140.115140.15160.039160.07180.12180.048200200.04ml)OD 值Ve(ml)OD 值00.0270020.02920.00740.02440.02160.02660.01980.02680.018100.031100.076120.039120.185140.131140.252160.304160.215180.315180.118200.676200.077220.105220.057240.042240.047260.02260.034280.07280.025300.05300.013320320.01340.008胃蛋白酶Cytc作出洗脱曲线:牛血清白蛋白蓝色葡聚糖-2000图表标题胃蛋白酶图表标题Cytc图表标题绘出标准曲线如下:标准曲线五、讨论1.从洗脱曲线上可以看出,出现了四个较明显的峰值(实验结果较为理想):OD:0.233(Ve=12ml), 0.341 (Ve=12ml), 0.676 (Ve=20ml), 0.252 (Ve=14ml),分别对照试验中所加样的四种蛋白质。
由于分子量大的 先洗脱出来,小分子量的蛋白后洗脱出来,因此洗脱顺序是蓝色葡聚 糖-2000(200KD),牛血清白蛋白(67KD),胃蛋白酶(36KD), Cytc(13.7KD)可能由于洗脱体积间差距较小,且每管体积为整数,导 致牛血清蛋白和胃蛋白酶之间洗脱体积差距未能体现出来 2.有标准曲线可以看出胃蛋白酶峰值出现的体积与其它三种样品差 距较大,不太符合正常规律,猜测可能是由于实验过程中的操作不规 范造成的另外实验过程中,可能由于加样时凝胶柱上层部分遭到轻 微破坏,导致部分数据不太准确。

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