第七节-pubmed剖析..ppt

1,常用外文医学文献数据库,书目型 数据库,MEDLINE（PubMed/OVID）,全文型 数据库,,ScienceDirect（部分免费） MEDLINE With Full text@Ebscohost SpringerLink（部分免费，医学及生物类15万篇） OVID full-text database,1. MEDLINE研制开发单位：NLM 2.数据库类型：西文生物医学书目型文献数据库，世界上著名的生物医学文献数据库 3.标引依据：MeSH词表 4.回溯期：1948年 5.语种：39个，大约90%用英文发表 6.文献类型：大多数是学术期刊，5516种期刊，2300万篇文献，还有少数报纸、通讯等文献类型,一、MEDLINE概 况,,,7. MEDLINE内容构成（1965-） 美国《医学索引》 (Index Medicus, IM) 《牙科文献索引》 (Index to Dental Literature) 《国际护理索引》 (International Nursing Index) 另：OLDMEDLINE（1948-1965） 《累积医学索引》（CIM） 《现期医学文献目录》（CLML）,一、MEDLINE,学科范围：,生物医学和卫生保健 生命科学、行为科学、化学、生物工程、基础研究、临床护理、公共卫生、卫生政策等,一、MEDLINE,8.检索平台 光盘版 如SliverPlatter（银盘版）、 Cambridge、Dialog 等 网络版 如PubMed、OVID、EBSCO、 WOK、CSA 等,一、MEDLINE,各版本数据相同，但处理方式、检索规则有差异,二、PubMed数据库,（一） 数据库概况 （二） 检索方法 （三） 检索结果的管理 （四） 个性化服务,1.研制单位：美国国立医学图书馆(NLM)下属的国 家生物技术信息中心（NCBI），1997年6月26日，美国副总统戈尔宣布免费开放 2.数据库类型：书目型文献数据库，MEDLINE数据 的网络版 3. 回溯期：1948年 4. 是NCBI的生物医学信息检索系统Entrez的一个组成部分。

2019/10/20,7,（一）Pubmed数据库概况,5.PubMed的数据构成,（1）MEDLINE数据:Pubmed数据的主体部分 [PubMed-index for medline] （2）PreMEDLINE ：NLM正在加工、评审和标引的数据 [PubMed-in process] （3）Publisher Supplied Citations: 出版商直接提供、超出MEDLINE收录范围的数据 [Pubmed-as supplied by publisher]、[PubMed] （4）OLDMEDLINE：1946-1965，尚未完成MeSH词更新而未转入MEDLINE的部分 [PubMed- OLDMEDLINE],（二）PubMed的检索方法 1.基本检索 2.高级检索 3.主题检索 4.期刊检索 5.其他功能 6.辅助功能--限定检索,,10,一个或多个自由词(自动转化匹配，ATM) 著者 刊名 布尔逻辑运算式：AND、OR、NOT，须大写，运算顺序：左→右，括号内优先 截词检索：截词符：仅有*，代表0到任意个字符，不限于单词，仅限于600种变化形式，不进行词汇的自动转换。

字段检索：字段限定符：[ ]，例如 hypertension[TI] ，81个字段（可检索字段47个）不进行词汇的自动转换 强制检索：“ ”不进行词汇的自动转换,1.基本检索,11,检索原理： 自动词语匹配（Automatic Term Mapping，ATM）技术，将用户输入的检索词依次到主题词转换表、刊名转换表、作者全称转换表、作者索引表、项目负责人或协助者姓名全称表和项目负责人或协助者姓名索引表六个词表中去匹配和转换1. 基本检索,,Automatic Term Mapping (ATM)： PubMed对输入检索框中的检索词进行智能化地校对，将其逐步地与其数据库中的各类术语匹配,MeSH Translation Table 主题词转换表,Journals Translation Table 刊名转换表,Full Author Translation Table 作者全称转换表,Author Index 作者索引表,No Mapping,,,,检索词拆分AND,Full investigator （Collaborator） Translation Table 项目负责人或协助者姓名全称表,Investigator（Collaborator）Index 项目负责人或协助者姓名索引表,13,作者姓名书写格式,西方人姓名书写格式：first name、Middle Name、last name（名＋姓） 美国总统名为： John Frank Kenedy Kenedy为 last name、surname （姓） Frank为 middle name John为first name （名） 输入格式：姓在前用全称，名在后取首字母，中间留空格 例： Kenedy JF 或 Kenedy J Zhong NS 注：2002年以后的文献可利用作者全称检索。

14,在早年的文献中，没有ISSN号 如果杂志全名中包括括弧或方括号，键入时应该予以取消， 中文期刊，用拼音 Nan fang yi ke da xue xue bao Beijing da xue xue bao Zhonghua nei ke xue za zhi,期刊检索,15,,2. 高级检索（Advanced Search） （1）构建检索式（Search Builder） （2）检索历史（Search History）,16,（2）检索历史（Search History）,检索历史的回顾 逻辑组合检索表达式，删除检索式，查看Details，获将检索式保存到My NCBI 注：最多可保存100条检索史，可保存8小时； 相同的检索式会被合并，显示在最上面3.主题检索 （MeSH Database） 举例：检索有关心力衰竭的诊断或药物疗法方面的文献 Major Topic：心力衰竭（Heart Failure） Other Topic：诊断（diagnosis）、药物疗法（drug therapy）,18,4. 期刊数据库 （Journals in NCBI Databases） 1. 提供刊名缩写和刊名全称的转换查询。

2.输入刊名、缩写名、ISSN号、NLM刊号、国际标准刊名缩写（ISO Abbreviation）、刊名中含有的词等浏览期刊文献5.其他检索 （1）临床咨询 （2）特定文献检索,5.其他检索,（1）临床咨询 专门为临床医生和临床试验工作者设计的检索服务 ① Clinical Study Categories ② Systematic Reviews ③ Medical Genetics,（2）特定文献检索 根据已知文献的某项特征（篇名，著者姓名，刊名等），检索该特定文献的详细信息 1.单篇引文匹配（Single Citation Matcher） 2.批量引文匹配（Batch Citation Matcher）,5.其他检索,,6. 限定检索 PubMed设置了过滤器（Filters），供用户对检索结果按不同条件进行筛选筛选条件有：文献类型（article types）、出版日期（publication dates）、期刊类别（journal categories）、字段限定（search fields）等限定检索,（1）文献类型 （2）文本选择 （3）同行评议 （4）日期限定 （5）实验或研究对象 （6）语种限定 （7）性别限定 （8）学科类别限定 （9）期刊类型限定 （10）年龄限定 （11）字段限定,临床试验 Meta分析 实践指南 随机对照试验 综述,,,临床期刊 牙科期刊 MEDLINE收录 护理学期刊,（三）PubMed的输出功能 1.检索结果的显示 2.检索结果的保存及其他输出方式,1.检索结果显示,（1）显示格式：Summary基本格式、Abstract摘要格式、Medline格式、XML格式、PMID list 格式 （2）每页显示数量:5,10,20,50,100,200 （3）结果排序:最新更新，最相关，出版日期，第一作者，最后作者，刊名，篇名。

26,Format（显示格式),Summary（Summary text）：默认格式，包括作者、团体作者、篇名（非英文篇名英译后加方括号）、文献来源、综述（文献类型）、非英文文献的原文语种、“无文摘”注释、PMID、评论/校正链接、数据加工状态、免费全文提示 Abstract（Abstract text） ： Summary加文摘、著者单位、地址 MEDLINE : 最完整，有字段标识符,27,Send to,File：所有记录文本格式，用对话框保存 Email: 通过邮件发送 Clipboad： 剪贴板：暂时存放选定的记录，检索 后一起保存允许存储500条记录，保存8 小时 Collection：My NCBI个性化服务的一部分 My Bibliography：My NCBI个性化服务的一部分 Order：订阅全文,,28,（2） 全文输出,PubMed Central（PMC）： PMC是NCBI开发的免费电子期刊全文数据库 期刊网站提供的免费全文,29,两种全文格式的区别,HTML格式 丰富的链接，更多的资源 图表放大 可使用词典 格式不规范，篇幅大 PDF格式 国际标准格式，格式规范 篇幅小，美观，易于携带,四、个性化服务（My NCBI）,My NCBI是NCBI在其检索平台上为用户免费提供的个性化服务 保存检索式（Saved Searches） 保存检索结果（Collections） 个人文献目录（My Bibliography）,。